Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2XWN6

Protein Details
Accession A0A0D2XWN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-302AQEEREKKQREERERQRIERERQREKEQEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-298KRREEEERKQKEEEDRIAQEEREKKQREERERQRIERERQREK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG fox:FOXG_08402  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MDKYIDGRFERVEKALANLIDSVTKYHPSIQQGEELNAADQELSRGLKEVQTHQNNYLRIQQLRESSNALDTQIRDTLSNLATTRKDIVTTQTTTFPSGPSYPIAYEELLNYARRISKTTMPPAGTIKAVPPTPDVPEVQTPGGQTPAAQTPGPESQAASVMTPSAPPSSQVQSPAVMNGTPAVSQEPATQQSSMSANTVLPSEWTQFLNPLTDQIFLPWPNDLQLGAGSLAANQLLQEQGIDPKGYDPAEEEERKRREEEERKQKEEEDRIAQEEREKKQREERERQRIERERQREKEQEAWRRASLVGGPAAPGEQRSPTGPPQQKAQFQFTNLDDLDDDDDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.31
3 0.27
4 0.25
5 0.22
6 0.21
7 0.2
8 0.2
9 0.2
10 0.17
11 0.19
12 0.19
13 0.23
14 0.27
15 0.3
16 0.35
17 0.33
18 0.38
19 0.37
20 0.38
21 0.35
22 0.3
23 0.26
24 0.2
25 0.19
26 0.12
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.09
32 0.11
33 0.12
34 0.14
35 0.18
36 0.24
37 0.32
38 0.4
39 0.43
40 0.48
41 0.53
42 0.52
43 0.51
44 0.52
45 0.47
46 0.41
47 0.41
48 0.39
49 0.39
50 0.4
51 0.39
52 0.34
53 0.29
54 0.3
55 0.27
56 0.24
57 0.21
58 0.19
59 0.2
60 0.2
61 0.2
62 0.17
63 0.17
64 0.2
65 0.18
66 0.2
67 0.17
68 0.19
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.19
73 0.19
74 0.17
75 0.22
76 0.24
77 0.26
78 0.26
79 0.28
80 0.28
81 0.3
82 0.29
83 0.24
84 0.21
85 0.2
86 0.19
87 0.16
88 0.17
89 0.14
90 0.16
91 0.17
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.14
96 0.14
97 0.14
98 0.12
99 0.13
100 0.16
101 0.16
102 0.19
103 0.2
104 0.26
105 0.32
106 0.38
107 0.42
108 0.39
109 0.4
110 0.4
111 0.38
112 0.31
113 0.24
114 0.19
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.15
120 0.17
121 0.19
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.19
126 0.17
127 0.17
128 0.15
129 0.13
130 0.14
131 0.11
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.15
140 0.16
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.13
145 0.13
146 0.1
147 0.08
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.1
156 0.12
157 0.13
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.12
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.13
197 0.12
198 0.12
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.11
203 0.14
204 0.12
205 0.13
206 0.12
207 0.11
208 0.11
209 0.11
210 0.1
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.07
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.09
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.14
237 0.21
238 0.25
239 0.28
240 0.35
241 0.38
242 0.4
243 0.4
244 0.39
245 0.42
246 0.49
247 0.57
248 0.59
249 0.65
250 0.67
251 0.68
252 0.69
253 0.67
254 0.64
255 0.59
256 0.55
257 0.48
258 0.47
259 0.47
260 0.43
261 0.42
262 0.42
263 0.41
264 0.44
265 0.46
266 0.47
267 0.55
268 0.64
269 0.67
270 0.71
271 0.76
272 0.78
273 0.83
274 0.84
275 0.85
276 0.85
277 0.85
278 0.84
279 0.83
280 0.83
281 0.81
282 0.83
283 0.81
284 0.76
285 0.76
286 0.75
287 0.76
288 0.72
289 0.7
290 0.62
291 0.56
292 0.5
293 0.43
294 0.35
295 0.29
296 0.24
297 0.19
298 0.19
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.14
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.16
307 0.2
308 0.26
309 0.36
310 0.43
311 0.43
312 0.5
313 0.56
314 0.62
315 0.63
316 0.65
317 0.59
318 0.54
319 0.58
320 0.5
321 0.49
322 0.41
323 0.37
324 0.29
325 0.26
326 0.26