Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1CDN9

Protein Details
Accession I1CDN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-55KATVHRYCKKWNIQRPDNTGGRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
108-125KARPKRKVPLLSAKHRKA
Subcellular Location(s) nucl 18, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 11.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MTRSISQDTQNNLRVLLDTDLSYEEIADRLTLSKATVHRYCKKWNIQRPDNTGGRPPILTEASKSLMKRMVILGRLKSGVEVFDYFKAIYPRLTYNTTLDALKSLGFKARPKRKVPLLSAKHRKARLDWALAHRYWTTDDWRKVIFSDESKINVWGSDGVEFYWSLPGSPLQPHHHDNDPKHTAKITTTYLKEEARYPMLPWPSQSPDLNPIEHMWRHLKLKLLYNGLNNKGKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.26
4 0.19
5 0.13
6 0.14
7 0.15
8 0.15
9 0.14
10 0.11
11 0.1
12 0.09
13 0.09
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.14
21 0.17
22 0.24
23 0.3
24 0.37
25 0.45
26 0.5
27 0.58
28 0.62
29 0.7
30 0.73
31 0.76
32 0.79
33 0.8
34 0.83
35 0.82
36 0.8
37 0.74
38 0.66
39 0.62
40 0.54
41 0.46
42 0.37
43 0.31
44 0.27
45 0.25
46 0.23
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.23
51 0.23
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.22
56 0.23
57 0.24
58 0.26
59 0.29
60 0.28
61 0.26
62 0.26
63 0.25
64 0.21
65 0.18
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.14
76 0.13
77 0.14
78 0.15
79 0.18
80 0.2
81 0.19
82 0.19
83 0.21
84 0.21
85 0.19
86 0.16
87 0.14
88 0.11
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.1
93 0.12
94 0.17
95 0.26
96 0.35
97 0.42
98 0.45
99 0.51
100 0.55
101 0.6
102 0.62
103 0.63
104 0.6
105 0.63
106 0.7
107 0.7
108 0.68
109 0.64
110 0.59
111 0.51
112 0.52
113 0.47
114 0.43
115 0.41
116 0.41
117 0.42
118 0.41
119 0.41
120 0.32
121 0.27
122 0.24
123 0.21
124 0.22
125 0.25
126 0.27
127 0.27
128 0.28
129 0.28
130 0.26
131 0.28
132 0.24
133 0.18
134 0.2
135 0.2
136 0.21
137 0.22
138 0.22
139 0.19
140 0.16
141 0.15
142 0.12
143 0.11
144 0.1
145 0.09
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.14
157 0.19
158 0.21
159 0.26
160 0.28
161 0.31
162 0.39
163 0.44
164 0.45
165 0.49
166 0.52
167 0.49
168 0.48
169 0.45
170 0.38
171 0.34
172 0.36
173 0.31
174 0.31
175 0.31
176 0.34
177 0.36
178 0.37
179 0.36
180 0.34
181 0.33
182 0.31
183 0.3
184 0.27
185 0.29
186 0.33
187 0.32
188 0.31
189 0.32
190 0.33
191 0.37
192 0.37
193 0.34
194 0.37
195 0.39
196 0.38
197 0.33
198 0.3
199 0.32
200 0.32
201 0.33
202 0.3
203 0.32
204 0.35
205 0.36
206 0.42
207 0.4
208 0.49
209 0.51
210 0.53
211 0.52
212 0.56
213 0.62
214 0.62