FuNGI

I1CHN2

Protein Details

Accession

I1CHN2

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1304-1333	REVQLVPKKDTTKKRKNVHRNVTNSKRNRR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1314-1333	TTKKRKNVHRNVTNSKRNRR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17919 RT_RNaseH_2 PF00665 rve PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE PS50878 RT_POL
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MDQLLSLKMVPAESIEAFTDRFQRIRRAAKWDDDIRTASIYKRALPAFLRQEVSRSLLNLGRDQQDSVAKVAAKARVVLSSNLCSEGSPSPRQDSVPVKSLSMSLASNGTEASKYNPRNSHLLSNLQGITKKSSSPGNVKNKFHCAIHGLANHPTDKCNKYKNLLSQSSSSVSPSPTTTNPPMSFVSVTKKCFRCSGNVPWSREHAAICPRDKPYHGPSKAIRSARLVTSSSNGSKLNLTITPQARPQQASSKMSSGDSNLMDVDDEGYPVNYDFDRNVSGSVILATSDNVSKRFGTTKFPLSVIYGDNDKNLIHTSHSFEVLPLSLDTEVVIGLDLMHKLNILVTNLAIRHPNLAPVIDKEITDDTPEPNKAPYGTREQQVHFHNAIKPFVDQNALIPKNSFCTVPESVIRLDTVKGKTAYRAPYRTPFKLLPIMRECIDTWLKDEVIERASPNSDWNSPLTLAPKKDLLGNLTGHRPCLDPRLLNSILVSNDRHPIPKIEEIFDQLQGSTIFTTLDLRQAFHRFQIYEPDRVKTTFTFEGQQYQFRGCPFGLKHIASRYQRVINIVLRDLPYAQAFVDDIIIFSKSYEEYITHVQNIIQRLTKVNLILNPDKCHFAQSTVYLLGFCVDAKGSRLDPRKVTNALTWPRPSSGKEIQRFLGLVNYFRKYLPNISEVTAPLDKLRFEGKLDKLWTSEQESAFEKIKALLSSAPLLHHPDLEQPFYVATDASNYSIGAVLYQVIKNETRYIGFMARSLSSSEKNYSTTKRELLAVIFALKKFHPFLWGNPFTLYTDHKALTYLHTQPVANAMMINWLDTILDYNFKIIHRPGIQNILPDALSRLFEPEKTLEGDNKTIKTIVTSQIINSNGSILTSRMMMPADLMTPAPEDRQKLLMDTHLEGHRGAQAIVTALHSDGIHWTKLKEDALEIIRSCPDCQKFNITKHGYNPLTSIYADAPWDHICIDTAGPFPTSVQGNQYILLVVDVFTRYCVLKALPDKSSLTIALALRSILSLFGRPKIIQSDNGTEYVNEIVRLYVESSGIDHRLISAYHPRANGIVERWVGKAKNILHKRLQGRTEDWDLYVDSTQEALNNTHTALHGTRPFSLMFARRPNENKDYNNVLDKTKSPETMKQLETRINEFNDTVLPAIRKKIKTSQAASRDKFNQTHRILTDIPTGSQVTLKNVNRVAKSDPLYVGNYTVKRKTQGGSYVLVDATGALLPRDVPPSQIKVISQEVSLSNTDQSESYDVEAVLHHKGSPGNYLYKVRWKGYGEEDDTWEPASHFHDYRPIQKYWSRISEQEPAREVQLVPKKDTTKKRKNVHRNVTNSKRNRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.15
3	0.15
4	0.16
5	0.18
6	0.23
7	0.22
8	0.27
9	0.29
10	0.37
11	0.44
12	0.53
13	0.57
14	0.59
15	0.63
16	0.67
17	0.72
18	0.7
19	0.67
20	0.61
21	0.58
22	0.5
23	0.47
24	0.41
25	0.34
26	0.33
27	0.3
28	0.29
29	0.34
30	0.33
31	0.34
32	0.34
33	0.41
34	0.42
35	0.46
36	0.46
37	0.39
38	0.42
39	0.4
40	0.41
41	0.34
42	0.27
43	0.26
44	0.26
45	0.28
46	0.29
47	0.32
48	0.33
49	0.32
50	0.32
51	0.31
52	0.33
53	0.32
54	0.29
55	0.28
56	0.24
57	0.25
58	0.29
59	0.3
60	0.26
61	0.26
62	0.26
63	0.27
64	0.28
65	0.3
66	0.3
67	0.3
