Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S108

Protein Details
Accession E3S108    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-50SRDTPRDRDDRGDRRRRRSRSPRHGGGGGGBasic
101-120DSYSRRDRPRDRDRDEDRGHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-54RGDRRRRRSRSPRHGGGGGGGGGG
84-158ERRDDRGERGGERGGWGDSYSRRDRPRDRDRDEDRGHRRERGGERNERGGDRFGGEDRRGGRGGRDGGFGGGRDR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR006529  U2AF_lg  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG pte:PTT_15819  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12232  RRM3_U2AF65  
Amino Acid Sequences MNGDSYSRDGGRSSGSRNYSSRDTPRDRDDRGDRRRRRSRSPRHGGGGGGGGGGGSRRDYEVDTYSSSRDYREREREDTYARRERRDDRGERGGERGGWGDSYSRRDRPRDRDRDEDRGHRRERGGERNERGGDRFGGEDRRGGRGGRDGGFGGGRDRMRQQKEESPPFNKPREATPDLASFTNILQRPRRMTQWDIKPAGYENITAEQAKLSGMFPLPGAPRAAPMDPSKLAAFISPSAGTATAAALATSAAKQSKRLYVHNLPSGCTSQEIMEFFNNQLNGLNVVSGNDPCLSAHIATSKEYAALEFKAPEDATLALAMNGISMRDEGGAPDRSGLSIRRPKDYITPTADENAYPPGDEVSSVVKDSPNKLSIVNIPTYIEEEQIRELVETMGKLKAFILVKDTGTDQHRGIAFCEYADNEIIDAVIEGLNDIPLGDGNLKVSRATVGLQQSTGLDGGVGAISMLAGASAAENHEHSRVVCLMNMVTSDELLNDDEYEEIKEDIEEECGKYGPIVETKIPRPAGARVNLGVGKIYIKYQDTESAQKAIKALAGRQFSRRTVVATEFSEEGFDVDAW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.36
3 0.41
4 0.43
5 0.47
6 0.46
7 0.51
8 0.55
9 0.57
10 0.6
11 0.61
12 0.69
13 0.71
14 0.68
15 0.7
16 0.71
17 0.72
18 0.75
19 0.8
20 0.79
21 0.82
22 0.89
23 0.88
24 0.88
25 0.89
26 0.9
27 0.9
28 0.91
29 0.89
30 0.86
31 0.8
32 0.7
33 0.61
34 0.52
35 0.41
36 0.3
37 0.2
38 0.13
39 0.1
40 0.1
41 0.08
42 0.06
43 0.07
44 0.08
45 0.09
46 0.11
47 0.15
48 0.18
49 0.21
50 0.24
51 0.25
52 0.25
53 0.27
54 0.26
55 0.25
56 0.27
57 0.31
58 0.37
59 0.45
60 0.5
61 0.52
62 0.57
63 0.59
64 0.61
65 0.63
66 0.62
67 0.62
68 0.6
69 0.61
70 0.62
71 0.64
72 0.66
73 0.68
74 0.66
75 0.63
76 0.69
77 0.67
78 0.62
79 0.6
80 0.52
81 0.42
82 0.37
83 0.31
84 0.22
85 0.18
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.25
90 0.3
91 0.35
92 0.4
93 0.49
94 0.57
95 0.64
96 0.71
97 0.74
98 0.75
99 0.78
100 0.79
101 0.81
102 0.79
103 0.79
104 0.76
105 0.75
106 0.72
107 0.68
108 0.63
109 0.62
110 0.63
111 0.63
112 0.63
113 0.64
114 0.65
115 0.67
116 0.67
117 0.6
118 0.54
119 0.46
120 0.38
121 0.3
122 0.27
123 0.22
124 0.24
125 0.23
126 0.25
127 0.24
128 0.27
129 0.26
130 0.25
131 0.24
132 0.25
133 0.29
134 0.26
135 0.26
136 0.22
137 0.22
138 0.23
139 0.21
140 0.16
141 0.17
142 0.15
143 0.16
144 0.21
145 0.28
146 0.32
147 0.36
148 0.4
149 0.44
150 0.54
151 0.61
152 0.62
153 0.59
154 0.64
155 0.67
156 0.66
157 0.6
158 0.51
159 0.48
160 0.5
161 0.49
162 0.43
163 0.39
164 0.38
165 0.37
166 0.36
167 0.3
168 0.22
169 0.18
170 0.22
171 0.2
172 0.21
173 0.24
174 0.28
175 0.33
176 0.35
177 0.4
178 0.38
179 0.42
180 0.47
181 0.52
182 0.57
183 0.54
184 0.51
185 0.47
186 0.43
187 0.39
188 0.31
189 0.22
190 0.14
