Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1C6Q6

Protein Details
Accession I1C6Q6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-128VSFVRPKKPLINERNRKRRLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-125ERNRKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 10, mito 5.5, cyto 5.5, cyto_pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MRPLTEDRKNTIEFYLRQGFSYHKIAKIVKVSSSTVHKIRLELGLPARIDKGGRPKALTKREQQHLVRAVSVDGLENAVQAQQSLEQNLGKSVSVDTVRRALRDAGLVSFVRPKKPLINERNRKRRLQWARQHIDWTVNDWMNVIWSDETKINRFGSDGKSYAWKVPGQPLKKHHVRETVKHGGGSIMVWSCISWYGPGYIVDVGKNMTKDVYLEVLQDDLMKSLAWYMEESGKPTNQFIFMQDNDPKHTAKVVSKWLNEQDFHVMKWPPQSPDLNPIENMWQLLKRRLFRNYDCPPCGIHELWDRIGHTWYQITAEECQKFIKSMPDRCRAVIEADGFYIGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.47
3 0.41
4 0.4
5 0.39
6 0.38
7 0.35
8 0.43
9 0.39
10 0.33
11 0.39
12 0.4
13 0.45
14 0.48
15 0.46
16 0.4
17 0.4
18 0.38
19 0.37
20 0.42
21 0.42
22 0.38
23 0.42
24 0.4
25 0.37
26 0.38
27 0.38
28 0.32
29 0.31
30 0.31
31 0.3
32 0.29
33 0.29
34 0.27
35 0.24
36 0.24
37 0.23
38 0.3
39 0.32
40 0.35
41 0.38
42 0.45
43 0.54
44 0.63
45 0.65
46 0.64
47 0.66
48 0.7
49 0.76
50 0.7
51 0.69
52 0.67
53 0.61
54 0.53
55 0.44
56 0.37
57 0.28
58 0.26
59 0.17
60 0.1
61 0.1
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.06
68 0.06
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.12
73 0.13
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.12
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.23
88 0.21
89 0.19
90 0.21
91 0.2
92 0.14
93 0.17
94 0.16
95 0.15
96 0.21
97 0.22
98 0.22
99 0.22
100 0.23
101 0.27
102 0.35
103 0.45
104 0.48
105 0.58
106 0.66
107 0.75
108 0.84
109 0.83
110 0.79
111 0.73
112 0.73
113 0.72
114 0.72
115 0.71
116 0.71
117 0.72
118 0.7
119 0.68
120 0.58
121 0.52
122 0.42
123 0.36
124 0.3
125 0.24
126 0.22
127 0.2
128 0.18
129 0.14
130 0.14
131 0.11
132 0.06
133 0.06
134 0.08
135 0.1
136 0.12
137 0.13
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.16
142 0.18
143 0.19
144 0.21
145 0.2
146 0.17
147 0.2
148 0.21
149 0.23
150 0.22
151 0.19
152 0.17
153 0.24
154 0.3
155 0.3
156 0.35
157 0.37
158 0.43
159 0.48
160 0.5
161 0.47
162 0.51
163 0.5
164 0.5
165 0.54
166 0.55
167 0.49
168 0.46
169 0.41
170 0.31
171 0.28
172 0.22
173 0.15
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.08
207 0.06
208 0.06
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.08
216 0.13
217 0.13
218 0.16
219 0.17
220 0.19
221 0.19
222 0.2
223 0.19
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.2
228 0.19
229 0.24
230 0.27
231 0.28
232 0.3
233 0.31
234 0.29
235 0.24
236 0.26
237 0.24
238 0.24
239 0.28
240 0.34
241 0.38
242 0.4
243 0.44
244 0.48
245 0.48
246 0.44
247 0.4
248 0.39
249 0.33
250 0.32
251 0.33
252 0.27
253 0.26
254 0.32
255 0.34
256 0.28
257 0.32
258 0.35
259 0.32
260 0.41
261 0.44
262 0.39
263 0.35
264 0.34
265 0.32
266 0.29
267 0.28
268 0.21
269 0.2
270 0.21
271 0.29
272 0.34
273 0.37
274 0.42
275 0.49
276 0.55
277 0.56
278 0.64
279 0.66
280 0.69
281 0.65
282 0.61
283 0.55
284 0.51
285 0.5
286 0.4
287 0.36
288 0.34
289 0.36
290 0.38
291 0.39
292 0.36
293 0.32
294 0.34
295 0.29
296 0.23
297 0.2
298 0.18
299 0.17
300 0.18
301 0.19
302 0.22
303 0.29
304 0.28
305 0.27
306 0.29
307 0.28
308 0.27
309 0.27
310 0.32
311 0.33
312 0.42
313 0.5
314 0.57
315 0.59
316 0.59
317 0.62
318 0.53
319 0.48
320 0.44
321 0.38
322 0.3
323 0.28