Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CD43

Protein Details
Accession I1CD43    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-346RLGLGHTAEKKKNKRKKKAPEEKKEEKEEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-341EKKKNKRKKKAPEEKKE
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto 10.5, mito_nucl 8.333, cyto_mito 7.833, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
IPR043560  ZGPAT  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045892  P:negative regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MDDNRAAHRILRHVKEQGGCLTALQLAELEKLALAVASEQLMITEHMGLLCRDEAPGGLTFYENLFLDIELLLEQKDSLTPELLHLIEEYQRLKQPFPIGEKCAIPFAWKHDLVLLPAIVADYPSTQDISVMLLTPITPETVPCESYLAGQCQEPCKFHRSHGYVLPAEYTVSYEVLELDSLADQLQNGTHVWYKKKDNGEVWKEAQVIQSMSDSSWRVMNDTGKPYLVELGNIMPIKNLNEKEDKEDEEVENDEEIKNNEEIEKAPNSWGAWQAHTTGFAAKMMKKMGYKEGKGLGIDEQGRVDFVQETAYAQDRRLGLGHTAEKKKNKRKKKAPEEKKEEKEEDTIFGYVNSILAQEKSQQEGAAPKPTSIREAYGVIAKLQSELDKALANWNHARTAYMRNKGTASEGQFLEKFKNAANRAKSLQREMDDLQRYVKQTKEKQDMYKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.56
3 0.55
4 0.5
5 0.42
6 0.37
7 0.31
8 0.27
9 0.22
10 0.18
11 0.15
12 0.11
13 0.1
14 0.11
15 0.11
16 0.09
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.06
27 0.06
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.12
44 0.11
45 0.11
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.14
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.07
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.09
65 0.1
66 0.11
67 0.12
68 0.13
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.13
73 0.13
74 0.14
75 0.17
76 0.17
77 0.17
78 0.22
79 0.23
80 0.24
81 0.27
82 0.3
83 0.33
84 0.39
85 0.42
86 0.41
87 0.43
88 0.43
89 0.4
90 0.37
91 0.31
92 0.25
93 0.21
94 0.23
95 0.27
96 0.26
97 0.25
98 0.26
99 0.26
100 0.26
101 0.26
102 0.19
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.08
107 0.07
108 0.06
109 0.05
110 0.06
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.1
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.16
134 0.18
135 0.16
136 0.15
137 0.16
138 0.18
139 0.21
140 0.24
141 0.23
142 0.23
143 0.27
144 0.27
145 0.29
146 0.37
147 0.36
148 0.38
149 0.4
150 0.44
151 0.39
152 0.38
153 0.36
154 0.26
155 0.22
156 0.18
157 0.13
158 0.08
159 0.07
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.09
178 0.12
179 0.16
180 0.21
181 0.25
182 0.3
183 0.35
184 0.37
185 0.41
186 0.47
187 0.5
188 0.5
189 0.48
190 0.45
191 0.41
192 0.37
193 0.32
194 0.23
195 0.18
196 0.13
197 0.12
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.17
209 0.19
210 0.19
211 0.17
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.14
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.08
223 0.09
224 0.1
225 0.15
226 0.15
227 0.15
228 0.2
229 0.21
230 0.26
231 0.28
232 0.28
233 0.26
234 0.27
235 0.24
236 0.2
237 0.21
238 0.16
239 0.13
240 0.12
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.14
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.19
258 0.17
259 0.16
260 0.16
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.16
265 0.12
266 0.11
267 0.12
268 0.13
269 0.12
270 0.15
271 0.15
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.28
276 0.33
277 0.32
278 0.34
279 0.36
280 0.35
281 0.33
282 0.32
283 0.24
284 0.21
285 0.21
286 0.18
287 0.14
288 0.13
289 0.13
290 0.12
291 0.11
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.08
297 0.09
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.17
302 0.16
303 0.17
304 0.17
305 0.17
306 0.14
307 0.18
308 0.25
309 0.29
310 0.36
311 0.41
312 0.49
313 0.59
314 0.68
315 0.73
316 0.77
317 0.8
318 0.84
319 0.9
320 0.92
321 0.93
322 0.94
323 0.95
324 0.94
325 0.93
326 0.91
327 0.87
328 0.79
329 0.7
330 0.64
331 0.54
332 0.47
333 0.38
334 0.3
335 0.22
336 0.19
337 0.17
338 0.12
339 0.1
340 0.08
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.13
346 0.15
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.18
351 0.24
352 0.27
353 0.3
354 0.29
355 0.27
356 0.3
357 0.31
358 0.34
359 0.29
360 0.28
361 0.22
362 0.23
363 0.23
364 0.24
365 0.24
366 0.21
367 0.2
368 0.17
369 0.16
370 0.15
371 0.15
372 0.12
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.2
378 0.21
379 0.25
380 0.29
381 0.3
382 0.32
383 0.3
384 0.31
385 0.26
386 0.35
387 0.39
388 0.43
389 0.43
390 0.43
391 0.44
392 0.43
393 0.45
394 0.41
395 0.37
396 0.35
397 0.34
398 0.35
399 0.36
400 0.37
401 0.35
402 0.31
403 0.27
404 0.25
405 0.33
406 0.35
407 0.42
408 0.46
409 0.48
410 0.51
411 0.58
412 0.59
413 0.57
414 0.59
415 0.52
416 0.52
417 0.49
418 0.54
419 0.51
420 0.47
421 0.44
422 0.42
423 0.43
424 0.42
425 0.44
426 0.45
427 0.48
428 0.58
429 0.64
430 0.66