Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S4D7

Protein Details
Accession E3S4D7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-253VAAPSGRKKKGPRRGGKQTNTHMIGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
233-245SGRKKKGPRRGGK
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 11, mito_nucl 11
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG pte:PTT_17391  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
CDD cd07977  TFIIE_beta_winged_helix  
Amino Acid Sequences MSFLKANSATGMNAPSPTPSTSSASGSKRKRPADGVPVVYSQPQDTGTGEHVFTRLTYVNDFLRERKEKWHTFDDIMEYLNIPPGHIQREQLRALMRADNQGNRISWDSHNEKYRYKPKLDIRNPAQLKGHLQTQKSAMGLQIKDLKDGWSTVADDITKMEEKNEVLVRRAKDGVPKTVWGNDPSLMLPMDPAFAKTWHSVHVPEDPEELRKLLLANKLTAATQAKVIVAAPSGRKKKGPRRGGKQTNTHMIGILKDFSGMRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.18
4 0.18
5 0.19
6 0.2
7 0.23
8 0.24
9 0.28
10 0.33
11 0.38
12 0.45
13 0.5
14 0.56
15 0.6
16 0.62
17 0.63
18 0.62
19 0.64
20 0.65
21 0.65
22 0.61
23 0.55
24 0.53
25 0.48
26 0.44
27 0.36
28 0.27
29 0.2
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.17
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.14
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.16
46 0.17
47 0.22
48 0.24
49 0.23
50 0.3
51 0.33
52 0.33
53 0.4
54 0.47
55 0.49
56 0.53
57 0.57
58 0.52
59 0.49
60 0.5
61 0.44
62 0.35
63 0.3
64 0.24
65 0.19
66 0.15
67 0.17
68 0.15
69 0.11
70 0.12
71 0.14
72 0.17
73 0.17
74 0.2
75 0.21
76 0.26
77 0.27
78 0.27
79 0.27
80 0.25
81 0.26
82 0.27
83 0.23
84 0.23
85 0.25
86 0.24
87 0.25
88 0.25
89 0.23
90 0.22
91 0.22
92 0.19
93 0.18
94 0.22
95 0.25
96 0.27
97 0.34
98 0.34
99 0.35
100 0.41
101 0.48
102 0.47
103 0.45
104 0.49
105 0.5
106 0.59
107 0.62
108 0.63
109 0.6
110 0.64
111 0.63
112 0.57
113 0.5
114 0.4
115 0.37
116 0.29
117 0.31
118 0.25
119 0.25
120 0.24
121 0.24
122 0.25
123 0.22
124 0.21
125 0.16
126 0.16
127 0.16
128 0.16
129 0.21
130 0.2
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.16
135 0.16
136 0.15
137 0.09
138 0.1
139 0.09
140 0.11
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.14
151 0.18
152 0.17
153 0.19
154 0.24
155 0.25
156 0.26
157 0.27
158 0.25
159 0.28
160 0.3
161 0.34
162 0.3
163 0.31
164 0.3
165 0.33
166 0.34
167 0.28
168 0.27
169 0.21
170 0.2
171 0.19
172 0.18
173 0.14
174 0.11
175 0.1
176 0.08
177 0.09
178 0.08
179 0.09
180 0.09
181 0.09
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.16
186 0.18
187 0.18
188 0.19
189 0.25
190 0.25
191 0.24
192 0.27
193 0.25
194 0.26
195 0.26
196 0.24
197 0.17
198 0.15
199 0.15
200 0.17
201 0.22
202 0.21
203 0.21
204 0.22
205 0.23
206 0.22
207 0.25
208 0.24
209 0.18
210 0.18
211 0.18
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.13
216 0.11
217 0.14
218 0.18
219 0.27
220 0.32
221 0.35
222 0.42
223 0.51
224 0.6
225 0.68
226 0.73
227 0.74
228 0.79
229 0.87
230 0.91
231 0.9
232 0.9
233 0.88
234 0.87
235 0.79
236 0.69
237 0.6
238 0.51
239 0.44
240 0.36
241 0.29
242 0.19
243 0.17