Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5ADN4

Protein Details
Accession Q5ADN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
541-566IKGDWDLLRRRVKRKKSEYNYMGPYQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
550-555RRVKRK
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 1, plas 1, extr 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR041373  RT_RNaseH  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004523  F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity  
GO:0015074  P:DNA integration  
KEGG cal:CAALFM_C306940WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17917  RT_RNaseH  
PF00665  rve  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50994  INTEGRASE  
CDD cd09274  RNase_HI_RT_Ty3  
Amino Acid Sequences MSVIADLPSLYAFDENKPVLVFTDASQLAIGAIITQEHLIQGQKSLVPVAMVSLRLSATQQRYSTLERELLTIVYVLQKYKQFMSREVQFYTDHQAITTIGSAKSEPANRIKRFIDIIQSFNPSIYFIPGQFNFIADFLSRYNLDKIPHELNEEAILNQTSSIYLPTLRTTEPIPLAPIQPVQRHHIHIDNLTDNQLQQIHDQLCGSYENNNSNELLPTDQFVILQDQFHVVLSSTQVVPVVTADTLANTATKVHEHHHASIRVTDYLVSKIQWHPNHKLLCTNVIRNCSVCQLSSTFETAHRELYPLTPTKTFSRWGLDFIGPLPMSDNLSCCLNAIEYVSGLIYSWPCSSPNSDVVISMLNLIRQVHSTPVEVITDNGSAFTSNATQSFCATAGISIKYASVYHPMSNGRMELGNKLLKKILKSMTDAYYTKWPQVLANAVMVYNSTPTTFNKTPYYLSIGISTDMSEFTTYLANEFEWKEGQLSQSSLLQDLHNDVQVRLAELDGVNKNVEKHNDLRVRRMAYINSMRQPFQKPASFIKGDWDLLRRRVKRKKSEYNYMGPYQIAKVLDKHAYVICDTNGNMINGTIHHDDLKYCYSFNDNSISRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.21
5 0.21
6 0.19
7 0.2
8 0.19
9 0.13
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.15
16 0.14
17 0.13
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.06
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.08
26 0.1
27 0.1
28 0.12
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.13
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.12
42 0.13
43 0.15
44 0.19
45 0.23
46 0.28
47 0.28
48 0.3
49 0.34
50 0.37
51 0.39
52 0.35
53 0.34
54 0.29
55 0.3
56 0.28
57 0.24
58 0.2
59 0.17
60 0.14
61 0.15
62 0.15
63 0.14
64 0.18
65 0.21
66 0.23
67 0.28
68 0.34
69 0.32
70 0.36
71 0.42
72 0.46
73 0.47
74 0.46
75 0.44
76 0.38
77 0.37
78 0.39
79 0.34
80 0.25
81 0.21
82 0.21
83 0.19
84 0.18
85 0.19
86 0.14
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.19
92 0.22
93 0.24
94 0.31
95 0.41
96 0.42
97 0.47
98 0.47
99 0.45
100 0.45
101 0.43
102 0.43
103 0.36
104 0.38
105 0.36
106 0.39
107 0.35
108 0.32
109 0.29
110 0.2
111 0.18
112 0.17
113 0.15
114 0.12
115 0.18
116 0.18
117 0.21
118 0.2
119 0.2
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.1
124 0.11
125 0.09
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.17
130 0.19
131 0.2
132 0.22
133 0.26
134 0.28
135 0.29
136 0.3
137 0.26
138 0.24
139 0.25
140 0.23
141 0.18
142 0.15
143 0.14
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.07
148 0.07
149 0.08
150 0.06
151 0.07
152 0.09
153 0.1
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.17
159 0.18
160 0.17
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.21
166 0.21
167 0.23
168 0.25
169 0.28
170 0.3
171 0.32
172 0.33
173 0.35
174 0.33
175 0.31
176 0.33
177 0.3
178 0.27
179 0.27
180 0.24
181 0.19
182 0.18
183 0.18
184 0.14
185 0.13
186 0.18
