Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S234

Protein Details
Accession E3S234    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
100-121EIAPRIKKRHEEYEERRKRQQQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-109RIKKRH
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000555  JAMM/MPN+_dom  
IPR037518  MPN  
IPR044098  STAMBP/STALP-like_MPN  
IPR015063  USP8_dimer  
Gene Ontology GO:0061578  F:K63-linked deubiquitinase activity  
GO:0070530  F:K63-linked polyubiquitin modification-dependent protein binding  
GO:0140492  F:metal-dependent deubiquitinase activity  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0120113  P:cytoplasm to vacuole transport by the NVT pathway  
GO:0035871  P:protein K11-linked deubiquitination  
GO:0070536  P:protein K63-linked deubiquitination  
GO:0043328  P:protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
KEGG pte:PTT_16341  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01398  JAB  
PF08969  USP8_dimer  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50249  MPN  
CDD cd08066  MPN_AMSH_like  
Amino Acid Sequences MATLNTPVSVAEVAEQAGNYTYNVHIPLANWLRTANTMQKEAQVYEAEGNDAQTYLLLYRHADLVLQKLQAHPDRNKPENRKALNAATAAVSRDLKKLEEIAPRIKKRHEEYEERRKRQQQALKSLEEKGARTLSQELDGLSLQDPGTKRRSYDSRPTIDARALENQSLAARLAQREVRRRDINRRNVRQHGVSEEEEQARRSGGAWDMWQDDLPQQAGDGDDVSSQIQEVARLQQNGHRTSYSSRPTSQSTSSYHYPTVPYKTSQERWDSSRDPAPARPPKEQIYSSSASQSSPPPLPPKYTTSTNDPRYQHRPPPVPGKYSESAPPLPGKVPDHRPITPSNELDEFTFKPSAFLENGDPLRPVFLPSQLRNQFLVSASSNTRLNLETCGMLCGILKSNALFITRLIIPEQTSTSDTCETLNEEELFDYCDKEELMVLGWIHTHPTQTCFMSSRDLHTHVGYQVMMPESIAIVCAPTKQPSWGCFRLTDPPGKQAILNCSRPGIFHPHDVDNIYTEALKPGHVVELTNAPLEIVDMRPKKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.09
7 0.1
8 0.11
9 0.12
10 0.14
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.24
15 0.29
16 0.29
17 0.27
18 0.26
19 0.27
20 0.29
21 0.33
22 0.31
23 0.28
24 0.31
25 0.32
26 0.37
27 0.38
28 0.36
29 0.35
30 0.28
31 0.26
32 0.25
33 0.24
34 0.21
35 0.18
36 0.18
37 0.15
38 0.14
39 0.12
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.13
51 0.18
52 0.21
53 0.22
54 0.22
55 0.22
56 0.3
57 0.34
58 0.41
59 0.41
60 0.47
61 0.54
62 0.61
63 0.69
64 0.71
65 0.75
66 0.78
67 0.76
68 0.72
69 0.69
70 0.66
71 0.61
72 0.52
73 0.43
74 0.35
75 0.31
76 0.26
77 0.23
78 0.21
79 0.17
80 0.2
81 0.2
82 0.19
83 0.2
84 0.22
85 0.26
86 0.32
87 0.35
88 0.42
89 0.5
90 0.55
91 0.58
92 0.6
93 0.62
94 0.6
95 0.66
96 0.63
97 0.65
98 0.68
99 0.75
100 0.81
101 0.79
102 0.81
103 0.78
104 0.78
105 0.77
106 0.75
107 0.73
108 0.73
109 0.74
110 0.71
111 0.66
112 0.61
113 0.56
114 0.5
115 0.41
116 0.35
117 0.31
118 0.25
119 0.24
120 0.25
121 0.21
122 0.2
123 0.2
124 0.16
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.11
129 0.12
130 0.1
131 0.12
132 0.13
133 0.16
134 0.22
135 0.21
136 0.22
137 0.28
138 0.35
139 0.39
140 0.49
141 0.54
142 0.53
143 0.56
144 0.58
145 0.53
146 0.49
147 0.43
148 0.35
149 0.33
150 0.3
151 0.25
152 0.22
153 0.21
154 0.18
155 0.17
156 0.15
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.14
161 0.18
162 0.23
163 0.31
164 0.36
165 0.42
166 0.48
167 0.53
168 0.61
169 0.67
170 0.72
171 0.74
172 0.79