68	0.3
69	0.3
70	0.29
71	0.24
72	0.24
73	0.27
74	0.28
75	0.3
76	0.32
77	0.35
78	0.37
79	0.38
80	0.42
81	0.43
82	0.42
83	0.45
84	0.43
85	0.39
86	0.37
87	0.37
88	0.31
89	0.26
90	0.21
91	0.14
92	0.15
93	0.14
94	0.14
95	0.13
96	0.13
97	0.11
98	0.12
99	0.16
100	0.23
101	0.27
102	0.35
103	0.4
104	0.43
105	0.49
106	0.53
107	0.56
108	0.51
109	0.53
110	0.48
111	0.47
112	0.46
113	0.41
114	0.4
115	0.34
116	0.36
117	0.31
118	0.29
119	0.27
120	0.31
121	0.34
122	0.4
123	0.49
124	0.54
125	0.61
126	0.66
127	0.69
128	0.71
129	0.68
130	0.59
131	0.52
132	0.45
133	0.4
134	0.41
135	0.39
136	0.34
137	0.36
138	0.38
139	0.38
140	0.34
141	0.34
142	0.34
143	0.35
144	0.39
145	0.42
146	0.46
147	0.5
148	0.57
149	0.64
150	0.66
151	0.68
152	0.64
153	0.59
154	0.57
155	0.52
156	0.45
157	0.37
158	0.29
159	0.24
160	0.22
161	0.21
162	0.22
163	0.21
164	0.28
165	0.31
166	0.37
167	0.37
168	0.39
169	0.38
170	0.37
171	0.36
172	0.31
173	0.36
174	0.33
175	0.37
176	0.43
177	0.44
178	0.44
179	0.48
180	0.48
181	0.46
182	0.47
183	0.54
184	0.56
185	0.6
186	0.62
187	0.59
188	0.62
189	0.57
190	0.51
191	0.42
192	0.37
193	0.38
194	0.41
195	0.41
196	0.42
197	0.43
198	0.45
199	0.46
200	0.47
201	0.47
202	0.51
203	0.5
204	0.51
205	0.52
206	0.58
207	0.63
208	0.6
209	0.54
210	0.48
211	0.5
212	0.46
213	0.45
214	0.36
215	0.3
216	0.3
217	0.32
218	0.29
219	0.28
220	0.25
221	0.22
222	0.22
223	0.22
224	0.22
225	0.18
226	0.19
227	0.24
228	0.26
229	0.27
230	0.31
231	0.36
232	0.36
233	0.37
234	0.37
235	0.39
236	0.44
237	0.46
238	0.44
239	0.42
240	0.39
241	0.38
242	0.36
243	0.29
244	0.26
245	0.22
246	0.19
247	0.16
248	0.15
249	0.14
250	0.13
251	0.12
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.07
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.07
260	0.08
261	0.09
262	0.11
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.12
267	0.12
268	0.11
269	0.11
270	0.09
271	0.07
272	0.07
273	0.06
274	0.07
275	0.1
276	0.11
277	0.12
278	0.14
279	0.14
280	0.16
281	0.21
282	0.21
283	0.26
284	0.29
285	0.35
286	0.36
287	0.36
288	0.35
289	0.32
290	0.32
291	0.26
292	0.23
293	0.2
294	0.18
295	0.18
296	0.17
297	0.15
298	0.14
299	0.15
300	0.13
301	0.13
302	0.14
303	0.19
304	0.2
305	0.22
306	0.2
307	0.19
308	0.19
309	0.17
310	0.16
311	0.1
312	0.1
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.07
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.03
