Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CMH0

Protein Details
Accession I1CMH0    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-61INYANKWMPNRIRKKGGKQRLVSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-55RKKGGK
113-117KKKPL
121-126QHKKAR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MPKSLPYEAQMDIKSALEHDVSTDVIAKRFRVHQNTVINYANKWMPNRIRKKGGKQRLVSDITRRLIKREVLNGSLRTAKEVHLKLEELGYSMSYQSAINVLHSVEIFAEIKKKKPLLTAQHKKARLAWAKKHQYWTIHDWRRVIFSDETKINIWGSDGCKYYWKRKGDRLQPYHIEVTVKHGGGGIMLWGCITSEGPGYACQIYDGTMNSEVYQEILGTSLKDTLGYYGLNWKSSIFQHDNDPKHRSKSTKQYMDDNSMCYIDDWPSQSPDLNPIEHIWHHLKLKLSMYENRAKSIHELWQRMEKEWNSFTKDQCLKYIDSMPERIQDVIAEKGGSTRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.19
3 0.19
4 0.13
5 0.13
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.12
10 0.17
11 0.16
12 0.2
13 0.22
14 0.21
15 0.24
16 0.32
17 0.4
18 0.42
19 0.47
20 0.51
21 0.59
22 0.62
23 0.63
24 0.6
25 0.53
26 0.45
27 0.43
28 0.39
29 0.34
30 0.32
31 0.35
32 0.39
33 0.49
34 0.58
35 0.62
36 0.69
37 0.74
38 0.83
39 0.85
40 0.86
41 0.85
42 0.81
43 0.79
44 0.77
45 0.74
46 0.67
47 0.64
48 0.61
49 0.55
50 0.57
51 0.51
52 0.45
53 0.45
54 0.47
55 0.44
56 0.44
57 0.45
58 0.42
59 0.47
60 0.45
61 0.42
62 0.42
63 0.36
64 0.31
65 0.27
66 0.25
67 0.28
68 0.29
69 0.29
70 0.27
71 0.27
72 0.25
73 0.26
74 0.24
75 0.16
76 0.14
77 0.12
78 0.1
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.06
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.15
97 0.16
98 0.2
99 0.25
100 0.27
101 0.26
102 0.32
103 0.4
104 0.43
105 0.53
106 0.6
107 0.65
108 0.71
109 0.71
110 0.67
111 0.62
112 0.61
113 0.59
114 0.57
115 0.56
116 0.58
117 0.66
118 0.68
119 0.7
120 0.64
121 0.59
122 0.56
123 0.55
124 0.55
125 0.53
126 0.52
127 0.49
128 0.46
129 0.44
130 0.4
131 0.36
132 0.27
133 0.22
134 0.24
135 0.23
136 0.24
137 0.22
138 0.21
139 0.17
140 0.15
141 0.13
142 0.11
143 0.12
144 0.13
145 0.14
146 0.13
147 0.2
148 0.22
149 0.3
150 0.35
151 0.4
152 0.41
153 0.49
154 0.58
155 0.61
156 0.69
157 0.66
158 0.65
159 0.62
160 0.6
161 0.52
162 0.44
163 0.35
164 0.24
165 0.26
166 0.23
167 0.2
168 0.16
169 0.16
170 0.14
171 0.14
172 0.13
173 0.07
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.08
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.15
217 0.16
218 0.17
219 0.17
220 0.16
221 0.17
222 0.19
223 0.26
224 0.21
225 0.21
226 0.3
227 0.38
228 0.43
229 0.47
230 0.51
231 0.48
232 0.5
233 0.54
234 0.51
235 0.51
236 0.57
237 0.62
238 0.65
239 0.64
240 0.67
241 0.67
242 0.69
243 0.63
244 0.53
245 0.44
246 0.35
247 0.33
248 0.24
249 0.21
250 0.14
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.18
255 0.19
256 0.19
257 0.19
258 0.24
259 0.24
260 0.21
261 0.21
262 0.2
263 0.23
264 0.22
265 0.27
266 0.24
267 0.26
268 0.27
269 0.29
270 0.31
271 0.32
272 0.36
273 0.37
274 0.38
275 0.4
276 0.44
277 0.5
278 0.47
279 0.47
280 0.43
281 0.39
282 0.38
283 0.35
284 0.38
285 0.37
286 0.39
287 0.39
288 0.47
289 0.48
290 0.46
291 0.5
292 0.44
293 0.43
294 0.45
295 0.48
296 0.46
297 0.48
298 0.48
299 0.51
300 0.55
301 0.5
302 0.5
303 0.48
304 0.42
305 0.43
306 0.48
307 0.45
308 0.43
309 0.46
310 0.43
311 0.43
312 0.42
313 0.38
314 0.31
315 0.26
316 0.24
317 0.23
318 0.22
319 0.18
320 0.16