Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CHB3

Protein Details
Accession I1CHB3    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
307-329KTNETPKQKGPRKQGTPFQRVKPHydrophilic
363-391LIKVRGDKFRAEKNKKKRGSYRGGQISFEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-319KRKAEEAAPEPPVIKKANIKTNETPKQKGPRK
369-381DKFRAEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MSSLDTHIYKYLLSKGYNEVANSLKKANTSVTKETTKKDLITIFEAYKKNNSSSDEDTEMTDSSSSSSSSDEEEEEKKDSSSDSSSDSSDSESSDEEEKKKGESKSSDSDDEDKKDSASSSDSSSSDSESSEDVEMKDAESSSSDSDSSDDDEEKAKKDSSSSSSDSSSDSSDEEEKKDSESSSESSSESSSESSSDSSDSSDSSDSSDSSDNEEETKKESSESSGSESDSSDSESSDSDSSSSESDSSDDEEEKNKDSSSSSSDSSSGSDSSSSKSSDDEEEKKVEKRKAEEAAPEPPVIKKANIKTNETPKQKGPRKQGTPFQRVKPEEVEFFDERLKDNTYDSKGGSGVNSYGWKASQDLIKVRGDKFRAEKNKKKRGSYRGGQISFESHSIKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.36
4 0.38
5 0.36
6 0.31
7 0.32
8 0.35
9 0.34
10 0.32
11 0.29
12 0.27
13 0.29
14 0.32
15 0.35
16 0.38
17 0.43
18 0.47
19 0.54
20 0.57
21 0.58
22 0.59
23 0.54
24 0.49
25 0.46
26 0.44
27 0.39
28 0.39
29 0.4
30 0.35
31 0.38
32 0.39
33 0.37
34 0.39
35 0.39
36 0.37
37 0.38
38 0.39
39 0.38
40 0.41
41 0.44
42 0.4
43 0.38
44 0.36
45 0.33
46 0.29
47 0.24
48 0.18
49 0.13
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.12
57 0.13
58 0.13
59 0.16
60 0.18
61 0.19
62 0.21
63 0.21
64 0.19
65 0.18
66 0.18
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.18
71 0.19
72 0.2
73 0.2
74 0.19
75 0.18
76 0.16
77 0.15
78 0.12
79 0.11
80 0.13
81 0.17
82 0.2
83 0.19
84 0.22
85 0.22
86 0.24
87 0.3
88 0.3
89 0.33
90 0.35
91 0.4
92 0.45
93 0.49
94 0.49
95 0.45
96 0.49
97 0.46
98 0.44
99 0.4
100 0.32
101 0.28
102 0.26
103 0.23
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.15
108 0.17
109 0.17
110 0.19
111 0.19
112 0.19
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.11
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.08
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.14
140 0.15
141 0.16
142 0.17
143 0.16
144 0.15
145 0.16
146 0.19
147 0.2
148 0.24
149 0.26
150 0.25
151 0.26
152 0.26
153 0.26
154 0.23
155 0.19
156 0.14
157 0.11
158 0.11
159 0.14
160 0.14
161 0.15
162 0.16
163 0.15
164 0.16
165 0.17
166 0.15
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.12
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.14
217 0.12
218 0.13
219 0.09
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.11
239 0.14
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.15
245 0.15
246 0.17
247 0.18
248 0.19
249 0.18
250 0.19
251 0.19
252 0.19
253 0.19
254 0.18
255 0.13
256 0.11
257 0.11
258 0.11
259 0.13
260 0.14
261 0.14
262 0.13
263 0.13
264 0.15
265 0.19
266 0.24
267 0.26
268 0.27
269 0.31
270 0.34
271 0.38
272 0.44
273 0.43
274 0.42
275 0.42
276 0.46
277 0.47
278 0.48
279 0.49
280 0.46
281 0.48
282 0.45
283 0.41
284 0.35
285 0.3
286 0.3
287 0.25
288 0.24
289 0.25
290 0.3
291 0.38
292 0.42
293 0.48
294 0.53
295 0.61
296 0.68
297 0.67
298 0.64
299 0.63
300 0.7
301 0.72
302 0.72
303 0.72
304 0.73
305 0.76
306 0.8
307 0.81
308 0.8
309 0.82
310 0.81
311 0.78
312 0.77
313 0.71
314 0.68
315 0.64
316 0.58
317 0.51
318 0.47
319 0.46
320 0.38
321 0.37
322 0.36
323 0.3
324 0.28
325 0.27
326 0.27
327 0.21
328 0.23
329 0.29
330 0.3
331 0.32
332 0.31
333 0.3
334 0.27
335 0.27
336 0.25
337 0.2
338 0.15
339 0.16
340 0.18
341 0.16
342 0.17
343 0.16
344 0.17
345 0.16
346 0.19
347 0.2
348 0.23
349 0.27
350 0.31
351 0.36
352 0.4
353 0.41
354 0.45
355 0.44
356 0.46
357 0.47
358 0.53
359 0.59
360 0.65
361 0.72
362 0.76
363 0.84
364 0.85
365 0.89
366 0.88
367 0.88
368 0.88
369 0.86
370 0.86
371 0.86
372 0.8
373 0.72
374 0.64
375 0.57
376 0.49
377 0.43
378 0.35