321	0.03
322	0.05
323	0.05
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.11
334	0.12
335	0.13
336	0.13
337	0.12
338	0.14
339	0.14
340	0.16
341	0.15
342	0.16
343	0.16
344	0.16
345	0.21
346	0.18
347	0.18
348	0.18
349	0.19
350	0.18
351	0.19
352	0.18
353	0.16
354	0.21
355	0.22
356	0.2
357	0.19
358	0.2
359	0.19
360	0.21
361	0.21
362	0.26
363	0.29
364	0.33
365	0.37
366	0.37
367	0.42
368	0.43
369	0.45
370	0.37
371	0.37
372	0.37
373	0.35
374	0.35
375	0.29
376	0.27
377	0.22
378	0.22
379	0.2
380	0.15
381	0.16
382	0.24
383	0.24
384	0.23
385	0.23
386	0.22
387	0.23
388	0.24
389	0.21
390	0.12
391	0.17
392	0.18
393	0.2
394	0.22
395	0.21
396	0.21
397	0.21
398	0.21
399	0.15
400	0.15
401	0.18
402	0.18
403	0.2
404	0.21
405	0.21
406	0.24
407	0.29
408	0.36
409	0.37
410	0.4
411	0.4
412	0.47
413	0.54
414	0.53
415	0.52
416	0.45
417	0.42
418	0.46
419	0.43
420	0.42
421	0.39
422	0.39
423	0.35
424	0.35
425	0.31
426	0.28
427	0.29
428	0.22
429	0.2
430	0.2
431	0.19
432	0.18
433	0.19
434	0.15
435	0.15
436	0.16
437	0.14
438	0.13
439	0.14
440	0.14
441	0.15
442	0.16
443	0.15
444	0.16
445	0.17
446	0.17
447	0.16
448	0.18
449	0.2
450	0.21
451	0.21
452	0.21
453	0.21
454	0.2
455	0.22
456	0.22
457	0.19
458	0.18
459	0.19
460	0.2
461	0.25
462	0.25
463	0.23
464	0.22
465	0.21
466	0.19
467	0.22
468	0.24
469	0.18
470	0.21
471	0.28
472	0.28
473	0.27
474	0.26
475	0.22
476	0.2
477	0.21
478	0.2
479	0.13
480	0.17
481	0.17
482	0.18
483	0.17
484	0.19
485	0.21
486	0.25
487	0.26
488	0.24
489	0.24
490	0.27
491	0.27
492	0.25
493	0.21
494	0.15
495	0.15
496	0.12
497	0.12
498	0.08
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.08
503	0.07
504	0.12
505	0.12
506	0.13
507	0.16
508	0.19
509	0.2
510	0.2
511	0.22
512	0.18
513	0.18
514	0.28
515	0.28
516	0.32
517	0.33
518	0.33
519	0.31
520	0.31
521	0.32
522	0.22
523	0.25
524	0.19
525	0.19
526	0.21
527	0.2
528	0.27
529	0.26
530	0.29
531	0.24
532	0.23
533	0.24
534	0.2
535	0.22
536	0.14
537	0.18
538	0.16
539	0.22
540	0.25
541	0.24
542	0.26
543	0.28
544	0.35
545	0.32
546	0.35
547	0.33
548	0.31
549	0.32
550	0.31
551	0.31
552	0.27
553	0.26
554	0.23
555	0.21
556	0.18
557	0.18
558	0.16
559	0.13
560	0.1
561	0.09
562	0.08
563	0.06
564	0.06
565	0.06
566	0.06
567	0.05
568	0.05
569	0.05
570	0.06
571	0.05
572	0.05
573	0.06
574	0.05
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.08
579	0.12
