Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CDR1

Protein Details
Accession I1CDR1    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-85DSHQQPRRAVTTRKKWPNMKYLGSCHydrophilic
115-137HQQGDKKKTVKRVEKRGAGKAKGBasic
438-461KMISLRRERRMQREKRDRERQAEABasic
463-486EMEKTERESKKQKRQERSGPDTSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-137KKKTVKRVEKRGAGKAKG
443-457RRERRMQREKRDRER
472-474KKQ
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSSSALIAAKKRVENSLRKFEIPTQEDAEEVKDDKSGTLYLSLLQSRLNWATAVFAKYKPDSHQQPRRAVTTRKKWPNMKYLGSCRLHVGPHLFEDTAFYEASRSERWTDIVAAHQQGDKKKTVKRVEKRGAGKAKGPPTTQGSDHSSPVSSTEETTDLESSLASSSEERPTTVAQPDAAEQNEGQDAESERLVWTDIVFELKEVPSERYVFPKESLISIETESSQLRASFALPLNPDMADGFFDTPTNKILKYGSHCNMEYVQHILTTEKQDAKLTYDRYEPVNLLLSNVNAEITEGLKAVLDDPKEVKKRLSLKATLFPPKRYIQYSSNSKMNEIETLLNRILTVPDIITGPIMAEKKRNEILNAIKLGKRERDEKFEAELPKTKLPGVRDESMLRCAYCSTKYTTMWRSGPEGHGTLCNSCGLQWKRGEILEGAKMISLRRERRMQREKRDRERQAEALEMEKTERESKKQKRQERSGPDTSFLDVVRGMDGMSHFAAQLIQQRQNKKAVAASHELAQSLPACTLASNPPPSLSTSPAPLSSMPAAVSPASTLSQSAQSYSLYSAGGIPLPTLSIDFGGALVFSHPNCGITLLDSFFSIRLCKDGHEQTMVQLDKKELADATFNVLNEGDLQNPREVLKMTIATEPKTITAYGNTALIDRQHPITVRFLEKLDPSGGAVVQRILQRWLITFPQPSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.6
3 0.65
4 0.63
5 0.62
6 0.63
7 0.61
8 0.63
9 0.56
10 0.53
11 0.46
12 0.42
13 0.41
14 0.38
15 0.34
16 0.26
17 0.24
18 0.19
19 0.16
20 0.16
21 0.16
22 0.17
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.19
29 0.2
30 0.18
31 0.18
32 0.18
33 0.21
34 0.23
35 0.21
36 0.17
37 0.16
38 0.2
39 0.23
40 0.26
41 0.23
42 0.23
43 0.27
44 0.3
45 0.34
46 0.34
47 0.4
48 0.46
49 0.54
50 0.63
51 0.66
52 0.73
53 0.74
54 0.76
55 0.74
56 0.74
57 0.74
58 0.74
59 0.77
60 0.78
61 0.83
62 0.84
63 0.84
64 0.85
65 0.82
66 0.8
67 0.78
68 0.77
69 0.78
70 0.72
71 0.64
72 0.58
73 0.53
74 0.45
75 0.4
76 0.35
77 0.28
78 0.28
79 0.3
80 0.26
81 0.22
82 0.24
83 0.22
84 0.19
85 0.16
86 0.13
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.17
93 0.19
94 0.2
95 0.22
96 0.22
97 0.21
98 0.24
99 0.25
100 0.24
101 0.24
102 0.25
103 0.27
104 0.32
105 0.34
106 0.35
107 0.37
108 0.41
109 0.49
110 0.57
111 0.64
112 0.68
113 0.75
114 0.79
115 0.82
116 0.83
117 0.83
118 0.82
119 0.74
120 0.7
121 0.67
122 0.65
123 0.61
124 0.56
125 0.51
126 0.47
127 0.48
128 0.43
129 0.4
130 0.4
131 0.37
132 0.37
133 0.34
134 0.28
135 0.25
136 0.25
137 0.23
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.15
142 0.15
143 0.17
144 0.16
145 0.12
146 0.12
147 0.11
148 0.09
149 0.08
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.1
154 0.15
155 0.16
156 0.16
157 0.17
158 0.19
159 0.21
160 0.22
161 0.21
162 0.16
163 0.17
164 0.18
165 0.2
166 0.18
167 0.16
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.11
178 0.1
179 0.1
180 0.11
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.12
191 0.12
192 0.14
193 0.15
194 0.17
195 0.18
196 0.23
197 0.26
198 0.25
199 0.25
200 0.27
201 0.25
202 0.23
203 0.24
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.12
209 0.13
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.13
218 0.13
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.11
226 0.1
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.15
240 0.2
241 0.28
242 0.3
243 0.34
244 0.34
245 0.34
246 0.35
247 0.32
248 0.27
249 0.21
250 0.17
251 0.12
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.14
256 0.17
257 0.17
258 0.17
259 0.19
260 0.19
261 0.23
262 0.26
263 0.25
264 0.23
265 0.24
266 0.24
267 0.25
268 0.25
269 0.21
270 0.17
271 0.19
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.1
