Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RDV3

Protein Details
Accession E3RDV3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
334-357QVATSKQPKKKGGKKAKAAKSLEQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-353KQPKKKGGKKAKAAK
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pte:PTT_03106  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MAKGRRYPLTSGVMREVQPGIGSFRDDKAPPDVRTYLVRVERTLEEVLFRLRFNDIKKRNLPPPYKIRYRLAADADLILVKQLGRPGIIERLRTAGAPFDLIRGCKWDIPHKTLHLQLAKAQDEELVLKRVEDIGVILGLSRDCGYIPEAYCVHVFGMEWERQSNQKPTVEELKAWGKENGNITICSAYWTYKKLIFVFEKRSDAQKMIWQDQIFLSGTLGYSEAYDKRSTPMHCYNCGSPEHLRRGCSKRQCCLNCNVHGHYQWGCKADPLCPNCGGPHPAWAPQCVAAANIEMNAQCQQYRDRELAWSIRPDSNMPPPPPSLSAATPQVNAQVATSKQPKKKGGKKAKAAKSLEQPEDVPVKPKYNPVLQMYNDNDMAKMLASSMENADVDLGALGLPAPSQPPPKVSGEAGVHLWSSFGSKIGMKSAWNPQTDHGPVSTRLQRHTKLPKFNDDESQPYFPGQGLHMNEVEHEGENGEHDEQVGHGEDDELQYEDIENGNGDTDMDSYLPHRNPGESDSDYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.37
4 0.28
5 0.26
6 0.23
7 0.2
8 0.17
9 0.19
10 0.19
11 0.2
12 0.25
13 0.24
14 0.26
15 0.32
16 0.38
17 0.37
18 0.41
19 0.41
20 0.38
21 0.42
22 0.43
23 0.42
24 0.41
25 0.41
26 0.35
27 0.38
28 0.37
29 0.36
30 0.35
31 0.27
32 0.22
33 0.22
34 0.26
35 0.23
36 0.22
37 0.19
38 0.2
39 0.24
40 0.29
41 0.38
42 0.4
43 0.48
44 0.55
45 0.61
46 0.66
47 0.72
48 0.73
49 0.71
50 0.75
51 0.75
52 0.77
53 0.76
54 0.73
55 0.7
56 0.69
57 0.66
58 0.6
59 0.53
60 0.44
61 0.39
62 0.34
63 0.26
64 0.21
65 0.14
66 0.1
67 0.08
68 0.08
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.14
74 0.23
75 0.26
76 0.26
77 0.25
78 0.27
79 0.27
80 0.27
81 0.25
82 0.19
83 0.16
84 0.17
85 0.16
86 0.16
87 0.18
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.2
92 0.2
93 0.23
94 0.29
95 0.34
96 0.38
97 0.43
98 0.43
99 0.45
100 0.47
101 0.51
102 0.45
103 0.4
104 0.4
105 0.41
106 0.39
107 0.35
108 0.31
109 0.24
110 0.21
111 0.23
112 0.2
113 0.16
114 0.14
115 0.14
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.11
120 0.09
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.08
133 0.11
134 0.12
135 0.15
136 0.15
137 0.17
138 0.17
139 0.16
140 0.15
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.17
149 0.2
150 0.24
151 0.27
152 0.28
153 0.3
154 0.3
155 0.33
156 0.41
157 0.39
158 0.35
159 0.33
160 0.35
161 0.34
162 0.34
163 0.33
164 0.26
165 0.28
166 0.3
167 0.31
168 0.25
169 0.23
170 0.23
171 0.2
172 0.19
173 0.17
174 0.15
175 0.12
176 0.12
177 0.15
178 0.16
179 0.18
180 0.21
181 0.2
182 0.25
183 0.28
184 0.32
185 0.38
186 0.39
187 0.4
188 0.39
189 0.41
190 0.37
191 0.33
192 0.29
193 0.26
194 0.27
195 0.26
196 0.29
197 0.25
198 0.24
199 0.23
200 0.24
201 0.2
202 0.15
203 0.12
204 0.08
