Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3SA27

Protein Details
Accession E3SA27    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-89SDAGAAKEEEKKKKKKEKEALSLQEQREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
68-79KEEEKKKKKKEK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019313  Mediator_Med17  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pte:PTT_19940  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10156  Med17  
Amino Acid Sequences MDSLNNVTLRPWPAPKKDELTQEDLLFKIEQLASERGHLRNITEQSLQEDIDAGKNVPGHGSDAGAAKEEEKKKKKKEKEALSLQEQREKVLKVGMEMYSHLEWAKFAANNALDLVSLILSQDLNKRSLNFFSPTFQEQGLKQGIPLGSFGVSKENHEHRVRKPEEQHRLQDLEARQEAVAQGARMGALDSSVDEILKAAKNLEKEIRRETKYWHEIVTVSDKGWPIQRLRQNVRHAPFGVRYGLPEASDHFKARGFAPLQMDKDGSIILDPALALKPKILRVRVSIDGNITGTTQLSAADDLANQSLEKSIQLARDSLLEEELYYEISLETRQLLAYGVEFRDSVIYVDAPQMGGASHNRKLLIDCIPRDDPVASSQSHEHDWLARNIAEGLRLLLAHEHSMRLYRRSQLPPPLTTRKREKPSPSLLRTLLAVIHHIEAVDSLYVYLGTLARTLNSVGLDVTLDTTRETSWATLVESLGAPSMKGQSATDQLFEVFMKPFNGKATMSLPASTGAQYESLSITTRTIIGQPTFGTEHKLILPPTLGIDLGLSQQQKFAAVEEVTSYVDWILSLHITHRLLQNEYSSRAQTHSQDARLSIKSKDAKKGVKSSKDIEIELSNGELKASVLIVDTARDTEEVEQSHTWTGKDDNKCSLREVIQSWVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.58
3 0.59
4 0.61
5 0.66
6 0.63
7 0.62
8 0.58
9 0.55
10 0.5
11 0.44
12 0.4
13 0.3
14 0.24
15 0.22
16 0.18
17 0.17
18 0.2
19 0.24
20 0.22
21 0.27
22 0.32
23 0.28
24 0.32
25 0.31
26 0.29
27 0.34
28 0.36
29 0.35
30 0.34
31 0.34
32 0.33
33 0.34
34 0.31
35 0.23
36 0.21
37 0.18
38 0.18
39 0.19
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.17
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.15
51 0.15
52 0.16
53 0.15
54 0.15
55 0.23
56 0.3
57 0.39
58 0.47
59 0.56
60 0.65
61 0.76
62 0.85
63 0.87
64 0.9
65 0.9
66 0.91
67 0.92
68 0.89
69 0.88
70 0.86
71 0.78
72 0.75
73 0.64
74 0.55
75 0.5
76 0.43
77 0.35
78 0.3
79 0.28
80 0.22
81 0.26
82 0.25
83 0.21
84 0.2
85 0.23
86 0.19
87 0.19
88 0.18
89 0.14
90 0.12
91 0.13
92 0.17
93 0.13
94 0.13
95 0.18
96 0.18
97 0.19
98 0.2
99 0.18
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.07
109 0.13
110 0.15
111 0.17
112 0.19
113 0.22
114 0.23
115 0.27
116 0.29
117 0.27
118 0.26
119 0.26
120 0.29
121 0.3
122 0.29
123 0.27
124 0.25
125 0.22
126 0.27
127 0.27
128 0.23
129 0.2
130 0.23
131 0.22
132 0.2
133 0.2
134 0.15
135 0.12
136 0.13
137 0.13
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.23
142 0.27
143 0.33
144 0.4
145 0.45
146 0.46
147 0.56
148 0.57
149 0.59
150 0.64
151 0.66
152 0.7
153 0.72
154 0.72
155 0.67
156 0.65
157 0.57
158 0.54
159 0.46
160 0.42
161 0.36
162 0.31
163 0.24
164 0.23
165 0.23
166 0.18
167 0.17
168 0.1
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.05
182 0.06
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.12
188 0.13
189 0.17
190 0.25
191 0.27
192 0.3
193 0.38
194 0.45
195 0.46
196 0.46
197 0.48
198 0.51
199 0.52
200 0.5
201 0.42
202 0.35
203 0.33
204 0.33
205 0.35
206 0.25
207 0.19
208 0.2
209 0.19
210 0.19
211 0.22
212 0.23
213 0.2
214 0.27
215 0.33
216 0.39
217 0.46
218 0.53
219 0.57
220 0.62
221 0.61
222 0.58
223 0.54
224 0.48
225 0.42
226 0.37
227 0.31
228 0.23
229 0.22
230 0.2
231 0.19
232 0.16
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.21
243 0.18
