Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RD78

Protein Details
Accession E3RD78    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-35IPTSADSRSKRPTKKRALTPRSAQASQHydrophilic
118-153LEKKDKEKTEKNRLKREKARLRKEKAKKGAKREAGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-23RPTKK
113-150KHKEELEKKDKEKTEKNRLKREKARLRKEKAKKGAKRE
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009548  Prkrip1  
Gene Ontology GO:0003725  F:double-stranded RNA binding  
KEGG pte:PTT_01731  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06658  DUF1168  
Amino Acid Sequences MSEPIPESIPTSADSRSKRPTKKRALTPRSAQASQVEALFAKPDRDIHIPGISALSKNTSLPPEIVANVQGSSAGAGSGEFHVYKASRRREYERLRLMDEEVQKEEDAKQFAKHKEELEKKDKEKTEKNRLKREKARLRKEKAKKGAKREAGSETDGTPAAEEETTKKKLAPNSTAPKAGQDGDAQHDANDQGGQVQSVDEIGLVIEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.32
3 0.41
4 0.5
5 0.58
6 0.66
7 0.74
8 0.78
9 0.84
10 0.88
11 0.9
12 0.89
13 0.89
14 0.86
15 0.85
16 0.81
17 0.72
18 0.63
19 0.54
20 0.47
21 0.39
22 0.31
23 0.22
24 0.15
25 0.14
26 0.15
27 0.13
28 0.11
29 0.11
30 0.12
31 0.16
32 0.2
33 0.22
34 0.22
35 0.24
36 0.23
37 0.22
38 0.23
39 0.19
40 0.16
41 0.14
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.14
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.11
56 0.1
57 0.08
58 0.07
59 0.06
60 0.05
61 0.04
62 0.03
63 0.03
64 0.04
65 0.05
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.07
70 0.08
71 0.13
72 0.2
73 0.27
74 0.32
75 0.36
76 0.42
77 0.51
78 0.58
79 0.63
80 0.63
81 0.58
82 0.54
83 0.51
84 0.47
85 0.42
86 0.37
87 0.29
88 0.22
89 0.2
90 0.18
91 0.18
92 0.18
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.15
97 0.2
98 0.23
99 0.26
100 0.27
101 0.27
102 0.35
103 0.42
104 0.47
105 0.48
106 0.53
107 0.51
108 0.56
109 0.58
110 0.56
111 0.57
112 0.59
113 0.63
114 0.64
115 0.71
116 0.75
117 0.79
118 0.82
119 0.82
120 0.84
121 0.83
122 0.85
123 0.87
124 0.86
125 0.87
126 0.87
127 0.88
128 0.87
129 0.87
130 0.87
131 0.83
132 0.83
133 0.84
134 0.82
135 0.74
136 0.67
137 0.62
138 0.55
139 0.5
140 0.42
141 0.32
142 0.25
143 0.23
144 0.19
145 0.14
146 0.11
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.1
151 0.17
152 0.2
153 0.2
154 0.22
155 0.25
156 0.31
157 0.39
158 0.42
159 0.46
160 0.53
161 0.57
162 0.59
163 0.55
164 0.51
165 0.46
166 0.4
167 0.31
168 0.25
169 0.23
170 0.24
171 0.27
172 0.24
173 0.22
174 0.22
175 0.2
176 0.19
177 0.16
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04