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.11
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.11
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.15
214 0.18
215 0.17
216 0.19
217 0.17
218 0.15
219 0.15
220 0.13
221 0.12
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.07
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.06
239 0.07
240 0.08
241 0.1
242 0.13
243 0.19
244 0.22
245 0.24
246 0.31
247 0.36
248 0.42
249 0.45
250 0.43
251 0.38
252 0.36
253 0.35
254 0.27
255 0.2
256 0.15
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.12
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.07
284 0.09
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.05
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.11
321 0.11
322 0.1
323 0.12
324 0.13
325 0.17
326 0.23
327 0.24
328 0.28
329 0.29
330 0.3
331 0.37
332 0.4
333 0.37
334 0.36
335 0.36
336 0.33
337 0.35
338 0.34
339 0.25
340 0.22
341 0.18
342 0.13
343 0.11
344 0.1
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.13
355 0.16
356 0.19
357 0.18
358 0.18
359 0.18
360 0.2
361 0.23
362 0.24
363 0.23
364 0.19
365 0.18
366 0.17
367 0.2
368 0.18
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.14
386 0.14
387 0.14
388 0.17
389 0.17
390 0.17
391 0.18
392 0.19
393 0.18
394 0.2
395 0.22
396 0.18
397 0.2
398 0.22
399 0.21
400 0.22
401 0.21
402 0.18
403 0.16
404 0.17
405 0.13
406 0.13
407 0.13
408 0.11
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.06
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.03
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.08
428 0.1
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.1
433 0.11
434 0.12
435 0.15
436 0.18
437 0.18
438 0.18
439 0.18
440 0.18
441 0.18
442 0.17
443 0.11
444 0.06
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.04
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.03
453 0.03
454 0.02
455 0.02
456 0.02
457 0.02
458 0.03
459 0.04
460 0.05
461 0.07
462 0.08
463 0.1
464 0.11
465 0.11
466 0.14
467 0.16
468 0.16
469 0.16
470 0.16
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.13
475 0.11
476 0.1
477 0.09
478 0.08
479 0.09
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.08
484 0.08
485 0.09
486 0.1
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.12
494 0.13
495 0.12
496 0.14
497 0.14
498 0.14
499 0.13
500 0.15
501 0.15
502 0.17
503 0.19
504 0.23
505 0.3
506 0.33
507 0.4
508 0.39
509 0.37
510 0.36
511 0.39
512 0.42
513 0.4
514 0.41
515 0.34
516 0.39
517 0.39
518 0.36
519 0.3
520 0.23
521 0.2
522 0.17
523 0.18
524 0.16
525 0.17
526 0.19
527 0.2
528 0.27
529 0.29
530 0.35
531 0.36
532 0.38
533 0.38
534 0.38
535 0.36
536 0.3
537 0.29
538 0.25
539 0.27
540 0.29
541 0.35
542 0.36
543 0.42
544 0.47
545 0.46
546 0.48
547 0.44
548 0.4
549 0.37
550 0.4
551 0.38
552 0.34
553 0.36
554 0.31
555 0.3
556 0.27
557 0.23
558 0.18