Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PLA9

Protein Details
Accession A0A1D8PLA9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
114-141EQEQLSLKPPRKKIRKRKTKSSLSQTQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-133KPPRKKIRKRKTK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
IPR027113  Transc_fact_NFYB/HAP3  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0043619  P:regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to oxidative stress  
KEGG cal:CAALFM_C401390WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MSRTNNKNPIDQNWQNNDYEIKEQDRFLPIANVGRVMKKALPEHAKLSKESKECIQECVSEFISFITSQAADRCLVEKRKTLNGEDILWAMYTLGFENYSETLKIYLAKYRQYEQEQLSLKPPRKKIRKRKTKSSLSQTQSKEQVDQDQDFQQIEQQYDDGEEEEEESENEEGDMSNIESNLILQNLPEYSDDYFDDEDEEEDRQQQREENSDNEPQQHHGDDSQPINLQPQLPSSAVPSLPTQQQQQFSDINPTTESNQQESFFTTQYYPNQTQYVNAAPLPTNPQPRQYQNQNQPNNYQNDQRQNDKQRIIPDLLNITNSYSEDEFI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.58
3 0.55
4 0.5
5 0.43
6 0.41
7 0.35
8 0.32
9 0.3
10 0.31
11 0.33
12 0.35
13 0.32
14 0.29
15 0.29
16 0.26
17 0.3
18 0.29
19 0.29
20 0.26
21 0.28
22 0.28
23 0.27
24 0.27
25 0.27
26 0.29
27 0.34
28 0.39
29 0.39
30 0.45
31 0.49
32 0.5
33 0.47
34 0.49
35 0.48
36 0.45
37 0.44
38 0.43
39 0.46
40 0.44
41 0.46
42 0.43
43 0.38
44 0.37
45 0.39
46 0.34
47 0.25
48 0.24
49 0.19
50 0.19
51 0.15
52 0.13
53 0.1
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.11
59 0.12
60 0.14
61 0.19
62 0.25
63 0.28
64 0.32
65 0.35
66 0.42
67 0.45
68 0.45
69 0.46
70 0.42
71 0.4
72 0.36
73 0.32
74 0.24
75 0.21
76 0.18
77 0.11
78 0.08
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.07
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.12
92 0.12
93 0.16
94 0.18
95 0.23
96 0.25
97 0.27
98 0.33
99 0.34
100 0.39
101 0.35
102 0.4
103 0.38
104 0.36
105 0.4
106 0.41
107 0.43
108 0.45
109 0.5
110 0.53
111 0.62
112 0.71
113 0.76
114 0.8
115 0.85
116 0.87
117 0.91
118 0.91
119 0.91
120 0.89
121 0.87
122 0.86
123 0.79
124 0.79
125 0.7
126 0.65
127 0.59
128 0.51
129 0.43
130 0.34
131 0.36
132 0.31
133 0.29
134 0.26
135 0.23
136 0.23
137 0.21
138 0.2
139 0.17
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.04
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.12
190 0.13
191 0.13
192 0.13
193 0.16
194 0.17
195 0.21
196 0.23
197 0.22
198 0.25
199 0.3
200 0.3
201 0.31
202 0.3
203 0.27
204 0.27
205 0.25
206 0.21
207 0.17
208 0.18
209 0.2
210 0.2
211 0.19
212 0.18
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.19
229 0.21
230 0.25
231 0.27
232 0.32
233 0.32
234 0.34
235 0.33
236 0.31
237 0.37
238 0.33
239 0.29
240 0.25
241 0.25
242 0.24
243 0.27
244 0.29
245 0.23
246 0.25
247 0.24
248 0.23
249 0.26
250 0.25
251 0.21
252 0.2
253 0.18
254 0.2
255 0.24
256 0.32
257 0.31
258 0.31
259 0.33
260 0.32
261 0.31
262 0.31
263 0.3
264 0.25
265 0.22
266 0.21
267 0.19
268 0.21
269 0.27
270 0.29
271 0.34
272 0.34
273 0.41
274 0.45
275 0.52
276 0.58
277 0.62
278 0.67
279 0.68
280 0.77
281 0.78
282 0.76
283 0.75
284 0.74
285 0.71
286 0.64
287 0.61
288 0.59
289 0.61
290 0.62
291 0.63
292 0.65
293 0.68
294 0.73
295 0.7
296 0.66
297 0.61
298 0.62
299 0.59
300 0.5
301 0.46
302 0.44
303 0.4
304 0.38
305 0.33
306 0.29
307 0.26
308 0.25
309 0.23