Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A8W9

Protein Details
Accession Q5A8W9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-50LFVPSNSLTNKRKRRIPPSKPRSSNRKDGDIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-44KRKRRIPPSKPRSSNR
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 14, nucl 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002885  Pentatricopeptide_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG cal:CAALFM_C603440WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01535  PPR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51375  PPR  
Amino Acid Sequences MIRLIRWNNVQSLVFKRCLFVPSNSLTNKRKRRIPPSKPRSSNRKDGDIEPYRMTDQNQTPNTGSIARLPAEVKKELKDLRSFTKVIAQHLKPEQENDSLTSAEKPDTSQLPPIDIEEATDDIFGEISGTKKLSANAVPPPPPPPGLDIPDEIKERLGLLSELLVPAKTSNNKLPEKQVENNWKLLLSQLDQAGGLSGLSKRSVSKFFSKIPPKNLKNLIPMIENMYNKAEMSIPHPIYYMFVRSLTLGDKISDSQMQLINKYFQEISKQTDLKIDHYETMILAYVKNNHMEKIDGILAQMKKKNIEISKMIYTSIVRGYIFYQKDHQRALDTFDSMKFLSQKTQPDEKVYTDVIVSCVMHREIERALDLYYELKDKGMNVNQNLLSTLAKGCSRSKQFKTQAWNFLFQVYDHGWVPNLQTYEHMLYIAARDGDVELTRVLFYKMLQTNSVTIRAFRYLILSYSKYVPPHKRKEKHLILLNHKGQLFRQNILQDVDFSKPVHGFPFLPSSHIPDSKFVLAESSAIWAHTVMNNPSFLRQQTLVASYVSIALELGDFTEFKDRFDSASYLNTDGIPKVREIEIIEPRQDEPTEKATTTEEQNASSETDNNSLIRSPILNQLQQNINDNQFKAPRDSYLYNLAIKAAGKFKNYGFAQEILHERGQFRKSNSFKLLSPKQQNQDDFQFAGYLVECWTNMNLLEDAYAVVLSSVDRFPWSWRELGVLNNAAMKLGSLELAEAVRKVAQVTQVKHHGKIKRQDFKTYVMKRGY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.39
3 0.38
4 0.36
5 0.38
6 0.38
7 0.34
8 0.35
9 0.34
10 0.42
11 0.45
12 0.51
13 0.55
14 0.61
15 0.68
16 0.69
17 0.74
18 0.76
19 0.83
20 0.86
21 0.89
22 0.9
23 0.9
24 0.93
25 0.93
26 0.93
27 0.92
28 0.89
29 0.88
30 0.84
31 0.82
32 0.75
33 0.69
34 0.7
35 0.68
36 0.64
37 0.56
38 0.52
39 0.46
40 0.44
41 0.42
42 0.4
43 0.39
44 0.44
45 0.44
46 0.45
47 0.44
48 0.43
49 0.43
50 0.36
51 0.3
52 0.25
53 0.26
54 0.23
55 0.23
56 0.23
57 0.26
58 0.29
59 0.34
60 0.32
61 0.31
62 0.38
63 0.41
64 0.45
65 0.47
66 0.47
67 0.49
68 0.52
69 0.5
70 0.43
71 0.47
72 0.43
73 0.44
74 0.48
75 0.42
76 0.44
77 0.49
78 0.54
79 0.47
80 0.48
81 0.44
82 0.39
83 0.39
84 0.34
85 0.3
86 0.25
87 0.24
88 0.23
89 0.21
90 0.18
91 0.17
92 0.15
93 0.18
94 0.21
95 0.22
96 0.26
97 0.25
98 0.27
99 0.27
100 0.27
101 0.24
102 0.2
103 0.19
104 0.14
105 0.15
106 0.12
107 0.12
108 0.1
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.06
113 0.06
114 0.07
115 0.09
116 0.09
117 0.11
118 0.12
119 0.14
120 0.17
121 0.2
122 0.23
123 0.29
124 0.34
125 0.36
126 0.35
127 0.38
128 0.36
129 0.34
130 0.31
131 0.29
132 0.28
133 0.29
134 0.3
135 0.3
136 0.3
137 0.33
138 0.34
139 0.29
140 0.24
141 0.2
142 0.18
143 0.16
144 0.14
145 0.1
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.09
