FuNGI

I1CF35

Protein Details

Accession

I1CF35

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
577-596	DLYTKRQKEKADSKNRQSTF	Hydrophilic
723-745	NGEVVKKKNNEAEKNKKQKLPSD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 10.5, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MILNPQKCHFGKRSVHLLGFCISEKGKSLDPRKLTNIADWPRPKTGREMMQWLGTVNYFRAHIPCAATLTAPLDALRNVAFIDDIDWTPKLQVHFQSIKDILCSNVVLSPYDPTKSLYVATDASNTGVGAVLFQKFDEKQSDGLTVTTIKYLGFMARSLSQSERNYSVTRRELLAIVFALKKFHKFLYGHHFTLYSDHRALTYLFTSDELNPMMVGWMDTLLSYDFDIVHIPGVQNVLPDALSRLFPPEKELAGSDSNNSTVKHQNLAYKPNLKKEYELKMKKENRKVFYVQSPTKFSDKDYITPPYEDRQEILDGVHKFGHFGADHIVKSIHNQNLHWPNLLADAVNYVSKCNTCQKYNIAKKGYNPHRPVYAYVPGDAYAFDLIGPFQSSSNMYTYVLILVDICTRFCVLKPLVDKKAKTVAGAMVDTFSLLGYPRHFVCSDNVSEFKSEILENLFNAMGIDKRYTTPYHPSANGAAERYVQSAKKILAKFLEGATEDWHHYIPSVQLMINNKISTRLQTTPFSLMFARNINDFIEYRDDAGELKKEEYMPHDELLKRIDYMSQVVFPAIQDRTDLYTKRQKEKADSKNRQSTFPEGSYVMVRDREQYNSLSPVYKGPYRVVRQVQGGAYILRDVDETLMSRNYSPEELKLISQDEIIPKDELYEIEAIINHRGEPGNREYLVRWKNYSKDDDSWLTAEAFTGPESINIYWRKMGKSINQNGEVVKKKNNEAEKNKKQKLPSDYAPNIPNEDYNKVKKALIEKQIIMKAP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.65
3	0.58
4	0.55
5	0.47
6	0.41
7	0.34
8	0.28
9	0.23
10	0.2
11	0.21
12	0.22
13	0.27
14	0.33
15	0.39
16	0.45
17	0.5
18	0.55
19	0.58
20	0.61
21	0.57
22	0.54
23	0.57
24	0.54
25	0.59
26	0.58
27	0.57
28	0.6
29	0.61
30	0.56
31	0.54
32	0.56
33	0.55
34	0.54
35	0.56
36	0.5
37	0.51
38	0.5
39	0.42
40	0.35
41	0.28
42	0.24
43	0.18
44	0.17
45	0.14
46	0.15
47	0.16
48	0.17
49	0.19
50	0.2
51	0.21
52	0.22
53	0.22
54	0.2
55	0.2
56	0.19
57	0.17
58	0.15
59	0.13
60	0.12
61	0.11
62	0.13
63	0.12
64	0.1
65	0.09
66	0.09
67	0.09
68	0.07
69	0.08
70	0.09
71	0.1
72	0.12
73	0.13
74	0.13
75	0.14
76	0.17
77	0.17
78	0.2
79	0.24
80	0.3
81	0.35
82	0.36
83	0.42
84	0.41
85	0.4
86	0.36
87	0.33
88	0.25
89	0.21
90	0.21
91	0.14
92	0.14
93	0.15
94	0.14
95	0.14
96	0.16
97	0.17
98	0.18
99	0.18
100	0.17
101	0.18
102	0.18
103	0.19
104	0.16
105	0.17
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.16
110	0.16
111	0.15
112	0.13
113	0.11
114	0.09
115	0.08
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.09
120	0.09
121	0.13
122	0.13
123	0.16
124	0.19
125	0.19
126	0.2
127	0.22
128	0.24
129	0.21
130	0.21
131	0.19
132	0.16
133	0.15
134	0.14
135	0.12
136	0.1
137	0.1
138	0.1
139	0.11
140	0.1
141	0.1
142	0.12
143	0.15
144	0.16
145	0.18
146	0.2
147	0.26
148	0.27
149	0.3
150	0.31
151	0.31
152	0.32
153	0.33
154	0.38
155	0.35
156	0.35
157	0.32
158	0.31
159	0.29
160	0.26
161	0.25
162	0.18
163	0.16
164	0.17
165	0.15
166	0.17
167	0.17
168	0.19
169	0.19
170	0.19
171	0.24
172	0.23
173	0.29
174	0.36
175	0.42
176	0.4
177	0.39
178	0.39
179	0.31
180	0.36
