Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RHA9

Protein Details
Accession E3RHA9    Localization Confidence High Confidence Score 25.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MKLKRAKAYKKQLHQYELNFHydrophilic
209-252QATGEARPKAKKRKGPKGPNPLSVKKPKKDKTSAPRKARPSTSEHydrophilic
258-286DHRGDREDSAPKKRRRKHKSKAEGGDDAPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-190K
215-249RPKAKKRKGPKGPNPLSVKKPKKDKTSAPRKARPS
263-279REDSAPKKRRRKHKSKA
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006984  Fcf1/Utp23  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0070181  F:small ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG pte:PTT_07282  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04900  Fcf1  
CDD cd09865  PIN_ScUtp23p-like  
Amino Acid Sequences MKLKRAKAYKKQLHQYELNFGFREPYQVLLDSQILQDAYNFKIDLLARLQKMLGGQVKPMITTCDMRHLYNAKPKNETLILQAKEYERRRCNHQDLEEPLSSLECLSSVVDPKDNGTNKHRYVIASNDSSVRAKMRQVAGVPVIYISRSVVLMEPMADVTEQFREREEKSKFRLGLKGQRNPGNSDAPPKRKRVDEGQGAEGNQSIVDQATGEARPKAKKRKGPKGPNPLSVKKPKKDKTSAPRKARPSTSESTGGDDHRGDREDSAPKKRRRKHKSKAEGGDDAPGGEEPASP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.75
3 0.74
4 0.68
5 0.63
6 0.53
7 0.45
8 0.4
9 0.33
10 0.34
11 0.24
12 0.22
13 0.2
14 0.21
15 0.21
16 0.21
17 0.22
18 0.18
19 0.18
20 0.16
21 0.14
22 0.13
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.15
27 0.15
28 0.12
29 0.17
30 0.17
31 0.18
32 0.22
33 0.27
34 0.25
35 0.26
36 0.26
37 0.22
38 0.22
39 0.25
40 0.26
41 0.2
42 0.2
43 0.24
44 0.24
45 0.23
46 0.23
47 0.2
48 0.17
49 0.2
50 0.19
51 0.25
52 0.27
53 0.27
54 0.31
55 0.32
56 0.35
57 0.41
58 0.48
59 0.41
60 0.44
61 0.43
62 0.44
63 0.43
64 0.38
65 0.35
66 0.36
67 0.34
68 0.3
69 0.33
70 0.29
71 0.36
72 0.41
73 0.44
74 0.41
75 0.43
76 0.5
77 0.57
78 0.62
79 0.62
80 0.6
81 0.58
82 0.58
83 0.61
84 0.53
85 0.44
86 0.36
87 0.28
88 0.24
89 0.16
90 0.11
91 0.04
92 0.05
93 0.05
94 0.06
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.11
99 0.12
100 0.19
101 0.2
102 0.23
103 0.26
104 0.33
105 0.33
106 0.36
107 0.36
108 0.3
109 0.3
110 0.31
111 0.3
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.19
118 0.16
119 0.13
120 0.12
121 0.16
122 0.16
123 0.17
124 0.17
125 0.19
126 0.18
127 0.17
128 0.16
129 0.11
130 0.1
131 0.07
132 0.07
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.13
152 0.15
153 0.23
154 0.27
155 0.3
156 0.34
157 0.41
158 0.43
159 0.43
160 0.47
161 0.45
162 0.49
163 0.52
164 0.54
165 0.53
166 0.56
167 0.55
168 0.52
169 0.5
170 0.45
171 0.37
172 0.4
173 0.42
174 0.47
175 0.49
176 0.51
177 0.51
178 0.48
179 0.52
180 0.51
181 0.52
182 0.52
183 0.51
184 0.52
185 0.5
186 0.47
187 0.43
188 0.34
189 0.25
190 0.16
191 0.12
192 0.06
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.12
201 0.15
202 0.22
203 0.31
204 0.41
205 0.48
206 0.56
207 0.65
208 0.74
209 0.82
210 0.86
211 0.88
212 0.89
213 0.88
214 0.88
215 0.85
216 0.8
217 0.78
218 0.78
219 0.77
220 0.73
221 0.76
222 0.76
223 0.77
224 0.8
225 0.81
226 0.81
227 0.84
228 0.86
229 0.86
230 0.87
231 0.85
232 0.85
233 0.81
234 0.75
235 0.71
236 0.66
237 0.61
238 0.59
239 0.52
240 0.48
241 0.44
242 0.4
243 0.35
244 0.31
245 0.27
246 0.24
247 0.26
248 0.22
249 0.21
250 0.25
251 0.32
252 0.37
253 0.46
254 0.53
255 0.6
256 0.7
257 0.77
258 0.83
259 0.85
260 0.89
261 0.89
262 0.91
263 0.93
264 0.93
265 0.94
266 0.9
267 0.86
268 0.76
269 0.7
270 0.59
271 0.48
272 0.38
273 0.27
274 0.2