Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G7DTM1

Protein Details
Accession G7DTM1    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-26LRTALEKRKNVQKTSKTKGKHVKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-25KTSKTKGKHVK
276-297DEAKKAKIAQRLLSREAKKRAK
314-335KRKRAAPASEEPVLKKANKRAK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MGLRTALEKRKNVQKTSKTKGKHVKSAEEPVVEPKSILKKPKVKQSVLAALAEDGVDRPASIKKGKGKAVVSSSVSAEAPTVTFDTAPAKESAKDPNDFVALGLPTSDDEDSSDDDRQADDEAIRKAKSELSQGLADSMPKLNKSDEAVRQRLDKAKKDPNQKPGVIYLGRLPRAFAEKEMRSYFGQFGEVTRLRLARSTKTGGSKHYGYIEFAHESVAEIVAETMNNYLLAGHLLQCKVVPPAEVHPRLWIGANKKSGLISPGFAARTAHNAPKDEAKKAKIAQRLLSREAKKRAKLTQQGIEYDFEGYAASKRKRAAPASEEPVLKKANKRAKTTKATLISA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.76
3 0.81
4 0.83
5 0.77
6 0.79
7 0.82
8 0.8
9 0.79
10 0.76
11 0.75
12 0.73
13 0.77
14 0.72
15 0.64
16 0.57
17 0.54
18 0.5
19 0.41
20 0.34
21 0.3
22 0.34
23 0.37
24 0.43
25 0.46
26 0.52
27 0.59
28 0.7
29 0.73
30 0.67
31 0.69
32 0.69
33 0.69
34 0.62
35 0.56
36 0.45
37 0.36
38 0.33
39 0.26
40 0.18
41 0.09
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.07
46 0.1
47 0.15
48 0.17
49 0.23
50 0.31
51 0.39
52 0.44
53 0.5
54 0.49
55 0.51
56 0.53
57 0.52
58 0.46
59 0.4
60 0.36
61 0.3
62 0.28
63 0.21
64 0.16
65 0.11
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.11
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.14
77 0.15
78 0.17
79 0.25
80 0.25
81 0.26
82 0.25
83 0.26
84 0.25
85 0.24
86 0.22
87 0.17
88 0.13
89 0.11
90 0.1
91 0.08
92 0.07
93 0.09
94 0.09
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.11
99 0.13
100 0.14
101 0.12
102 0.13
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.09
108 0.12
109 0.14
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.19
115 0.2
116 0.21
117 0.2
118 0.21
119 0.22
120 0.21
121 0.22
122 0.18
123 0.16
124 0.13
125 0.13
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.11
130 0.13
131 0.16
132 0.2
133 0.26
134 0.32
135 0.34
136 0.34
137 0.36
138 0.37
139 0.42
140 0.41
141 0.4
142 0.4
143 0.47
144 0.52
145 0.61
146 0.64
147 0.66
148 0.67
149 0.62
150 0.55
151 0.47
152 0.45
153 0.35
154 0.29
155 0.25
156 0.23
157 0.24
158 0.22
159 0.21
160 0.17
161 0.21
162 0.2
163 0.18
164 0.2
165 0.19
166 0.24
167 0.24
168 0.26
169 0.23
170 0.24
171 0.23
172 0.16
173 0.17
174 0.12
175 0.12
176 0.17
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.15
182 0.19
183 0.21
184 0.17
185 0.21
186 0.23
187 0.25
188 0.31
189 0.33
190 0.32
191 0.35
192 0.33
193 0.3
194 0.31
195 0.28
196 0.23
197 0.23
198 0.22
199 0.18
200 0.17
201 0.16
202 0.11
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.05
220 0.07
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.11
229 0.1
230 0.17
231 0.26
232 0.29
233 0.28
234 0.29
235 0.29
236 0.29
237 0.3
238 0.28
239 0.24
240 0.28
241 0.32
242 0.3
243 0.3
244 0.3
245 0.28
246 0.27
247 0.22
248 0.16
249 0.14
250 0.17
251 0.16
252 0.16
253 0.17
254 0.14
255 0.2
256 0.22
257 0.26
258 0.26
259 0.28
260 0.29
261 0.38
262 0.4
263 0.41
264 0.44
265 0.41
266 0.45
267 0.48
268 0.53
269 0.5
270 0.52
271 0.52
272 0.56
273 0.58
274 0.58
275 0.62
276 0.61
277 0.63
278 0.68
279 0.69
280 0.67
281 0.68
282 0.7
283 0.72
284 0.75
285 0.74
286 0.72
287 0.68
288 0.66
289 0.61
290 0.54
291 0.44
292 0.36
293 0.28
294 0.19
295 0.15
296 0.11
297 0.14
298 0.21
299 0.23
300 0.26
301 0.29
302 0.37
303 0.44
304 0.49
305 0.53
306 0.52
307 0.59
308 0.61
309 0.64
310 0.6
311 0.54
312 0.53
313 0.49
314 0.46
315 0.44
316 0.47
317 0.51
318 0.56
319 0.64
320 0.69
321 0.75
322 0.8
323 0.79
324 0.79