181	0.33
182	0.28
183	0.22
184	0.21
185	0.2
186	0.21
187	0.21
188	0.18
189	0.15
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.13
194	0.12
195	0.14
196	0.12
197	0.11
198	0.1
199	0.09
200	0.09
201	0.07
202	0.07
203	0.05
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.05
211	0.06
212	0.05
213	0.06
214	0.07
215	0.06
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.09
221	0.08
222	0.08
223	0.08
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.13
232	0.14
233	0.14
234	0.18
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.19
239	0.17
240	0.19
241	0.2
242	0.17
243	0.16
244	0.17
245	0.18
246	0.17
247	0.17
248	0.2
249	0.21
250	0.23
251	0.24
252	0.3
253	0.32
254	0.37
255	0.4
256	0.44
257	0.45
258	0.51
259	0.53
260	0.47
261	0.47
262	0.48
263	0.52
264	0.53
265	0.57
266	0.53
267	0.59
268	0.67
269	0.72
270	0.75
271	0.74
272	0.67
273	0.66
274	0.65
275	0.59
276	0.58
277	0.58
278	0.54
279	0.5
280	0.5
281	0.47
282	0.46
283	0.42
284	0.35
285	0.34
286	0.31
287	0.3
288	0.29
289	0.32
290	0.3
291	0.31
292	0.31
293	0.27
294	0.28
295	0.25
296	0.21
297	0.18
298	0.17
299	0.16
300	0.15
301	0.17
302	0.15
303	0.16
304	0.17
305	0.14
306	0.14
307	0.14
308	0.16
309	0.1
310	0.1
311	0.13
312	0.14
313	0.14
314	0.15
315	0.15
316	0.12
317	0.15
318	0.21
319	0.2
320	0.18
321	0.19
322	0.26
323	0.33
324	0.34
325	0.32
326	0.26
327	0.23
328	0.23
329	0.23
330	0.14
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.08
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.09
340	0.17
341	0.19
342	0.2
343	0.23
344	0.31
345	0.41
346	0.48
347	0.54
348	0.5
349	0.49
350	0.52
351	0.6
352	0.61
353	0.6
354	0.56
355	0.5
356	0.49
357	0.48
358	0.46
359	0.4
360	0.37
361	0.28
362	0.25
363	0.23
364	0.19
365	0.18
366	0.16
367	0.12
368	0.06
369	0.05
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.06
379	0.07
380	0.08
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.08
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.06
391	0.06
392	0.06
393	0.06
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.12
398	0.11
399	0.15
400	0.2
401	0.26
402	0.34
403	0.39
404	0.39
405	0.36
406	0.43
407	0.4
408	0.35
409	0.3
410	0.24
411	0.21
412	0.21
413	0.18
414	0.1
415	0.09
416	0.09
417	0.07
418	0.05
419	0.03
420	0.04
421	0.05
422	0.05
423	0.07
424	0.08
425	0.1
426	0.11
427	0.12
428	0.14
429	0.17
430	0.18
431	0.19
432	0.19
433	0.18
434	0.18
435	0.17
436	0.15
437	0.12
438	0.1
439	0.08
440	0.1
441	0.09
442	0.09
443	0.1
444	0.09
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.06
449	0.07
450	0.08
451	0.07
452	0.08
453	0.11
454	0.13
455	0.15
456	0.21
457	0.25
458	0.29
459	0.28
460	0.29
461	0.29
462	0.31
463	0.29
464	0.23