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.18
294 0.22
295 0.23
296 0.22
297 0.26
298 0.33
299 0.38
300 0.42
301 0.4
302 0.4
303 0.46
304 0.5
305 0.53
306 0.49
307 0.44
308 0.43
309 0.4
310 0.4
311 0.36
312 0.35
313 0.31
314 0.36
315 0.43
316 0.42
317 0.44
318 0.41
319 0.39
320 0.35
321 0.31
322 0.24
323 0.17
324 0.16
325 0.12
326 0.15
327 0.14
328 0.13
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.08
333 0.07
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.04
340 0.04
341 0.07
342 0.08
343 0.08
344 0.12
345 0.13
346 0.16
347 0.2
348 0.2
349 0.18
350 0.22
351 0.26
352 0.27
353 0.29
354 0.27
355 0.26
356 0.27
357 0.29
358 0.28
359 0.26
360 0.28
361 0.28
362 0.33
363 0.36
364 0.36
365 0.37
366 0.38
367 0.38
368 0.33
369 0.37
370 0.32
371 0.3
372 0.29
373 0.27
374 0.25
375 0.24
376 0.29
377 0.28
378 0.27
379 0.27
380 0.29
381 0.29
382 0.3
383 0.29
384 0.21
385 0.17
386 0.16
387 0.15
388 0.15
389 0.15
390 0.16
391 0.19
392 0.21
393 0.26
394 0.29
395 0.33
396 0.33
397 0.33
398 0.31
399 0.3
400 0.3
401 0.27
402 0.24
403 0.19
404 0.19
405 0.19
406 0.16
407 0.14
408 0.13
409 0.1
410 0.1
411 0.18
412 0.18
413 0.23
414 0.24
415 0.24
416 0.26
417 0.26
418 0.27
419 0.19
420 0.19
421 0.17
422 0.16
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.16
428 0.21
429 0.22
430 0.28
431 0.36
432 0.41
433 0.52
434 0.62
435 0.67
436 0.71
437 0.78
438 0.83
439 0.85
440 0.9
441 0.86
442 0.82
443 0.78
444 0.71
445 0.62
446 0.55
447 0.45
448 0.36
449 0.3
450 0.24
451 0.18
452 0.15
453 0.15
454 0.18
455 0.19
456 0.24
457 0.34
458 0.43
459 0.54
460 0.63
461 0.7
462 0.73
463 0.81
464 0.85
465 0.85
466 0.84
467 0.82
468 0.74
469 0.67
470 0.58
471 0.49
472 0.41
473 0.3
474 0.23
475 0.13
476 0.12
477 0.1
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.07
486 0.08
487 0.08
488 0.08
489 0.16
490 0.18
491 0.25
492 0.3
493 0.35
494 0.38
495 0.44
496 0.44
497 0.38
498 0.37
499 0.34
500 0.35
501 0.36
502 0.33
503 0.31
504 0.31
505 0.29
506 0.25
507 0.22
508 0.17
509 0.13
510 0.12
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.1
515 0.13
516 0.18
517 0.2
518 0.21
519 0.21
520 0.22
521 0.26
522 0.26
523 0.25
524 0.21
525 0.22
526 0.23
527 0.23
528 0.24
529 0.2
530 0.21
531 0.18
532 0.17
533 0.14
534 0.13
535 0.13
536 0.12
537 0.11
538 0.08
539 0.09
540 0.08
541 0.08
542 0.09
543 0.09
544 0.14
545 0.14
546 0.15
547 0.15
548 0.14
549 0.15
550 0.16
551 0.15
552 0.1
553 0.1
554 0.1
555 0.09
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.07
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.06
572 0.07
573 0.07
574 0.1
575 0.1
576 0.11
577 0.12
578 0.13
579 0.11
580 0.12
581 0.14
582 0.12
583 0.13
584 0.12
585 0.13
586 0.12
587 0.13
588 0.12
589 0.1
590 0.12
591 0.12
592 0.14
593 0.21
594 0.27
595 0.3
596 0.33
597 0.33
598 0.32
599 0.4
600 0.39
601 0.34
602 0.29
603 0.27
604 0.27
605 0.27
606 0.26
607 0.18
608 0.18
609 0.2
610 0.19
611 0.23
612 0.21
613 0.21
614 0.2
615 0.19
616 0.18
617 0.17
618 0.17
619 0.16
620 0.17
621 0.19
622 0.19
623 0.2
624 0.21
625 0.21
626 0.21
627 0.19
628 0.21
629 0.22
630 0.22
631 0.28
632 0.3
633 0.3
634 0.31
635 0.3
636 0.26
637 0.24
638 0.23
639 0.18
640 0.18
641 0.19
642 0.18
643 0.18
644 0.17
645 0.16
646 0.17
647 0.18
648 0.17
649 0.17
650 0.19
651 0.2
652 0.22
653 0.24
654 0.3
655 0.32
656 0.34
657 0.34
658 0.33
659 0.34
660 0.34
661 0.36
662 0.3
663 0.25
664 0.22
665 0.22
666 0.21
667 0.18
668 0.17
669 0.15
670 0.17
671 0.2
672 0.2
673 0.21
674 0.23
675 0.23
676 0.23
677 0.27
678 0.27
679 0.3