Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G7DT34

Protein Details
Accession G7DT34    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-34VASTSTAHLKKKRRAERQLKPDANSSKHydrophilic
207-235RYDPDRAVPRPREKKRKRKERNNSQDHVLBasic
388-410LAVPVSSKGSKKHKKKRKDLVDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-22KKKRRA
214-227VPRPREKKRKRKER
395-405KGSKKHKKKRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 10.5, mito 5, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MVEPHQPVASTSTAHLKKKRRAERQLKPDANSSKLVDNQLTQSRWQSDERKHDVQGPAESEQSKEPRQTTTERAGRSQVSKVPPHSALHWIVASMRIPLAPVFMGDPDEGIRQWLDSYLMRYLPSLGGVLLSYELPVRHKDARAAMVPSTGFLDLQFDVDALVFRPELLTRLEGRITNSTPGHISLLVYDLFNASIARQHIDLRAYRYDPDRAVPRPREKKRKRKERNNSQDHVLFETADYEATSDSQGDAGLLRPDPTVPLEDTMHSEQGQWVHRKTNEVLGDQTGHLSFTVVGLTFANLMISIKGSLLQNPAEPPEEREHDDDENQTRAGRLHLDEDIPATELREETVSFEPAPAKAIMSREDAQINHPSDGRAGHNQLDATIADLAVPVSSKGSKKHKKKRKDLVDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.47
3 0.53
4 0.61
5 0.7
6 0.79
7 0.8
8 0.84
9 0.88
10 0.9
11 0.91
12 0.93
13 0.89
14 0.82
15 0.81
16 0.75
17 0.68
18 0.62
19 0.53
20 0.47
21 0.45
22 0.45
23 0.38
24 0.34
25 0.37
26 0.4
27 0.39
28 0.35
29 0.37
30 0.37
31 0.38
32 0.42
33 0.45
34 0.46
35 0.55
36 0.61
37 0.6
38 0.58
39 0.62
40 0.6
41 0.56
42 0.53
43 0.46
44 0.4
45 0.39
46 0.38
47 0.32
48 0.33
49 0.34
50 0.33
51 0.34
52 0.33
53 0.33
54 0.37
55 0.41
56 0.41
57 0.46
58 0.48
59 0.46
60 0.47
61 0.47
62 0.47
63 0.45
64 0.43
65 0.4
66 0.4
67 0.43
68 0.43
69 0.45
70 0.44
71 0.42
72 0.39
73 0.39
74 0.34
75 0.31
76 0.28
77 0.23
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.13
82 0.12
83 0.09
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.1
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.13
111 0.12
112 0.1
113 0.08
114 0.07
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.05
119 0.05
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.14
125 0.17
126 0.19
127 0.22
128 0.24
129 0.28
130 0.29
131 0.29
132 0.25
133 0.23
134 0.22
135 0.19
136 0.17
137 0.13
138 0.1
139 0.08
140 0.1
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.07
148 0.05
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.14
160 0.14
161 0.16
162 0.19
163 0.19
164 0.21
165 0.19
166 0.18
167 0.18
168 0.17
169 0.16
170 0.12
171 0.11
172 0.07
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.04
182 0.06
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.11
188 0.13
189 0.15
190 0.16
191 0.18
192 0.18
193 0.19
194 0.21
195 0.22
196 0.2
197 0.21
198 0.22
199 0.24
200 0.31
201 0.36
202 0.44
203 0.52
204 0.61
205 0.69
206 0.75
207 0.82
208 0.85
209 0.9
210 0.91
211 0.92
212 0.94
213 0.94
214 0.95
215 0.93
216 0.85
217 0.78
218 0.71
219 0.6
220 0.52
221 0.41
222 0.29
223 0.2
224 0.18
225 0.13
226 0.09
227 0.08
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.1
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.17
252 0.18
253 0.18
254 0.16
255 0.16
256 0.15
257 0.19
258 0.24
259 0.24
260 0.24
261 0.29
262 0.3
263 0.33
264 0.33
265 0.36
266 0.34
267 0.31
268 0.31
269 0.27
270 0.27
271 0.23
272 0.23
273 0.15
274 0.12
275 0.1
276 0.09
277 0.08
278 0.06
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.08
294 0.08
295 0.1
296 0.13
297 0.14
298 0.15
299 0.16
300 0.18
301 0.19
302 0.19
303 0.21
304 0.24
305 0.27
306 0.29
307 0.3
308 0.32
309 0.32
310 0.33
311 0.34
312 0.31
313 0.3
314 0.27
315 0.25
316 0.22
317 0.2
318 0.19
319 0.18
320 0.16
321 0.17
322 0.19
323 0.19
324 0.19
325 0.19
326 0.18
327 0.16
328 0.15
329 0.12
330 0.11
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.1
335 0.13
336 0.15
337 0.17
338 0.16
339 0.18
340 0.18
341 0.17
342 0.2
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.18
347 0.19
348 0.23
349 0.25
350 0.25
351 0.28
352 0.28
353 0.29
354 0.35
355 0.35
356 0.31
357 0.3
358 0.28
359 0.26
360 0.28
361 0.29
362 0.28
363 0.28
364 0.29
365 0.31
366 0.31
367 0.29
368 0.28
369 0.23
370 0.18
371 0.15
372 0.12
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.07
377 0.08
378 0.06
379 0.08
380 0.13
381 0.16
382 0.25
383 0.36
384 0.46
385 0.57
386 0.68
387 0.76
388 0.82
389 0.91
390 0.94