244 0.19
245 0.24
246 0.28
247 0.28
248 0.28
249 0.27
250 0.21
251 0.2
252 0.16
253 0.11
254 0.07
255 0.06
256 0.04
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.09
265 0.14
266 0.19
267 0.2
268 0.21
269 0.24
270 0.29
271 0.32
272 0.32
273 0.28
274 0.24
275 0.23
276 0.21
277 0.18
278 0.13
279 0.09
280 0.07
281 0.06
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.08
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.12
306 0.1
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.05
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.08
344 0.11
345 0.14
346 0.15
347 0.16
348 0.16
349 0.17
350 0.19
351 0.23
352 0.25
353 0.23
354 0.27
355 0.27
356 0.27
357 0.27
358 0.25
359 0.18
360 0.15
361 0.17
362 0.12
363 0.13
364 0.14
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.13
369 0.15
370 0.17
371 0.17
372 0.18
373 0.16
374 0.15
375 0.16
376 0.15
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.07
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.07
385 0.08
386 0.08
387 0.08
388 0.08
389 0.13
390 0.15
391 0.17
392 0.18
393 0.22
394 0.29
395 0.34
396 0.39
397 0.43
398 0.46
399 0.47
400 0.52
401 0.58
402 0.54
403 0.56
404 0.6
405 0.6
406 0.63
407 0.67
408 0.66
409 0.65
410 0.71
411 0.75
412 0.69
413 0.65
414 0.59
415 0.52
416 0.45
417 0.37
418 0.28
419 0.18
420 0.15
421 0.11
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.08
450 0.06
451 0.07
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.09
461 0.1
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.09
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.07
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.11
475 0.17
476 0.18
477 0.18
478 0.16
479 0.15
480 0.16
481 0.16
482 0.14
483 0.1
484 0.11
485 0.12
486 0.12
487 0.13
488 0.14
489 0.17
490 0.15
491 0.17
492 0.18
493 0.21
494 0.21
495 0.2
496 0.19
497 0.17
498 0.18
499 0.15
500 0.13
501 0.09
502 0.09
503 0.09
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.1
509 0.1
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.12
514 0.15
515 0.14
516 0.15
517 0.15
518 0.18
519 0.2
520 0.19
521 0.22
522 0.19
523 0.2
524 0.21
525 0.25
526 0.22
527 0.21
528 0.21
529 0.16
530 0.17
531 0.16
532 0.13
533 0.09
534 0.09
535 0.08
536 0.09
537 0.12
538 0.12
539 0.11
540 0.13
541 0.13
542 0.15
543 0.14
544 0.14
545 0.15
546 0.14
547 0.14
548 0.15
549 0.16
550 0.15
551 0.14
552 0.13
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.08
561 0.14
562 0.15
563 0.18
564 0.23
565 0.25
566 0.27
567 0.29
568 0.34
569 0.33
570 0.36
571 0.36
572 0.33
573 0.31
574 0.32
575 0.34
576 0.3
577 0.35
578 0.38
579 0.38
580 0.38
581 0.4
582 0.42
583 0.43
584 0.42
585 0.34
586 0.36
587 0.41
588 0.44
589 0.51
590 0.54
591 0.58
592 0.63
593 0.73
594 0.74
595 0.75
596 0.75
597 0.7
598 0.7
599 0.66
600 0.59
601 0.51
602 0.43
603 0.35
604 0.3
605 0.28
606 0.2
607 0.16
608 0.15
609 0.12
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.07
614 0.07
615 0.08
616 0.09
617 0.1
618 0.1
619 0.1
620 0.11
621 0.11
622 0.12
623 0.13
624 0.18
625 0.18
626 0.21
627 0.21
628 0.23
629 0.27
630 0.27
631 0.25
632 0.23
633 0.28
634 0.32
635 0.4
636 0.42
637 0.47
638 0.51
639 0.52
640 0.53
641 0.53
642 0.48
643 0.46
644 0.44