Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CDX3

Protein Details
Accession I1CDX3    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-278LITVGIKKPRPVKKRKADGCISSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-271KKPRPVKKRK
Subcellular Location(s) nucl 22, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
Amino Acid Sequences MSTIFLYEDGYGNVIDENGGPEPMDYIVDQNEFIVETIAIHTEYLVNTVPNEFSLTCPMLLEKPKNEDIHVKKAKPKRSYVRYTVQDKTRFFDLKIEKCMTASAASKQLGILEQLIDGLAKHKATVISFINANPSATVVEVSEHLLKRFHDLKVSRSTVNNFIRRECNLSLKKADFHSIERNSSKKIEERYNWVCKQEKTDMNFLTNCLFLDRSAFDINMKCSRAWSNKGTHAIVTRPTMRTNTTPILGVISASGLITVGIKKPRPVKKRKADGCISSGTVTGHYISFLKTTLDGMDKHPHMKGHYIVMDNVPIHMHENIKKHIDYRGYKCVYLPTCSPELNPIEQFWAVTKNKAKRHRLLQEDTLSKRITEACSSVKQSHFKGFVSHSYPCWDKCRNRQPMQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.07
4 0.1
5 0.09
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.1
10 0.1
11 0.11
12 0.09
13 0.1
14 0.12
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.12
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.07
23 0.07
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.14
39 0.12
40 0.13
41 0.18
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.18
46 0.21
47 0.27
48 0.32
49 0.31
50 0.36
51 0.42
52 0.43
53 0.44
54 0.49
55 0.48
56 0.53
57 0.58
58 0.56
59 0.58
60 0.65
61 0.72
62 0.69
63 0.73
64 0.73
65 0.74
66 0.78
67 0.77
68 0.79
69 0.79
70 0.78
71 0.75
72 0.73
73 0.71
74 0.63
75 0.59
76 0.56
77 0.49
78 0.43
79 0.45
80 0.45
81 0.44
82 0.49
83 0.49
84 0.42
85 0.4
86 0.4
87 0.32
88 0.26
89 0.22
90 0.18
91 0.21
92 0.21
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.17
97 0.16
98 0.14
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.09
110 0.11
111 0.11
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.2
118 0.19
119 0.19
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.09
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.15
133 0.15
134 0.2
135 0.24
136 0.23
137 0.26
138 0.27
139 0.31
140 0.38
141 0.41
142 0.37
143 0.35
144 0.38
145 0.39
146 0.46
147 0.47
148 0.39
149 0.39
150 0.41
151 0.39
152 0.42
153 0.34
154 0.36
155 0.33
156 0.36
157 0.37
158 0.35
159 0.36
160 0.32
161 0.35
162 0.27
163 0.27
164 0.32
165 0.3
166 0.34
167 0.34
168 0.35
169 0.33
170 0.33
171 0.31
172 0.27
173 0.29
174 0.32
175 0.31
176 0.38
177 0.43
178 0.5
179 0.5
180 0.49
181 0.49
182 0.42
183 0.45
184 0.45
185 0.43
186 0.37
187 0.42
188 0.39
189 0.37
190 0.36
191 0.31
192 0.25
193 0.2
194 0.16
195 0.1
196 0.1
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.11
204 0.13
205 0.16
206 0.18
207 0.19
208 0.16
209 0.18
210 0.23
211 0.26
212 0.3
213 0.32
214 0.33
215 0.37
216 0.41
217 0.4
218 0.36
219 0.33
220 0.29
221 0.27
222 0.25
223 0.24
224 0.21
225 0.22
226 0.22
227 0.23
228 0.23
229 0.26
230 0.25
231 0.21
232 0.2
233 0.19
234 0.19
235 0.16
236 0.14
237 0.08
238 0.06
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.05
246 0.08
247 0.12
248 0.14
249 0.18
250 0.27
251 0.37
252 0.46
253 0.56
254 0.63
255 0.7
256 0.8
257 0.84
258 0.83
259 0.81
260 0.75
261 0.69
262 0.6
263 0.51
264 0.41
265 0.34
266 0.26
267 0.19
268 0.15
269 0.12
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.12
281 0.13
282 0.17
283 0.24
284 0.25
285 0.27
286 0.28
287 0.28
288 0.27
289 0.31
290 0.29
291 0.27
292 0.29
293 0.29
294 0.28
295 0.27
296 0.28
297 0.24
298 0.22
299 0.17
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.17
304 0.2
305 0.25
306 0.29
307 0.33
308 0.33
309 0.33
310 0.37
311 0.41
312 0.44
313 0.46
314 0.52
315 0.5
316 0.5
317 0.5
318 0.52
319 0.46
320 0.42
321 0.38
322 0.32
323 0.33
324 0.33
325 0.32
326 0.31
327 0.32
328 0.32
329 0.31
330 0.27
331 0.26
332 0.26
333 0.26
334 0.21
335 0.25
336 0.22
337 0.28
338 0.35
339 0.4
340 0.49
341 0.59
342 0.66
343 0.67
344 0.76
345 0.79
346 0.8
347 0.79
348 0.79
349 0.78
350 0.77
351 0.71
352 0.66
353 0.57
354 0.47
355 0.42
356 0.38
357 0.32
358 0.28
359 0.29
360 0.3
361 0.36
362 0.41
363 0.45
364 0.47
365 0.5
366 0.5
367 0.54
368 0.52
369 0.46
370 0.46
371 0.45
372 0.46
373 0.46
374 0.45
375 0.38
376 0.41
377 0.45
378 0.43
379 0.46
380 0.48
381 0.52
382 0.6
383 0.69