Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G7E7T1

Protein Details
Accession G7E7T1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-340EEKVSMFKKRKAPEHLKQRPGIVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
324-344KKRKAPEHLKQRPGIVKLKVR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000690  Matrin/U1-C_Znf_C2H2  
IPR003604  Matrin/U1-like-C_Znf_C2H2  
IPR013085  U1-CZ_Znf_C2H2  
IPR040023  WBP4  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06220  zf-U1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50171  ZF_MATRIN  
Amino Acid Sequences MADYWVSTKKHYCKVCNVHINDDKPSRTQHETGLRHKGNMERYVKSIYKKSEQDAKEKRTNEREMRKIESAAMASMPALPPPPRSTQATAPAAPSQAWKPSAAGYSSALSLGLVNQEEIERHSQAMREASEARVGQWQTVASTSARPARPPRPIPAREQEEEGVSYRTLTERRLETDDDDEEFDLGSITIKKRDTPAPSRYRMNAIPLAPVTGAWTESAKVAVKQEHIPLLPGQAEMERMVAAAQAQQIARDQKMPRITIKNEIKTEQVEPEPDADDIKPELSDTKPALVDTKPNLTDITPEAEETKPVISAGPPAEEKVSMFKKRKAPEHLKQRPGIVKLKVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.76
3 0.77
4 0.73
5 0.75
6 0.75
7 0.71
8 0.68
9 0.65
10 0.57
11 0.5
12 0.52
13 0.48
14 0.46
15 0.45
16 0.45
17 0.5
18 0.55
19 0.59
20 0.65
21 0.6
22 0.56
23 0.57
24 0.55
25 0.52
26 0.54
27 0.51
28 0.43
29 0.44
30 0.5
31 0.5
32 0.5
33 0.49
34 0.47
35 0.5
36 0.52
37 0.54
38 0.57
39 0.56
40 0.61
41 0.64
42 0.66
43 0.65
44 0.65
45 0.68
46 0.67
47 0.73
48 0.72
49 0.72
50 0.72
51 0.7
52 0.72
53 0.67
54 0.59
55 0.51
56 0.44
57 0.35
58 0.27
59 0.22
60 0.15
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.08
65 0.1
66 0.1
67 0.13
68 0.17
69 0.22
70 0.24
71 0.29
72 0.32
73 0.35
74 0.43
75 0.45
76 0.42
77 0.39
78 0.37
79 0.33
80 0.3
81 0.26
82 0.2
83 0.19
84 0.19
85 0.18
86 0.17
87 0.18
88 0.2
89 0.19
90 0.18
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.11
96 0.09
97 0.08
98 0.07
99 0.07
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.07
105 0.09
106 0.11
107 0.1
108 0.11
109 0.12
110 0.12
111 0.14
112 0.17
113 0.15
114 0.15
115 0.16
116 0.16
117 0.19
118 0.18
119 0.17
120 0.19
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.15
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.17
132 0.17
133 0.19
134 0.25
135 0.3
136 0.38
137 0.4
138 0.46
139 0.49
140 0.51
141 0.54
142 0.57
143 0.57
144 0.49
145 0.49
146 0.42
147 0.33
148 0.31
149 0.26
150 0.18
151 0.12
152 0.11
153 0.09
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.12
159 0.15
160 0.18
161 0.18
162 0.18
163 0.2
164 0.2
165 0.17
166 0.17
167 0.14
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.06
175 0.07
176 0.1
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.2
181 0.26
182 0.32
183 0.41
184 0.45
185 0.49
186 0.52
187 0.5
188 0.5
189 0.44
190 0.41
191 0.36
192 0.28
193 0.26
194 0.23
195 0.22
196 0.17
197 0.16
198 0.13
199 0.09
200 0.09
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.17
212 0.19
213 0.21
214 0.2
215 0.2
216 0.18
217 0.18
218 0.16
219 0.13
220 0.12
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.13
236 0.16
237 0.16
238 0.21
239 0.22
240 0.25
241 0.31
242 0.33
243 0.36
244 0.41
245 0.43
246 0.47
247 0.55
248 0.56
249 0.54
250 0.53
251 0.49
252 0.44
253 0.44
254 0.38
255 0.31
256 0.25
257 0.23
258 0.23
259 0.22
260 0.2
261 0.19
262 0.15
263 0.15
264 0.13
265 0.13
266 0.11
267 0.1
268 0.13
269 0.12
270 0.18
271 0.17
272 0.19
273 0.2
274 0.2
275 0.22
276 0.21
277 0.26
278 0.25
279 0.31
280 0.28
281 0.28
282 0.29
283 0.26
284 0.28
285 0.24
286 0.26
287 0.18
288 0.19
289 0.21
290 0.2
291 0.21
292 0.19
293 0.18
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.15
299 0.16
300 0.19
301 0.19
302 0.2
303 0.21
304 0.21
305 0.21
306 0.25
307 0.32
308 0.37
309 0.42
310 0.49
311 0.56
312 0.64
313 0.72
314 0.74
315 0.76
316 0.77
317 0.82
318 0.85
319 0.85
320 0.81
321 0.8
322 0.77
323 0.73
324 0.71