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.15
194 0.13
195 0.15
196 0.19
197 0.2
198 0.21
199 0.21
200 0.2
201 0.2
202 0.16
203 0.15
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.08
241 0.1
242 0.16
243 0.19
244 0.23
245 0.3
246 0.32
247 0.31
248 0.32
249 0.32
250 0.26
251 0.23
252 0.2
253 0.15
254 0.14
255 0.14
256 0.12
257 0.12
258 0.16
259 0.23
260 0.27
261 0.31
262 0.34
263 0.4
264 0.42
265 0.4
266 0.4
267 0.34
268 0.36
269 0.34
270 0.35
271 0.31
272 0.31
273 0.31
274 0.28
275 0.28
276 0.23
277 0.21
278 0.15
279 0.14
280 0.12
281 0.13
282 0.13
283 0.14
284 0.11
285 0.12
286 0.16
287 0.15
288 0.16
289 0.14
290 0.14
291 0.13
292 0.14
293 0.16
294 0.14
295 0.16
296 0.15
297 0.17
298 0.19
299 0.21
300 0.21
301 0.19
302 0.22
303 0.21
304 0.22
305 0.23
306 0.2
307 0.19
308 0.17
309 0.19
310 0.14
311 0.13
312 0.12
313 0.1
314 0.11
315 0.11
316 0.11
317 0.08
318 0.09
319 0.09
320 0.08
321 0.08
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.04
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.12
339 0.14
340 0.16
341 0.18
342 0.17
343 0.17
344 0.17
345 0.16
346 0.14
347 0.13
348 0.1
349 0.07
350 0.08
351 0.08
352 0.08
353 0.08
354 0.09
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.09
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.09
380 0.08
381 0.08
382 0.1
383 0.1
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.13
392 0.13
393 0.17
394 0.18
395 0.19
396 0.2
397 0.19
398 0.15
399 0.16
400 0.16
401 0.14
402 0.18
403 0.21
404 0.2
405 0.22
406 0.24
407 0.24
408 0.25
409 0.3
410 0.31
411 0.29
412 0.32
413 0.35
414 0.35
415 0.38
416 0.37
417 0.33
418 0.36
419 0.34
420 0.32
421 0.29
422 0.26
423 0.21
424 0.24
425 0.25
426 0.17
427 0.18
428 0.17
429 0.15
430 0.14
431 0.14
432 0.11
433 0.09
434 0.08
435 0.07
436 0.08
437 0.1
438 0.19
439 0.2
440 0.24
441 0.27
442 0.29
443 0.29
444 0.3
445 0.35
446 0.28
447 0.27
448 0.26
449 0.23
450 0.22
451 0.2
452 0.18
453 0.12
454 0.11
455 0.1
456 0.08
457 0.07
458 0.07
459 0.1
460 0.09
461 0.09
462 0.1
463 0.09
464 0.12
465 0.13
466 0.14
467 0.12
468 0.13
469 0.14
470 0.14
471 0.16
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.18
476 0.18
477 0.18
478 0.18
479 0.16
480 0.15
481 0.18
482 0.18
483 0.18
484 0.18
485 0.16
486 0.19
487 0.19
488 0.2
489 0.16
490 0.15
491 0.13
492 0.12
493 0.18
494 0.16
495 0.17
496 0.16
497 0.17
498 0.19
499 0.22
500 0.26
501 0.25
502 0.27
503 0.35
504 0.43
505 0.44
506 0.5
507 0.52
508 0.53
509 0.52
510 0.52
511 0.44
512 0.45
513 0.52
514 0.51
515 0.51
516 0.5
517 0.48
518 0.5
519 0.53
520 0.49
521 0.48
522 0.47
523 0.44
524 0.48
525 0.54
526 0.51
527 0.46
528 0.47
529 0.44
530 0.4
531 0.39
532 0.39
533 0.36
534 0.42
535 0.52
536 0.53
537 0.59
538 0.67
539 0.74
540 0.79
541 0.85
542 0.88
543 0.87
544 0.91
545 0.88
546 0.87
547 0.83
548 0.75
549 0.66
550 0.55
551 0.48
552 0.38
553 0.35
554 0.27
555 0.22
556 0.22
557 0.25
558 0.29
559 0.27
560 0.28
561 0.27
562 0.27
563 0.27
564 0.27
565 0.22
566 0.22
567 0.21
568 0.24
569 0.25
570 0.23
571 0.22
572 0.19
573 0.19
574 0.16
575 0.22
576 0.19
577 0.16
578 0.18
579 0.18
580 0.19
581 0.22
582 0.27
583 0.23
584 0.21
585 0.22
586 0.25
587 0.26
588 0.28
589 0.33