580	0.13
581	0.13
582	0.13
583	0.14
584	0.16
585	0.18
586	0.17
587	0.15
588	0.14
589	0.15
590	0.16
591	0.16
592	0.15
593	0.14
594	0.15
595	0.19
596	0.24
597	0.25
598	0.26
599	0.26
600	0.27
601	0.25
602	0.25
603	0.2
604	0.17
605	0.16
606	0.15
607	0.16
608	0.14
609	0.14
610	0.12
611	0.11
612	0.1
613	0.08
614	0.06
615	0.04
616	0.04
617	0.04
618	0.06
619	0.07
620	0.08
621	0.14
622	0.2
623	0.23
624	0.25
625	0.29
626	0.32
627	0.32
628	0.33
629	0.29
630	0.31
631	0.32
632	0.33
633	0.32
634	0.28
635	0.28
636	0.28
637	0.27
638	0.26
639	0.31
640	0.34
641	0.36
642	0.37
643	0.36
644	0.35
645	0.34
646	0.27
647	0.24
648	0.16
649	0.16
650	0.17
651	0.17
652	0.17
653	0.17
654	0.18
655	0.15
656	0.19
657	0.18
658	0.17
659	0.17
660	0.18
661	0.19
662	0.18
663	0.2
664	0.17
665	0.14
666	0.12
667	0.12
668	0.11
669	0.1
670	0.12
671	0.09
672	0.1
673	0.17
674	0.18
675	0.23
676	0.24
677	0.24
678	0.23
679	0.24
680	0.24
681	0.22
682	0.24
683	0.19
684	0.19
685	0.21
686	0.22
687	0.22
688	0.2
689	0.16
690	0.13
691	0.15
692	0.12
693	0.11
694	0.1
695	0.1
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.1
700	0.13
701	0.12
702	0.12
703	0.11
704	0.15
705	0.16
706	0.17
707	0.16
708	0.13
709	0.13
710	0.13
711	0.12
712	0.07
713	0.05
714	0.06
715	0.06
716	0.07
717	0.07
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.07
722	0.05
723	0.05
724	0.05
725	0.06
726	0.06
727	0.07
728	0.08
729	0.08
730	0.09
731	0.11
732	0.11
733	0.1
734	0.11
735	0.12
736	0.13
737	0.13
738	0.13
739	0.13
740	0.13
741	0.13
742	0.13
743	0.14
744	0.13
745	0.15
746	0.16
747	0.16
748	0.18
749	0.21
750	0.24
751	0.27
752	0.28
753	0.28
754	0.26
755	0.26
756	0.25
757	0.22
758	0.19
759	0.14
760	0.14
761	0.13
762	0.12
763	0.12
764	0.11
765	0.13
766	0.13
767	0.13
768	0.17
769	0.17
770	0.21
771	0.29
772	0.32
773	0.31
774	0.3
775	0.3
776	0.25
777	0.25
778	0.23
779	0.16
780	0.16
781	0.16
782	0.15
783	0.16
784	0.15
785	0.17
786	0.19
787	0.19
788	0.18
789	0.2
790	0.19
791	0.18
792	0.21
793	0.18
794	0.14
795	0.11
796	0.09
797	0.11
798	0.11
799	0.11
800	0.08
801	0.07
802	0.07
803	0.07
804	0.08
805	0.05
806	0.07
807	0.07
808	0.07
809	0.09
810	0.09
811	0.12
812	0.11
813	0.16
814	0.19
815	0.21
816	0.22
817	0.27
818	0.28
819	0.27
820	0.27
821	0.22
822	0.18
823	0.16
824	0.16
825	0.1
826	0.1
827	0.09
828	0.12
829	0.11
830	0.11
831	0.14
832	0.13
833	0.14
834	0.16
835	0.17
