Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PN62

Protein Details
Accession A0A1D8PN62    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-69KIRSDLSRDRKWKPQKIEKKIASTKVKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-61RKWKPQKIEKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 11.499, cyto_mito 11.332, mito_nucl 7.165, mito 6.5, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:1990481  P:mRNA pseudouridine synthesis  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG cal:CAALFM_C501180WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MNGVFAVYKPSGITSAKFIERIQNKFTKSEVFAKDLQEMKDKIRSDLSRDRKWKPQKIEKKIASTKVKIGHGGTLDPLASGILVVGVGLGTKKLQYYLAECQKTYETKALLGISTTTGDSEGEIVSKNKIDHITSELIDSTVEKFIGDIKQTPPIFSALKVNGKPLYEYARKGLSLPTNIKVRDVTVNNITVVKEDSLKTDHEFTKLESELDENGVPKEHGLKDNPTLNDSPLFFSKQYLEKAEKEGLPKETGKPKLLADDESLPEKLPMIHFISDVSSGTYIRSLISDIGRAMESSAYMVELIRTKQSEWELGKNVFKFEDFEKDERIWGPVLKKVFEKGGAEIQDLDKEFEEVAKTVEFSVTKETKESTSETIPQKRSIDEVEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.26
3 0.28
4 0.3
5 0.29
6 0.35
7 0.41
8 0.44
9 0.47
10 0.48
11 0.48
12 0.48
13 0.49
14 0.46
15 0.44
16 0.48
17 0.45
18 0.42
19 0.43
20 0.43
21 0.48
22 0.46
23 0.44
24 0.42
25 0.4
26 0.39
27 0.42
28 0.41
29 0.37
30 0.41
31 0.41
32 0.42
33 0.5
34 0.55
35 0.58
36 0.65
37 0.67
38 0.69
39 0.78
40 0.79
41 0.79
42 0.81
43 0.82
44 0.85
45 0.9
46 0.87
47 0.87
48 0.85
49 0.84
50 0.81
51 0.74
52 0.7
53 0.66
54 0.61
55 0.54
56 0.47
57 0.42
58 0.34
59 0.31
60 0.26
61 0.2
62 0.18
63 0.14
64 0.13
65 0.08
66 0.07
67 0.05
68 0.04
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.02
73 0.02
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.09
82 0.1
83 0.15
84 0.24
85 0.33
86 0.35
87 0.35
88 0.36
89 0.38
90 0.38
91 0.36
92 0.31
93 0.23
94 0.21
95 0.24
96 0.22
97 0.18
98 0.17
99 0.15
100 0.11
101 0.11
102 0.1
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.08
112 0.09
113 0.11
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.19
120 0.2
121 0.18
122 0.19
123 0.16
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.1
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.1
133 0.12
134 0.12
135 0.14
136 0.14
137 0.22
138 0.22
139 0.23
140 0.21
141 0.21
142 0.21
143 0.18
144 0.22
145 0.19
146 0.25
147 0.24
148 0.26
149 0.25
150 0.25
151 0.25
152 0.22
153 0.25
154 0.22
155 0.23
156 0.23
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.24
161 0.21
162 0.23
163 0.24
164 0.26
165 0.29
166 0.29
167 0.29
168 0.25
169 0.23
170 0.24
171 0.22
172 0.21
173 0.19
174 0.2
175 0.19
176 0.2
177 0.18
178 0.13
179 0.13
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.12
186 0.13
187 0.17
188 0.17
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.14
196 0.14
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.09
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.16
209 0.19
210 0.23
211 0.29
212 0.29
213 0.27
214 0.26
215 0.24
216 0.24
217 0.22
218 0.2
219 0.16
220 0.18
221 0.15
222 0.16
223 0.18
224 0.2
225 0.21
226 0.23
227 0.26
228 0.25
229 0.29
230 0.31
231 0.3
232 0.29
233 0.3
234 0.28
235 0.28
236 0.28
237 0.3
238 0.34
239 0.36
240 0.35
241 0.34
242 0.32
243 0.34
244 0.34
245 0.31
246 0.25
247 0.26
248 0.25
249 0.25
250 0.25
251 0.19
252 0.18
253 0.16
254 0.14
255 0.11
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.15
262 0.15
263 0.14
264 0.12
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.09
282 0.08
283 0.07
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.09
290 0.11
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.2
295 0.22
296 0.28
297 0.29
298 0.34
299 0.36
300 0.39
301 0.44
302 0.4
303 0.4
304 0.33
305 0.3
306 0.26
307 0.23
308 0.29
309 0.28
310 0.3
311 0.33
312 0.33
313 0.35
314 0.33
315 0.33
316 0.25
317 0.24
318 0.24
319 0.25
320 0.27
321 0.26
322 0.28
323 0.28
324 0.3
325 0.3
326 0.3
327 0.28
328 0.33
329 0.32
330 0.31
331 0.3
332 0.28
333 0.28
334 0.27
335 0.25
336 0.19
337 0.18
338 0.17
339 0.16
340 0.17
341 0.13
342 0.14
343 0.13
344 0.13
345 0.13
346 0.16
347 0.15
348 0.14
349 0.23
350 0.24
351 0.24
352 0.26
353 0.28
354 0.27
355 0.29
356 0.31
357 0.27
358 0.3
359 0.37
360 0.44
361 0.51
362 0.53
363 0.56
364 0.55
365 0.51
366 0.49