Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2XCI4

Protein Details
Accession A0A0D2XCI4    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-304WTTTTHGGRRKKRKGALTDNSSHydrophilic
368-392LGNFTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
290-296GRRKKRK
396-408KGLGPARIRGRIK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
KEGG fox:FOXG_01607  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPRKWIDKKSAQHFTLVHRPQNDPLIHDENAPAMVLNPTQTKKGSSKSKDLDDLASELGYEAEDVRANEGEAASYGVYFDDSEYDYMQHLRDLNTGGGEVVFVESTATANKGKGKQKQSLEDALKKLDVEQNAGDILDDEILPSKNLTRVTYEAQQDIPDSIKGFQPDMDPRLREVLEALEDDAYVDDGDDDIFKELAKDGRELEDYEFDGADFDEDDGWESDATAKPNKEYKDDNIPQLVPTEQPEEGPSQDWLEDFKQFKKEQKGGKVPVAPSQSEMQSNWTTTTHGGRRKKRKGALTDNSSYSMTSSSLVRTEQMTLLDARFDKIEERYNEDMEDDMQSMSAVSTMSTVQGPVRGDFDNIMDDFLGNFTKPGKRTSKKTKAQTGLEQLEEIRKGLGPARIRGRIK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.62
4 0.57
5 0.51
6 0.53
7 0.51
8 0.57
9 0.51
10 0.42
11 0.43
12 0.42
13 0.39
14 0.37
15 0.33
16 0.26
17 0.25
18 0.22
19 0.14
20 0.1
21 0.11
22 0.1
23 0.12
24 0.17
25 0.18
26 0.22
27 0.23
28 0.28
29 0.31
30 0.4
31 0.48
32 0.48
33 0.57
34 0.6
35 0.65
36 0.66
37 0.63
38 0.57
39 0.48
40 0.44
41 0.34
42 0.27
43 0.21
44 0.15
45 0.12
46 0.09
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.08
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.11
55 0.12
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.15
83 0.13
84 0.11
85 0.09
86 0.07
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.05
93 0.06
94 0.07
95 0.08
96 0.1
97 0.15
98 0.23
99 0.31
100 0.39
101 0.45
102 0.51
103 0.57
104 0.62
105 0.62
106 0.63
107 0.63
108 0.61
109 0.56
110 0.5
111 0.44
112 0.37
113 0.34
114 0.28
115 0.22
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.12
122 0.09
123 0.08
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.07
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.17
137 0.21
138 0.27
139 0.27
140 0.26
141 0.25
142 0.24
143 0.21
144 0.19
145 0.17
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.11
152 0.12
153 0.14
154 0.17
155 0.2
156 0.22
157 0.21
158 0.21
159 0.24
160 0.23
161 0.19
162 0.17
163 0.14
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.05
183 0.06
184 0.08
185 0.09
186 0.1
187 0.1
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.11
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.07
210 0.09
211 0.11
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.21
216 0.22
217 0.24
218 0.25
219 0.27
220 0.35
221 0.37
222 0.38
223 0.36
224 0.35
225 0.31
226 0.29
227 0.26
228 0.16
229 0.14
230 0.14
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.11
242 0.11
243 0.16
244 0.17
245 0.19
246 0.26
247 0.28
248 0.34
249 0.41
250 0.46
251 0.48
252 0.56
253 0.62
254 0.6
255 0.63
256 0.62
257 0.54
258 0.54
259 0.5
260 0.4
261 0.33
262 0.31
263 0.27
264 0.23
265 0.22
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.19
270 0.17
271 0.17
272 0.17
273 0.24
274 0.26
275 0.33
276 0.41
277 0.5
278 0.6
279 0.69
280 0.77
281 0.77
282 0.79
283 0.81
284 0.82
285 0.82
286 0.79
287 0.74
288 0.67
289 0.62
290 0.53
291 0.43
292 0.33
293 0.24
294 0.16
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.11
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.15
304 0.14
305 0.15
306 0.14
307 0.14
308 0.17
309 0.16
310 0.15
311 0.14
312 0.13
313 0.14
314 0.16
315 0.24
316 0.23
317 0.3
318 0.33
319 0.33
320 0.33
321 0.31
322 0.28
323 0.21
324 0.21
325 0.14
326 0.11
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.07
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.12
341 0.14
342 0.14
343 0.17
344 0.16
345 0.17
346 0.17
347 0.18
348 0.18
349 0.17
350 0.16
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.08
357 0.09
358 0.12
359 0.19
360 0.2
361 0.28
362 0.38
363 0.45
364 0.55
365 0.66
366 0.73
367 0.76
368 0.85
369 0.87
370 0.85
371 0.85
372 0.84
373 0.82
374 0.77
375 0.68
376 0.59
377 0.5
378 0.47
379 0.4
380 0.31
381 0.23
382 0.18
383 0.18
384 0.22
385 0.27
386 0.27
387 0.34
388 0.42