Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RKB7

Protein Details
Accession E3RKB7    Localization Confidence High Confidence Score 26.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-58LETPTQAKRQRKTPAPRSSQNKAAAHydrophilic
150-175KPTPTLTKRGRGRPKKTPQKVSSPPQHydrophilic
313-332AAKREREEKKAKKLAKKAAKBasic
423-466QNKVLPPKVNRNTKNVREHWLKGRQVDKKNKKGLKPSARFAKMEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-167TLTKRGRGRPKKTP
300-305KRKARE
312-335QAAKREREEKKAKKLAKKAAKEAK
395-414RHIKFLERTEKPAKEVKKGK
438-470VREHWLKGRQVDKKNKKGLKPSARFAKMERRPH
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pte:PTT_08668  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVTTRGGTETPGAPTPTPRSSTRKTAGKRELEALETPTQAKRQRKTPAPRSSQNKAAANSDASAEEASQESADDVAAPTTEELGTPVVALSRESPDASSATEGKEDEAKTSHDAVFYTPAQRAGSVYETPATHRQPEGSPTPKAKEANVKPTPTLTKRGRGRPKKTPQKVSSPPQVVETPSKFNDEVPTSSYESSMAPILSQEAPPSAQPEKTHMHFDDDEESVVTKISPAANKIHEAPAVTESEAESVQDEDENEDDASDSENEAPEVVTTAAASSKAQAAQADADRAQKAQQAKEEAKRKAREELIATQQAAKREREEKKAKKLAKKAAKEAKAAAVPEEEEAAVKPRLDIDLSNGLLPASLLENIDDQRAPTPPPERRGVTEEQLRKEKLNRHIKFLERTEKPAKEVKKGKLNVAVLAQQNKVLPPKVNRNTKNVREHWLKGRQVDKKNKKGLKPSARFAKMERRPHVNRGFLRNGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.37
4 0.39
5 0.41
6 0.46
7 0.49
8 0.58
9 0.61
10 0.65
11 0.66
12 0.72
13 0.76
14 0.76
15 0.73
16 0.69
17 0.63
18 0.57
19 0.53
20 0.47
21 0.4
22 0.34
23 0.33
24 0.29
25 0.33
26 0.38
27 0.44
28 0.45
29 0.5
30 0.59
31 0.67
32 0.75
33 0.79
34 0.82
35 0.82
36 0.86
37 0.85
38 0.82
39 0.8
40 0.78
41 0.73
42 0.65
43 0.59
44 0.52
45 0.46
46 0.4
47 0.32
48 0.24
49 0.19
50 0.17
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.09
78 0.11
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.15
85 0.16
86 0.14
87 0.14
88 0.15
89 0.15
90 0.15
91 0.19
92 0.18
93 0.17
94 0.18
95 0.19
96 0.2
97 0.23
98 0.23
99 0.19
100 0.19
101 0.18
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.18
106 0.19
107 0.19
108 0.18
109 0.18
110 0.15
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.2
117 0.26
118 0.25
119 0.24
120 0.24
121 0.26
122 0.25
123 0.3
124 0.34
125 0.32
126 0.35
127 0.36
128 0.39
129 0.41
130 0.41
131 0.39
132 0.42
133 0.43
134 0.48
135 0.5
136 0.49
137 0.45
138 0.48
139 0.52
140 0.44
141 0.48
142 0.41
143 0.44
144 0.5
145 0.6
146 0.67
147 0.7
148 0.75
149 0.76
150 0.83
151 0.85
152 0.87
153 0.88
154 0.82
155 0.82
156 0.82
157 0.79
158 0.77
159 0.7
160 0.61
161 0.54
162 0.5
163 0.42
164 0.4
165 0.35
166 0.3
167 0.27
168 0.29
169 0.26
170 0.25
171 0.27
172 0.24
173 0.22
174 0.2
175 0.22
176 0.21
177 0.21
178 0.2
179 0.17
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.09
184 0.07
185 0.06
186 0.08
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.12
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.17
198 0.21
199 0.22
200 0.26
201 0.23
202 0.27
203 0.25
204 0.26
205 0.24
206 0.21
207 0.19
208 0.15
209 0.14
210 0.1
211 0.09
212 0.08
213 0.05
214 0.06
215 0.07
216 0.08
217 0.1
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.17
222 0.17
223 0.16
224 0.15
225 0.15
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.07
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.04
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.1
270 0.11
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.18
279 0.18
280 0.21
281 0.25
282 0.3
283 0.38
284 0.45
285 0.48
286 0.53
287 0.56
288 0.54
289 0.54
290 0.52
291 0.48
292 0.44
293 0.44
294 0.42
295 0.4
296 0.39
297 0.36
298 0.35
299 0.36
300 0.35
301 0.3
302 0.28
303 0.34
304 0.39
305 0.45
306 0.54
307 0.57
308 0.65
309 0.73
310 0.76
311 0.76
312 0.8
313 0.8
314 0.79
315 0.77
316 0.76
317 0.77
318 0.74
319 0.67
320 0.6
321 0.55
322 0.47
323 0.41
324 0.32
325 0.24
326 0.19
327 0.17
328 0.16
329 0.11
330 0.08
331 0.08
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.12
339 0.12
340 0.14
341 0.19
342 0.2
343 0.2
344 0.19
345 0.18
346 0.17
347 0.16
348 0.12
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.07
353 0.09
354 0.1
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.12
359 0.13
360 0.14
361 0.17
362 0.25
363 0.3
364 0.34
365 0.4
366 0.41
367 0.44
368 0.48
369 0.48
370 0.47
371 0.5
372 0.52
373 0.52
374 0.57
375 0.54
376 0.52
377 0.54
378 0.55
379 0.56
380 0.6
381 0.56
382 0.57
383 0.62
384 0.66
385 0.67
386 0.67
387 0.66
388 0.58
389 0.64
390 0.65
391 0.6
392 0.57
393 0.57
394 0.54
395 0.54
396 0.6
397 0.6
398 0.62
399 0.63
400 0.65
401 0.65
402 0.62
403 0.55
404 0.5
405 0.47
406 0.42
407 0.43
408 0.37
409 0.31
410 0.3
411 0.3
412 0.31
413 0.29
414 0.31
415 0.34
416 0.45
417 0.53
418 0.62
419 0.64
420 0.69
421 0.76
422 0.79
423 0.81
424 0.75
425 0.74
426 0.71
427 0.73
428 0.73
429 0.73
430 0.68
431 0.65
432 0.7
433 0.7
434 0.73
435 0.78
436 0.79
437 0.8
438 0.85
439 0.86
440 0.85
441 0.86
442 0.87
443 0.87
444 0.84
445 0.84
446 0.84
447 0.81
448 0.76
449 0.71
450 0.71
451 0.69
452 0.71
453 0.68
454 0.67
455 0.67
456 0.75
457 0.78
458 0.76
459 0.74
460 0.73
461 0.75