Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G7E9Q3

Protein Details
Accession G7E9Q3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-25LSKLSRGILKRHRKEPPSLTHydrophilic
324-344SSKNAPSKKIIKKAQPKVEAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
329-368PSKKIIKKAQPKVEAKPTSSINIKATGKKPGKPVEPARSG
Subcellular Location(s) nucl 10.5, mito 10, cyto_nucl 7.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MSAYNLSKLSRGILKRHRKEPPSLTVHLHQNHFRFEHLAGTFTFDSPLKIFLDAMREQRLPHEMLDILDASAVPFYDGCLIVQVHDHRSVTPNASASTSAAKRTGPAGFDPNGPLTSASSQAGAASKEAEVSTSATANKAEVSRLVLTPDSSTLWLDLLALNQAKNSQWTEQDALQNEAVILALTCPPLCLAPTIEVTRLAHDALASSASSLLPSQTKTGPTETEAEEERRLQRERIMRIMDDRFGKDFAPSFDRIAFVQSWHERQKEAERTKQKPNLTPAEAAAKGIQAAAHAAAGMAYPGRPHMSLQGSTSGSSPAASITMSSKNAPSKKIIKKAQPKVEAKPTSSINIKATGKKPGKPVEPARSGSQSSGKPVKRSGSVTTSREASVADISVGNDISFGASTPQGNDLAVGIGLNGLQLPARLDFSNAPAQSWN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.64
3 0.73
4 0.79
5 0.76
6 0.81
7 0.8
8 0.79
9 0.76
10 0.71
11 0.67
12 0.64
13 0.67
14 0.64
15 0.6
16 0.57
17 0.53
18 0.54
19 0.5
20 0.45
21 0.38
22 0.33
23 0.35
24 0.29
25 0.27
26 0.21
27 0.26
28 0.26
29 0.23
30 0.25
31 0.18
32 0.19
33 0.18
34 0.2
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.21
40 0.22
41 0.26
42 0.29
43 0.29
44 0.29
45 0.32
46 0.34
47 0.29
48 0.26
49 0.25
50 0.2
51 0.2
52 0.21
53 0.18
54 0.14
55 0.12
56 0.11
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.16
70 0.18
71 0.19
72 0.22
73 0.23
74 0.21
75 0.25
76 0.28
77 0.26
78 0.26
79 0.24
80 0.22
81 0.22
82 0.22
83 0.19
84 0.23
85 0.21
86 0.2
87 0.2
88 0.19
89 0.19
90 0.21
91 0.23
92 0.17
93 0.19
94 0.22
95 0.22
96 0.24
97 0.25
98 0.24
99 0.21
100 0.2
101 0.18
102 0.15
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.11
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.09
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.07
145 0.06
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.11
153 0.13
154 0.12
155 0.13
156 0.16
157 0.18
158 0.21
159 0.24
160 0.23
161 0.24
162 0.22
163 0.2
164 0.17
165 0.14
166 0.11
167 0.07
168 0.05
169 0.03
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.08
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.13
187 0.11
188 0.09
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.17
210 0.16
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.16
215 0.18
216 0.18
217 0.2
218 0.21
219 0.2
220 0.24
221 0.28
222 0.3
223 0.34
224 0.33
225 0.29
226 0.33
227 0.34
228 0.32
229 0.28
230 0.26
231 0.21
232 0.2
233 0.2
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.17
242 0.16
243 0.17
244 0.15
245 0.11
246 0.16
247 0.17
248 0.22
249 0.26
250 0.27
251 0.25
252 0.27
253 0.35
254 0.39
255 0.43
256 0.47
257 0.52
258 0.56
259 0.65
260 0.69
261 0.65
262 0.61
263 0.63
264 0.61
265 0.55
266 0.51
267 0.43
268 0.41
269 0.37
270 0.31
271 0.24
272 0.16
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.03
286 0.03
287 0.03
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.13
293 0.17
294 0.18
295 0.2
296 0.24
297 0.23
298 0.24
299 0.24
300 0.19
301 0.15
302 0.14
303 0.12
304 0.07
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.08
309 0.12
310 0.14
311 0.15
312 0.18
313 0.25
314 0.28
315 0.3
316 0.34
317 0.4
318 0.48
319 0.56
320 0.61
321 0.64
322 0.71
323 0.79
324 0.83
325 0.82
326 0.79
327 0.77
328 0.79
329 0.74
330 0.66
331 0.61
332 0.53
333 0.48
334 0.46
335 0.42
336 0.34
337 0.36
338 0.37
339 0.4
340 0.4
341 0.46
342 0.48
343 0.49
344 0.55
345 0.56
346 0.58
347 0.59
348 0.66
349 0.66
350 0.67
351 0.66
352 0.63
353 0.59
354 0.55
355 0.49
356 0.47
357 0.39
358 0.39
359 0.45
360 0.44
361 0.43
362 0.46
363 0.48
364 0.47
365 0.49
366 0.47
367 0.47
368 0.51
369 0.5
370 0.49
371 0.46
372 0.41
373 0.37
374 0.32
375 0.24
376 0.18
377 0.15
378 0.13
379 0.11
380 0.11
381 0.12
382 0.12
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.08
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.09
391 0.1
392 0.12
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.12
398 0.11
399 0.1
400 0.09
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.07
410 0.09
411 0.12
412 0.12
413 0.15
414 0.17
415 0.22
416 0.3
417 0.28