Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G7E1D3

Protein Details
Accession G7E1D3    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAGGKRFYKNKDKAKQAQHAPPGDHydrophilic
323-344LADDQPKPKQPRRTNTNASDQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
251-270RAAKRNAKASTSSQKKKAGK
363-372PKRAPSKAKP
405-417QARGRGRGRGRGR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MAGGKRFYKNKDKAKQAQHAPPGDQTQEYIGGHAIRTKEPAAPLGPDKPRQKIVVRHLPPNLPEHLFWKSVQQALPGVQLSASTDTAPTTHDAPEQVHEAQPSPSVIDWQAYYPGKLRKSKGQEDVPSRAYLHFTELDTLVAFCSAYDGHMFRDSAGNVSRAQVEFAPYQKLPLPQTEAKADPKQNSILEDTDFTVFVETLRAPERAETADGASAAAAAAAASKDAKKSTPLLEYLRKQRATDLAAREQARAAKRNAKASTSSQKKKAGKLAKNTEMSEAQIVTDAPPKSSKGKGKQIIQRDNLPPPAGPDAVITEPQAGQILADDQPKPKQPRRTNTNASDQAAQRRQLGAALGAALGTGPPKRAPSKAKPKQAASTHEDGPPVTSETRTDSPTPSAASVGRGQARGRGRGRGRGRGTEQSSAGNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.88
3 0.86
4 0.86
5 0.84
6 0.79
7 0.72
8 0.67
9 0.62
10 0.54
11 0.45
12 0.37
13 0.3
14 0.3
15 0.27
16 0.22
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.2
21 0.2
22 0.17
23 0.2
24 0.21
25 0.23
26 0.23
27 0.26
28 0.25
29 0.27
30 0.3
31 0.35
32 0.4
33 0.45
34 0.49
35 0.51
36 0.54
37 0.55
38 0.58
39 0.59
40 0.62
41 0.65
42 0.64
43 0.66
44 0.66
45 0.66
46 0.61
47 0.56
48 0.5
49 0.42
50 0.38
51 0.34
52 0.33
53 0.3
54 0.28
55 0.3
56 0.29
57 0.3
58 0.31
59 0.29
60 0.27
61 0.27
62 0.3
63 0.24
64 0.2
65 0.15
66 0.14
67 0.14
68 0.15
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.18
82 0.2
83 0.2
84 0.19
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.18
89 0.16
90 0.14
91 0.12
92 0.13
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.18
98 0.17
99 0.18
100 0.22
101 0.27
102 0.33
103 0.38
104 0.41
105 0.43
106 0.52
107 0.58
108 0.61
109 0.63
110 0.65
111 0.65
112 0.68
113 0.61
114 0.53
115 0.47
116 0.39
117 0.33
118 0.25
119 0.22
120 0.18
121 0.16
122 0.17
123 0.16
124 0.15
125 0.13
126 0.13
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.04
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.14
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.14
146 0.15
147 0.16
148 0.13
149 0.14
150 0.12
151 0.14
152 0.14
153 0.15
154 0.18
155 0.15
156 0.17
157 0.19
158 0.22
159 0.2
160 0.21
161 0.26
162 0.24
163 0.27
164 0.28
165 0.28
166 0.3
167 0.35
168 0.36
169 0.31
170 0.31
171 0.32
172 0.3
173 0.29
174 0.26
175 0.21
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.1
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.05
202 0.04
203 0.03
204 0.03
205 0.02
206 0.02
207 0.02
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.11
216 0.14
217 0.16
218 0.19
219 0.23
220 0.29
221 0.34
222 0.4
223 0.45
224 0.44
225 0.41
226 0.4
227 0.39
228 0.36
229 0.37
230 0.34
231 0.3
232 0.35
233 0.36
234 0.34
235 0.31
236 0.32
237 0.3
238 0.29
239 0.28
240 0.31
241 0.33
242 0.41
243 0.41
244 0.39
245 0.39
246 0.41
247 0.47
248 0.49
249 0.52
250 0.51
251 0.58
252 0.6
253 0.62
254 0.64
255 0.64
256 0.61
257 0.66
258 0.68
259 0.67
260 0.67
261 0.63
262 0.57
263 0.47
264 0.41
265 0.32
266 0.23
267 0.15
268 0.12
269 0.11
270 0.09
271 0.14
272 0.14
273 0.13
274 0.15
275 0.17
276 0.2
277 0.27
278 0.34
279 0.37
280 0.47
281 0.53
282 0.6
283 0.65
284 0.72
285 0.74
286 0.69
287 0.68
288 0.63
289 0.61
290 0.55
291 0.49
292 0.39
293 0.32
294 0.32
295 0.24
296 0.2
297 0.16
298 0.16
299 0.16
300 0.17
301 0.14
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.09
307 0.07
308 0.07
309 0.08
310 0.1
311 0.13
312 0.14
313 0.16
314 0.21
315 0.29
316 0.37
317 0.42
318 0.51
319 0.57
320 0.67
321 0.73
322 0.79
323 0.8
324 0.78
325 0.81
326 0.77
327 0.7
328 0.65
329 0.6
330 0.59
331 0.55
332 0.5
333 0.42
334 0.37
335 0.35
336 0.3
337 0.28
338 0.19
339 0.14
340 0.12
341 0.1
342 0.08
343 0.08
344 0.06
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.1
350 0.15
351 0.19
352 0.26
353 0.35
354 0.44
355 0.55
356 0.63
357 0.72
358 0.75
359 0.78
360 0.8
361 0.78
362 0.75
363 0.71
364 0.66
365 0.59
366 0.53
367 0.49
368 0.39
369 0.34
370 0.28
371 0.25
372 0.21
373 0.18
374 0.17
375 0.23
376 0.26
377 0.28
378 0.28
379 0.28
380 0.3
381 0.32
382 0.33
383 0.27
384 0.26
385 0.23
386 0.24
387 0.25
388 0.28
389 0.29
390 0.3
391 0.29
392 0.34
393 0.39
394 0.45
395 0.45
396 0.48
397 0.49
398 0.57
399 0.64
400 0.67
401 0.67
402 0.68
403 0.71
404 0.71
405 0.71
406 0.67
407 0.61