836	0.17
837	0.19
838	0.24
839	0.24
840	0.24
841	0.23
842	0.21
843	0.2
844	0.19
845	0.19
846	0.18
847	0.18
848	0.17
849	0.17
850	0.21
851	0.23
852	0.21
853	0.18
854	0.15
855	0.12
856	0.12
857	0.12
858	0.07
859	0.06
860	0.07
861	0.07
862	0.07
863	0.08
864	0.07
865	0.07
866	0.08
867	0.08
868	0.07
869	0.07
870	0.06
871	0.07
872	0.08
873	0.09
874	0.11
875	0.13
876	0.14
877	0.17
878	0.17
879	0.17
880	0.18
881	0.19
882	0.2
883	0.19
884	0.21
885	0.2
886	0.2
887	0.19
888	0.18
889	0.17
890	0.15
891	0.14
892	0.1
893	0.09
894	0.09
895	0.09
896	0.09
897	0.07
898	0.06
899	0.07
900	0.07
901	0.07
902	0.1
903	0.11
904	0.12
905	0.13
906	0.13
907	0.14
908	0.17
909	0.18
910	0.14
911	0.13
912	0.17
913	0.19
914	0.22
915	0.2
916	0.19
917	0.2
918	0.21
919	0.21
920	0.23
921	0.24
922	0.23
923	0.25
924	0.34
925	0.38
926	0.42
927	0.51
928	0.49
929	0.49
930	0.5
931	0.58
932	0.49
933	0.43
934	0.39
935	0.31
936	0.27
937	0.24
938	0.22
939	0.13
940	0.13
941	0.12
942	0.11
943	0.12
944	0.11
945	0.11
946	0.1
947	0.09
948	0.09
949	0.09
950	0.1
951	0.09
952	0.09
953	0.1
954	0.1
955	0.1
956	0.1
957	0.12
958	0.13
959	0.12
960	0.13
961	0.16
962	0.16
963	0.16
964	0.16
965	0.13
966	0.12
967	0.11
968	0.08
969	0.05
970	0.06
971	0.06
972	0.06
973	0.06
974	0.08
975	0.08
976	0.08
977	0.09
978	0.08
979	0.14
980	0.21
981	0.25
982	0.25
983	0.28
984	0.29
985	0.29
986	0.3
987	0.24
988	0.19
989	0.19
990	0.18
991	0.15
992	0.14
993	0.13
994	0.11
995	0.11
996	0.1
997	0.07
998	0.07
999	0.1
1000	0.11
1001	0.14
1002	0.17
1003	0.17
1004	0.19
1005	0.24
1006	0.26
1007	0.28
1008	0.31
1009	0.35
1010	0.34
1011	0.36
1012	0.34
1013	0.27
1014	0.26
1015	0.23
1016	0.18
1017	0.12
1018	0.1
1019	0.09
1020	0.09
1021	0.1
1022	0.1
1023	0.08
1024	0.08
1025	0.08
1026	0.09
1027	0.12
1028	0.12
1029	0.12
1030	0.11
1031	0.1
1032	0.11
1033	0.11
1034	0.13
1035	0.2
1036	0.23
1037	0.27
1038	0.28
1039	0.28
1040	0.27
1041	0.29
1042	0.29
1043	0.22
1044	0.23
1045	0.21
1046	0.22
1047	0.23
1048	0.26
1049	0.25
1050	0.23
1051	0.28
1052	0.28
1053	0.37
1054	0.42
1055	0.47
1056	0.49
1057	0.57
1058	0.62
1059	0.64
1060	0.62
1061	0.57
1062	0.53
1063	0.53
1064	0.52
1065	0.45
1066	0.39
1067	0.33
1068	0.29
1069	0.26
1070	0.23
1071	0.17
1072	0.11
1073	0.11
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.12
1077	0.11
1078	0.13
1079	0.13
1080	0.13
1081	0.14
1082	0.14
1083	0.15
1084	0.14