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.14
155 0.16
156 0.2
157 0.26
158 0.34
159 0.39
160 0.41
161 0.49
162 0.52
163 0.55
164 0.56
165 0.59
166 0.61
167 0.59
168 0.59
169 0.51
170 0.43
171 0.36
172 0.33
173 0.27
174 0.18
175 0.18
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.13
181 0.1
182 0.08
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.08
187 0.09
188 0.1
189 0.14
190 0.19
191 0.22
192 0.29
193 0.33
194 0.38
195 0.47
196 0.55
197 0.58
198 0.64
199 0.7
200 0.66
201 0.69
202 0.7
203 0.65
204 0.61
205 0.58
206 0.51
207 0.42
208 0.39
209 0.36
210 0.34
211 0.29
212 0.25
213 0.23
214 0.21
215 0.19
216 0.19
217 0.15
218 0.1
219 0.14
220 0.21
221 0.2
222 0.2
223 0.21
224 0.2
225 0.2
226 0.21
227 0.19
228 0.12
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.11
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.13
243 0.16
244 0.16
245 0.17
246 0.18
247 0.19
248 0.18
249 0.2
250 0.17
251 0.15
252 0.2
253 0.2
254 0.24
255 0.28
256 0.29
257 0.27
258 0.32
259 0.32
260 0.29
261 0.32
262 0.28
263 0.22
264 0.22
265 0.21
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.11
273 0.12
274 0.17
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.17
279 0.16
280 0.15
281 0.16
282 0.11
283 0.11
284 0.16
285 0.17
286 0.2
287 0.23
288 0.21
289 0.21
290 0.22
291 0.29
292 0.26
293 0.28
294 0.27
295 0.29
296 0.32
297 0.31
298 0.3
299 0.24
300 0.22
301 0.19
302 0.17
303 0.14
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.18
308 0.18
309 0.18
310 0.24
311 0.28
312 0.31
313 0.32
314 0.3
315 0.26
316 0.26
317 0.3
318 0.25
319 0.21
320 0.19
321 0.18
322 0.19
323 0.16
324 0.17
325 0.13
326 0.12
327 0.15
328 0.18
329 0.23
330 0.27
331 0.33
332 0.33
333 0.36
334 0.37
335 0.34
336 0.33
337 0.28
338 0.23
339 0.16
340 0.16
341 0.12
342 0.11
343 0.09
344 0.06
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.12
365 0.15
366 0.18
367 0.18
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.22
372 0.18
373 0.14
374 0.11
375 0.11
376 0.08
377 0.08
378 0.1
379 0.12
380 0.17
381 0.23
382 0.31
383 0.34
384 0.43
385 0.48
386 0.51
387 0.59
388 0.59
389 0.62
390 0.56
391 0.55
392 0.45
393 0.4
394 0.36
395 0.26
396 0.23
397 0.15
398 0.14
399 0.11
400 0.11
401 0.1
402 0.11
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.09
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.09
413 0.08
414 0.09
415 0.09
416 0.07
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.13
431 0.16
432 0.17
433 0.18
434 0.18
435 0.21
436 0.22
437 0.25
438 0.18
439 0.15
440 0.16
441 0.16
442 0.16
443 0.13
444 0.14
445 0.11
446 0.13
447 0.16
448 0.15
449 0.15
450 0.18
451 0.2
452 0.2
453 0.27
454 0.36
455 0.42