465	0.19
466	0.16
467	0.16
468	0.16
469	0.17
470	0.14
471	0.14
472	0.16
473	0.17
474	0.23
475	0.23
476	0.23
477	0.22
478	0.23
479	0.23
480	0.21
481	0.21
482	0.15
483	0.15
484	0.15
485	0.15
486	0.14
487	0.14
488	0.13
489	0.11
490	0.1
491	0.11
492	0.09
493	0.09
494	0.1
495	0.09
496	0.12
497	0.16
498	0.19
499	0.21
500	0.2
501	0.19
502	0.21
503	0.21
504	0.21
505	0.22
506	0.23
507	0.23
508	0.26
509	0.28
510	0.29
511	0.29
512	0.28
513	0.24
514	0.21
515	0.19
516	0.2
517	0.18
518	0.15
519	0.15
520	0.14
521	0.15
522	0.14
523	0.14
524	0.16
525	0.16
526	0.16
527	0.15
528	0.15
529	0.14
530	0.15
531	0.17
532	0.13
533	0.14
534	0.15
535	0.15
536	0.16
537	0.2
538	0.24
539	0.23
540	0.22
541	0.27
542	0.26
543	0.26
544	0.28
545	0.25
546	0.19
547	0.17
548	0.17
549	0.13
550	0.15
551	0.15
552	0.14
553	0.13
554	0.13
555	0.13
556	0.11
557	0.14
558	0.12
559	0.11
560	0.1
561	0.11
562	0.16
563	0.2
564	0.21
565	0.24
566	0.32
567	0.39
568	0.46
569	0.5
570	0.5
571	0.56
572	0.65
573	0.69
574	0.72
575	0.75
576	0.77
577	0.82
578	0.79
579	0.74
580	0.67
581	0.62
582	0.57
583	0.48
584	0.41
585	0.31
586	0.31
587	0.28
588	0.26
589	0.22
590	0.19
591	0.18
592	0.19
593	0.21
594	0.23
595	0.23
596	0.24
597	0.25
598	0.26
599	0.27
600	0.24
601	0.23
602	0.24
603	0.26
604	0.27
605	0.26
606	0.27
607	0.35
608	0.37
609	0.45
610	0.46
611	0.46
612	0.46
613	0.48
614	0.44
615	0.37
616	0.33
617	0.26
618	0.21
619	0.17
620	0.14
621	0.1
622	0.09
623	0.08
624	0.07
625	0.08
626	0.08
627	0.1
628	0.13
629	0.13
630	0.13
631	0.15
632	0.16
633	0.18
634	0.19
635	0.18
636	0.2
637	0.21
638	0.21
639	0.22
640	0.22
641	0.2
642	0.19
643	0.2
644	0.2
645	0.21
646	0.23
647	0.21
648	0.18
649	0.19
650	0.19
651	0.16
652	0.15
653	0.13
654	0.11
655	0.12
656	0.14
657	0.14
658	0.16
659	0.16
660	0.13
661	0.15
662	0.17
663	0.17
664	0.21
665	0.25
666	0.29
667	0.29
668	0.31
669	0.3
670	0.38
671	0.43
672	0.42
673	0.42
674	0.41
675	0.47
676	0.52
677	0.58
678	0.54
679	0.52
680	0.54
681	0.52
682	0.5
683	0.44
684	0.39
685	0.32
686	0.26
687	0.22
688	0.16
689	0.13
690	0.1
691	0.11
692	0.09
693	0.1
694	0.13
695	0.13
696	0.19
697	0.21
698	0.23
699	0.27
700	0.31
701	0.32
702	0.34
703	0.39
704	0.41
705	0.5
706	0.57
707	0.61
708	0.6
709	0.59
710	0.57
711	0.6
712	0.58
713	0.51
714	0.49
715	0.45
716	0.48
717	0.54
718	0.62
719	0.63
720	0.67
721	0.74
722	0.78
723	0.84
724	0.87
725	0.84
726	0.81
727	0.79
728	0.77
729	0.75
730	0.72
731	0.72
732	0.68
733	0.69
734	0.67
735	0.61
736	0.56
737	0.48
738	0.44
739	0.38
740	0.39
741	0.4
742	0.42
743	0.45
744	0.43
745	0.44
746	0.44
747	0.48
748	0.52
749	0.54
750	0.54
751	0.53
752	0.58

I1CF35

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer