Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PMT8

Protein Details
Accession A0A1D8PMT8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-52VTSKDLKTHLQKEKDKEKKRKLRQELKFNALDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-43KEKDKEKKRKLR
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002143  Ribosomal_L1  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:0005762  C:mitochondrial large ribosomal subunit  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG cal:CAALFM_C500030WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MFKYIPARSILPYRTSIRTAVTSKDLKTHLQKEKDKEKKRKLRQELKFNALDNPIDHPLHMPIAKALNILRSLEVGKPADKTTISCNIYVRQEQGAAPISGKVDIPFPVQRKTKPVVFTTQQPVIEELKKAGIETFGGRELLDKFINQELTPDMFTHAFATQEMAPHLKSVARILGRAGLQPTAKKGTITDDVNTILDVMRSFQIKQKENHISFPVGNCTFSDSQIMSNLKAISDEIHSKIDANTTKKTRLGYCYIGTANSPGLVIDFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.42
3 0.39
4 0.35
5 0.38
6 0.36
7 0.35
8 0.37
9 0.37
10 0.36
11 0.41
12 0.4
13 0.4
14 0.47
15 0.53
16 0.55
17 0.6
18 0.67
19 0.69
20 0.78
21 0.82
22 0.84
23 0.85
24 0.87
25 0.88
26 0.92
27 0.93
28 0.93
29 0.93
30 0.93
31 0.93
32 0.9
33 0.86
34 0.8
35 0.7
36 0.63
37 0.54
38 0.45
39 0.35
40 0.31
41 0.28
42 0.24
43 0.22
44 0.2
45 0.19
46 0.21
47 0.2
48 0.16
49 0.14
50 0.17
51 0.17
52 0.17
53 0.16
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.15
58 0.13
59 0.15
60 0.14
61 0.18
62 0.16
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.18
67 0.17
68 0.17
69 0.18
70 0.26
71 0.26
72 0.25
73 0.26
74 0.28
75 0.31
76 0.31
77 0.28
78 0.2
79 0.2
80 0.18
81 0.2
82 0.19
83 0.16
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.12
89 0.09
90 0.08
91 0.09
92 0.12
93 0.16
94 0.18
95 0.24
96 0.27
97 0.28
98 0.32
99 0.35
100 0.37
101 0.36
102 0.35
103 0.35
104 0.34
105 0.38
106 0.37
107 0.37
108 0.33
109 0.29
110 0.29
111 0.26
112 0.25
113 0.2
114 0.16
115 0.13
116 0.13
117 0.12
118 0.1
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.11
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.13
134 0.11
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.12
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.1
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.13
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.17
163 0.16
164 0.17
165 0.17
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.19
170 0.2
171 0.2
172 0.18
173 0.18
174 0.2
175 0.25
176 0.26
177 0.23
178 0.21
179 0.22
180 0.22
181 0.21
182 0.16
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.1
189 0.11
190 0.15
191 0.23
192 0.28
193 0.3
194 0.38
195 0.47
196 0.48
197 0.52
198 0.51
199 0.45
200 0.42
201 0.42
202 0.4
203 0.31
204 0.29
205 0.24
206 0.27
207 0.25
208 0.24
209 0.25
210 0.18
211 0.18
212 0.24
213 0.25
214 0.19
215 0.22
216 0.22
217 0.18
218 0.18
219 0.18
220 0.13
221 0.16
222 0.19
223 0.18
224 0.2
225 0.2
226 0.2
227 0.21
228 0.26
229 0.29
230 0.29
231 0.36
232 0.39
233 0.43
234 0.45
235 0.49
236 0.47
237 0.47
238 0.5
239 0.47
240 0.44
241 0.45
242 0.43
243 0.39
244 0.35
245 0.3
246 0.25
247 0.19
248 0.17
249 0.11