456 0.52
457 0.61
458 0.65
459 0.71
460 0.79
461 0.8
462 0.78
463 0.76
464 0.74
465 0.71
466 0.74
467 0.69
468 0.62
469 0.54
470 0.46
471 0.39
472 0.39
473 0.34
474 0.25
475 0.26
476 0.23
477 0.24
478 0.26
479 0.25
480 0.18
481 0.18
482 0.18
483 0.16
484 0.15
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.14
490 0.13
491 0.13
492 0.19
493 0.18
494 0.2
495 0.2
496 0.24
497 0.27
498 0.29
499 0.28
500 0.23
501 0.27
502 0.25
503 0.25
504 0.19
505 0.16
506 0.13
507 0.13
508 0.11
509 0.1
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.07
514 0.08
515 0.09
516 0.12
517 0.12
518 0.14
519 0.15
520 0.16
521 0.17
522 0.19
523 0.17
524 0.18
525 0.17
526 0.17
527 0.17
528 0.19
529 0.18
530 0.16
531 0.16
532 0.12
533 0.13
534 0.11
535 0.09
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.05
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.17
548 0.17
549 0.17
550 0.2
551 0.22
552 0.15
553 0.2
554 0.21
555 0.2
556 0.21
557 0.2
558 0.18
559 0.18
560 0.19
561 0.15
562 0.13
563 0.14
564 0.14
565 0.15
566 0.16
567 0.22
568 0.28
569 0.3
570 0.32
571 0.31
572 0.31
573 0.32
574 0.31
575 0.26
576 0.21
577 0.23
578 0.25
579 0.23
580 0.24
581 0.24
582 0.26
583 0.27
584 0.31
585 0.26
586 0.24
587 0.25
588 0.25
589 0.24
590 0.22
591 0.21
592 0.16
593 0.17
594 0.17
595 0.17
596 0.16
597 0.15
598 0.15
599 0.13
600 0.12
601 0.12
602 0.19
603 0.24
604 0.27
605 0.27
606 0.32
607 0.36
608 0.37
609 0.41
610 0.35
611 0.37
612 0.37
613 0.37
614 0.36
615 0.35
616 0.35
617 0.35
618 0.33
619 0.3
620 0.33
621 0.34
622 0.33
623 0.36
624 0.37
625 0.33
626 0.32
627 0.29
628 0.24
629 0.23
630 0.23
631 0.22
632 0.22
633 0.23
634 0.25
635 0.25
636 0.33
637 0.32
638 0.34
639 0.3
640 0.29
641 0.28
642 0.3
643 0.33
644 0.29
645 0.3
646 0.28
647 0.26
648 0.3
649 0.34
650 0.35
651 0.36
652 0.42
653 0.44
654 0.51
655 0.57
656 0.53
657 0.52
658 0.57
659 0.61
660 0.61
661 0.66
662 0.66
663 0.68
664 0.72
665 0.72
666 0.68
667 0.65
668 0.59
669 0.5
670 0.42
671 0.35
672 0.27
673 0.25
674 0.19
675 0.13
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.1
680 0.11
681 0.11
682 0.11
683 0.13
684 0.12
685 0.11
686 0.11
687 0.1
688 0.09
689 0.09
690 0.08
691 0.05
692 0.05
693 0.05
694 0.05
695 0.07
696 0.07
697 0.08
698 0.1
699 0.11
700 0.15
701 0.22
702 0.24
703 0.23
704 0.23
705 0.26
706 0.26
707 0.29
708 0.32
709 0.27
710 0.25
711 0.27
712 0.26
713 0.23
714 0.21
715 0.17
716 0.12
717 0.09
718 0.09
719 0.07
720 0.07
721 0.08
722 0.09
723 0.1
724 0.09
725 0.1
726 0.1
727 0.11
728 0.12
729 0.13
730 0.21
731 0.28
732 0.32
733 0.39
734 0.48
735 0.52
736 0.56
737 0.61
738 0.61
739 0.62
740 0.69
741 0.71
742 0.71
743 0.72
744 0.76
745 0.72
746 0.73
747 0.74
748 0.71