205 0.08
206 0.07
207 0.07
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.12
216 0.17
217 0.17
218 0.23
219 0.31
220 0.33
221 0.35
222 0.37
223 0.37
224 0.36
225 0.36
226 0.31
227 0.27
228 0.3
229 0.35
230 0.35
231 0.35
232 0.39
233 0.44
234 0.49
235 0.54
236 0.52
237 0.49
238 0.57
239 0.6
240 0.56
241 0.59
242 0.58
243 0.54
244 0.54
245 0.5
246 0.44
247 0.4
248 0.39
249 0.32
250 0.28
251 0.24
252 0.22
253 0.2
254 0.19
255 0.19
256 0.21
257 0.25
258 0.24
259 0.25
260 0.23
261 0.24
262 0.23
263 0.24
264 0.22
265 0.16
266 0.2
267 0.18
268 0.22
269 0.22
270 0.22
271 0.21
272 0.19
273 0.19
274 0.14
275 0.13
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.12
288 0.14
289 0.18
290 0.18
291 0.17
292 0.18
293 0.21
294 0.24
295 0.23
296 0.23
297 0.23
298 0.24
299 0.24
300 0.24
301 0.25
302 0.29
303 0.33
304 0.31
305 0.31
306 0.3
307 0.31
308 0.31
309 0.3
310 0.24
311 0.19
312 0.2
313 0.22
314 0.22
315 0.21
316 0.2
317 0.2
318 0.17
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.17
324 0.26
325 0.31
326 0.35
327 0.43
328 0.51
329 0.58
330 0.66
331 0.72
332 0.75
333 0.77
334 0.83
335 0.86
336 0.86
337 0.86
338 0.8
339 0.75
340 0.73
341 0.71
342 0.63
343 0.54
344 0.45
345 0.39
346 0.4
347 0.34
348 0.29
349 0.24
350 0.25
351 0.25
352 0.29
353 0.3
354 0.31
355 0.36
356 0.36
357 0.41
358 0.38
359 0.44
360 0.42
361 0.41
362 0.38
363 0.32
364 0.27
365 0.21
366 0.2
367 0.12
368 0.09
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.07
373 0.08
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.07
380 0.05
381 0.05
382 0.03
383 0.03
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.05
389 0.08
390 0.12
391 0.14
392 0.16
393 0.2
394 0.24
395 0.26
396 0.25
397 0.29
398 0.27
399 0.28
400 0.26
401 0.23
402 0.2
403 0.17
404 0.17
405 0.1
406 0.1
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.11
411 0.12
412 0.15
413 0.17
414 0.16
415 0.21
416 0.3
417 0.34
418 0.35
419 0.35
420 0.33
421 0.4
422 0.41
423 0.38
424 0.3
425 0.27
426 0.27
427 0.32
428 0.37
429 0.32
430 0.36
431 0.43
432 0.44
433 0.5
434 0.59
435 0.6
436 0.64
437 0.67
438 0.72
439 0.71
440 0.71
441 0.7
442 0.62
443 0.6
444 0.55
445 0.53
446 0.43
447 0.37
448 0.34
449 0.27
450 0.24
451 0.2
452 0.21
453 0.2
454 0.23
455 0.23
456 0.23
457 0.23
458 0.23
459 0.23
460 0.17
461 0.14
462 0.12
463 0.11
464 0.12
465 0.14
466 0.12
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.12
472 0.12
473 0.1
474 0.09
475 0.1
476 0.11
477 0.12
478 0.13
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.08
491 0.08
492 0.08
493 0.09
494 0.08
495 0.09
496 0.1
497 0.18
498 0.19
499 0.23
500 0.24
501 0.25
502 0.28
503 0.31
504 0.36