173 0.78
174 0.77
175 0.76
176 0.69
177 0.61
178 0.54
179 0.48
180 0.4
181 0.35
182 0.32
183 0.3
184 0.27
185 0.26
186 0.22
187 0.17
188 0.16
189 0.13
190 0.12
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.13
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.11
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.11
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.17
223 0.24
224 0.25
225 0.26
226 0.21
227 0.2
228 0.23
229 0.3
230 0.32
231 0.29
232 0.29
233 0.3
234 0.33
235 0.34
236 0.34
237 0.3
238 0.27
239 0.3
240 0.3
241 0.29
242 0.27
243 0.24
244 0.25
245 0.24
246 0.26
247 0.22
248 0.21
249 0.23
250 0.28
251 0.3
252 0.32
253 0.35
254 0.32
255 0.33
256 0.38
257 0.36
258 0.33
259 0.34
260 0.32
261 0.29
262 0.29
263 0.36
264 0.37
265 0.39
266 0.4
267 0.39
268 0.4
269 0.43
270 0.41
271 0.35
272 0.34
273 0.32
274 0.29
275 0.28
276 0.25
277 0.21
278 0.21
279 0.19
280 0.16
281 0.15
282 0.17
283 0.19
284 0.2
285 0.23
286 0.25
287 0.28
288 0.29
289 0.33
290 0.34
291 0.37
292 0.45
293 0.46
294 0.51
295 0.48
296 0.5
297 0.51
298 0.54
299 0.53
300 0.52
301 0.53
302 0.5
303 0.58
304 0.56
305 0.53
306 0.49
307 0.49
308 0.42
309 0.38
310 0.37
311 0.31
312 0.28
313 0.26
314 0.26
315 0.2
316 0.2
317 0.21
318 0.21
319 0.23
320 0.28
321 0.34
322 0.37
323 0.37
324 0.39
325 0.39
326 0.43
327 0.42
328 0.37
329 0.32
330 0.29
331 0.28
332 0.26
333 0.26
334 0.2
335 0.18
336 0.19
337 0.16
338 0.15
339 0.15
340 0.17
341 0.14
342 0.15
343 0.14
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.19
348 0.16
349 0.17
350 0.16
351 0.16
352 0.11
353 0.17
354 0.23
355 0.25
356 0.35
357 0.37
358 0.39
359 0.37
360 0.37
361 0.32
362 0.26
363 0.28
364 0.19
365 0.18
366 0.17
367 0.19
368 0.2
369 0.18
370 0.19
371 0.17
372 0.16
373 0.15
374 0.15
375 0.13
376 0.12
377 0.13
378 0.12
379 0.11
380 0.1
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.1
386 0.11
387 0.13
388 0.13
389 0.12
390 0.1
391 0.13
392 0.13
393 0.14
394 0.13
395 0.13
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.14
400 0.15
401 0.14
402 0.17
403 0.17
404 0.17
405 0.15
406 0.15
407 0.16
408 0.16
409 0.19
410 0.16
411 0.15
412 0.15
413 0.15
414 0.17
415 0.14
416 0.14
417 0.1
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.08
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.12
430 0.12
431 0.14
432 0.12
433 0.16
434 0.19
435 0.2
436 0.22
437 0.22
438 0.23
439 0.28
440 0.28
441 0.3
442 0.32
443 0.34
444 0.34
445 0.33
446 0.34
447 0.28
448 0.28
449 0.23
450 0.18
451 0.17
452 0.16
453 0.15
454 0.12
455 0.11
456 0.09
457 0.09
458 0.09
459 0.06
460 0.06
461 0.06
462 0.09
463 0.11
464 0.14
465 0.15
466 0.21
467 0.25
468 0.29
469 0.37
470 0.39
471 0.4
472 0.39
473 0.41
474 0.44
475 0.45
476 0.5
477 0.44
478 0.46
479 0.46
480 0.45
481 0.44
482 0.39
483 0.44
484 0.43
485 0.45
486 0.4
487 0.4
488 0.39
489 0.38
490 0.37
491 0.37
492 0.32
493 0.35
494 0.38
495 0.39
496 0.41
497 0.42
498 0.39
499 0.32
500 0.3
501 0.23
502 0.19
503 0.16
504 0.18
505 0.16
506 0.15
507 0.13
508 0.13
509 0.17
510 0.17
511 0.17
512 0.16
513 0.21
514 0.22
515 0.22
516 0.21
517 0.16
518 0.16
519 0.16
520 0.15
521 0.12
522 0.2
523 0.26