Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AM50

Protein Details
Accession Q5AM50    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
327-362PVTSNYRGKNNRGRNNRGRRGNKRRERERWPLSTDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
334-355GKNNRGRNNRGRRGNKRRERER
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002716  PIN_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG cal:CAALFM_C202090WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13638  PIN_4  
Amino Acid Sequences MSLELSSNESEDNFRDELVDISGQVSKKPINIDSRQVRLILDHTAFVRGIGNIKRWFNEEYINSNTTRSNEIINLNIYIPTYTLHEFDFVKKGTSISATNAREAIRFIDNYLENEVEMNSDKIQYNLILESPQDNVPSWNKCNHYKVHSPKIKEFPNYKTKFDSSLIGQTPNVNEDSEFNENFDNALTFNQRNKLNDIQYENSASYQNAIANSDNLAEMPVRLRYLIRSCIYKRFIETKKPKIKNEIEDWKLVTEDPITKIWAKSYGIDCLNVNEAELLIFQNYDVNSFRLYNPYANDGDDFDPSTNILQNTIDTTLYSYSSVQDEPVTSNYRGKNNRGRNNRGRRGNKRRERERWPLSTDAVVSEERNESGTGFIKKEKFGAINYAPRGQGELWRPG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.17
4 0.17
5 0.18
6 0.16
7 0.12
8 0.13
9 0.17
10 0.16
11 0.17
12 0.19
13 0.18
14 0.2
15 0.25
16 0.29
17 0.34
18 0.39
19 0.48
20 0.52
21 0.56
22 0.54
23 0.51
24 0.45
25 0.38
26 0.35
27 0.31
28 0.24
29 0.21
30 0.2
31 0.22
32 0.21
33 0.19
34 0.19
35 0.13
36 0.19
37 0.2
38 0.27
39 0.3
40 0.33
41 0.34
42 0.36
43 0.37
44 0.33
45 0.37
46 0.33
47 0.33
48 0.36
49 0.37
50 0.34
51 0.33
52 0.33
53 0.28
54 0.28
55 0.23
56 0.2
57 0.21
58 0.23
59 0.24
60 0.24
61 0.23
62 0.2
63 0.19
64 0.17
65 0.14
66 0.12
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.14
73 0.15
74 0.18
75 0.23
76 0.2
77 0.21
78 0.2
79 0.2
80 0.19
81 0.21
82 0.19
83 0.18
84 0.26
85 0.25
86 0.26
87 0.28
88 0.27
89 0.25
90 0.24
91 0.23
92 0.17
93 0.16
94 0.16
95 0.19
96 0.2
97 0.21
98 0.22
99 0.19
100 0.16
101 0.16
102 0.15
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.08
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.11
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.13
123 0.18
124 0.22
125 0.23
126 0.27
127 0.3
128 0.35
129 0.39
130 0.41
131 0.43
132 0.48
133 0.54
134 0.59
135 0.61
136 0.6
137 0.62
138 0.66
139 0.65
140 0.62
141 0.58
142 0.55
143 0.6
144 0.59
145 0.54
146 0.5
147 0.46
148 0.43
149 0.39
150 0.34
151 0.25
152 0.29
153 0.28
154 0.24
155 0.23
156 0.21
157 0.2
158 0.19
159 0.17
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.13
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.08
172 0.05
173 0.06
174 0.09
175 0.1
176 0.12
177 0.17
178 0.19
179 0.21
180 0.25
181 0.28
182 0.28
183 0.3
184 0.32
185 0.28
186 0.27
187 0.27
188 0.23
189 0.19
190 0.17
191 0.14
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.13
213 0.19
214 0.19
215 0.24
216 0.26
217 0.34
218 0.37
219 0.35
220 0.35
221 0.39
222 0.41
223 0.46
224 0.53
225 0.56
226 0.64
227 0.69
228 0.69
229 0.69
230 0.72
231 0.68
232 0.68
233 0.67
234 0.59
235 0.54
236 0.52
237 0.43
238 0.36
239 0.29
240 0.21
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.15
246 0.16
247 0.17
248 0.17
249 0.19
250 0.17
251 0.19
252 0.2
253 0.24
254 0.23
255 0.24
256 0.23
257 0.2
258 0.22
259 0.18
260 0.16
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.07
270 0.07
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.14
276 0.15
277 0.17
278 0.19
279 0.2
280 0.2
281 0.23
282 0.23
283 0.22
284 0.22
285 0.2
286 0.2
287 0.18
288 0.18
289 0.14
290 0.13
291 0.13
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.13
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.13
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.18
315 0.22
316 0.21
317 0.27
318 0.31
319 0.39
320 0.43
321 0.5
322 0.56
323 0.61
324 0.7
325 0.74
326 0.8
327 0.82
328 0.87
329 0.89
330 0.89
331 0.89
332 0.91
333 0.92
334 0.93
335 0.92
336 0.92
337 0.93
338 0.92
339 0.9
340 0.9
341 0.88
342 0.85
343 0.8
344 0.74
345 0.65
346 0.59
347 0.5
348 0.4
349 0.34
350 0.27
351 0.22
352 0.2
353 0.19
354 0.17
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.16
359 0.21
360 0.22
361 0.23
362 0.29
363 0.32
364 0.33
365 0.35
366 0.37
367 0.34
368 0.32
369 0.39
370 0.39
371 0.44
372 0.47
373 0.49
374 0.44
375 0.41
376 0.43
377 0.35
378 0.35