1085	0.19
1086	0.22
1087	0.23
1088	0.24
1089	0.24
1090	0.24
1091	0.22
1092	0.26
1093	0.26
1094	0.27
1095	0.34
1096	0.35
1097	0.4
1098	0.45
1099	0.51
1100	0.54
1101	0.56
1102	0.53
1103	0.5
1104	0.56
1105	0.52
1106	0.55
1107	0.5
1108	0.44
1109	0.4
1110	0.39
1111	0.4
1112	0.37
1113	0.39
1114	0.36
1115	0.41
1116	0.46
1117	0.51
1118	0.52
1119	0.51
1120	0.5
1121	0.51
1122	0.5
1123	0.48
1124	0.46
1125	0.4
1126	0.38
1127	0.32
1128	0.29
1129	0.24
1130	0.22
1131	0.18
1132	0.16
1133	0.16
1134	0.16
1135	0.23
1136	0.3
1137	0.31
1138	0.36
1139	0.44
1140	0.5
1141	0.57
1142	0.61
1143	0.64
1144	0.66
1145	0.74
1146	0.7
1147	0.69
1148	0.67
1149	0.64
1150	0.64
1151	0.6
1152	0.6
1153	0.53
1154	0.59
1155	0.52
1156	0.5
1157	0.45
1158	0.42
1159	0.44
1160	0.35
1161	0.33
1162	0.28
1163	0.28
1164	0.23
1165	0.25
1166	0.23
1167	0.2
1168	0.28
1169	0.3
1170	0.34
1171	0.38
1172	0.44
1173	0.42
1174	0.44
1175	0.43
1176	0.42
1177	0.43
1178	0.41
1179	0.38
1180	0.35
1181	0.36
1182	0.34
1183	0.34
1184	0.33
1185	0.34
1186	0.35
1187	0.38
1188	0.38
1189	0.4
1190	0.42
1191	0.41
1192	0.41
1193	0.44
1194	0.42
1195	0.4
1196	0.38
1197	0.37
1198	0.33
1199	0.3
1200	0.23
1201	0.15
1202	0.13
1203	0.1
1204	0.08
1205	0.06
1206	0.06
1207	0.07
1208	0.1
1209	0.14
1210	0.13
1211	0.16
1212	0.21
1213	0.27
1214	0.3
1215	0.31
1216	0.3
1217	0.31
1218	0.36
1219	0.33
1220	0.28
1221	0.26
1222	0.24
1223	0.25
1224	0.25
1225	0.22
1226	0.18
1227	0.17
1228	0.18
1229	0.15
1230	0.16
1231	0.16
1232	0.15
1233	0.16
1234	0.16
1235	0.15
1236	0.15
1237	0.16
1238	0.16
1239	0.16
1240	0.16
1241	0.14
1242	0.15
1243	0.17
1244	0.18
1245	0.23
1246	0.26
1247	0.28
1248	0.32
1249	0.37
1250	0.39
1251	0.47
1252	0.52
1253	0.47
1254	0.5
1255	0.47
1256	0.48
1257	0.52
1258	0.56
1259	0.52
1260	0.49
1261	0.52
1262	0.47
1263	0.45
1264	0.41
1265	0.34
1266	0.25
1267	0.21
1268	0.22
1269	0.22
1270	0.21
1271	0.22
1272	0.29
1273	0.32
1274	0.41
1275	0.45
1276	0.43
1277	0.44
1278	0.47
1279	0.53
1280	0.52
1281	0.57
1282	0.52
1283	0.51
1284	0.55
1285	0.58
1286	0.6
1287	0.6
1288	0.54
1289	0.47
1290	0.44
1291	0.43
1292	0.37
1293	0.37
1294	0.41
1295	0.38
1296	0.4
1297	0.46
1298	0.51
1299	0.58
1300	0.68
1301	0.7
1302	0.72
1303	0.78
1304	0.83
1305	0.87
1306	0.91
1307	0.93
1308	0.93
1309	0.92
1310	0.91
1311	0.92
1312	0.93
1313	0.92

I1CHN2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer