Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2XVL6

Protein Details
Accession A0A0D2XVL6    Localization Confidence High Confidence Score 21.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
60-81IEAEKAKKKREEKAAAIRKAREBasic
106-129KDWLIGQKKRQKKIAKVRKLEEELHydrophilic
280-308YIDPSQIKVKKPKKKKGKKGTRQKPTDDDBasic
350-376TLAIQRKNALKKRKKTRPEDIARLLKEHydrophilic
404-428SKPGENEERKPRRPKTVSKSPEPDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-80KAKKKREEKAAAIRKAR
113-123KKRQKKIAKVR
287-303KVKKPKKKKGKKGTRQK
356-366KNALKKRKKTR
413-417KPRRP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MDAATIEETNRIRISLGMKPLPVPGADNTSQTQSMYADGDAPSTLESRQAQAYDNYNKVIEAEKAKKKREEKAAAIRKAREQAQRNAVLEGKGFGEVEEGGDLSAKDWLIGQKKRQKKIAKVRKLEEELAAAEAEAAAAVQYTSKDLAGIKVGHDTADFLDGDDQILTLKDTTIDENEEEGDELENLNMREAEKLAERLDNKKKKPGYNPLDDDEEGERGILSHYDEEIEGKKSKKFTLDTSGVIAELSDILEKPVDKTKNGQNVSLDDVIGDAPISSDYIDPSQIKVKKPKKKKGKKGTRQKPTDDDDLFPIETTPIDDAMDIDSKDTTTKKRKAVDDTFVDDDDLQATLAIQRKNALKKRKKTRPEDIARLLKEEDNEPEPAEQPEGGLVLDEVSEFVAGLSKPGENEERKPRRPKTVSKSPEPDDDHPMGDDAEVVEEKPQPSAVEELDETGVEEEKAVGAGMGAALALLRERGLVEDTRGDVEYTSLRNREDFLAKKRLLEEELDEQARAQRERDRTSGKLDRMSNGVGGYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.25
3 0.33
4 0.33
5 0.33
6 0.34
7 0.36
8 0.34
9 0.3
10 0.26
11 0.21
12 0.25
13 0.25
14 0.27
15 0.26
16 0.28
17 0.29
18 0.26
19 0.24
20 0.17
21 0.18
22 0.16
23 0.15
24 0.14
25 0.13
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.11
32 0.13
33 0.14
34 0.16
35 0.19
36 0.2
37 0.21
38 0.25
39 0.33
40 0.35
41 0.36
42 0.35
43 0.32
44 0.31
45 0.3
46 0.28
47 0.25
48 0.26
49 0.34
50 0.42
51 0.5
52 0.57
53 0.65
54 0.68
55 0.73
56 0.75
57 0.75
58 0.74
59 0.78
60 0.81
61 0.81
62 0.81
63 0.75
64 0.7
65 0.67
66 0.65
67 0.63
68 0.59
69 0.6
70 0.62
71 0.65
72 0.61
73 0.57
74 0.52
75 0.44
76 0.37
77 0.29
78 0.21
79 0.15
80 0.14
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.08
92 0.07
93 0.07
94 0.09
95 0.14
96 0.22
97 0.27
98 0.36
99 0.44
100 0.53
101 0.6
102 0.68
103 0.71
104 0.73
105 0.8
106 0.82
107 0.83
108 0.83
109 0.82
110 0.82
111 0.79
112 0.7
113 0.6
114 0.51
115 0.41
116 0.33
117 0.27
118 0.17
119 0.11
120 0.09
121 0.07
122 0.04
123 0.03
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.03
128 0.03
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.09
135 0.12
136 0.13
137 0.12
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.13
142 0.13
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.08
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.07
177 0.08
178 0.08
179 0.1
180 0.09
181 0.11
182 0.12
183 0.16
184 0.17
185 0.25
186 0.35
187 0.42
188 0.43
189 0.5
190 0.55
191 0.58
192 0.65
193 0.67
194 0.65
195 0.65
196 0.67
197 0.61
198 0.6
199 0.53
200 0.46
201 0.36
202 0.29
203 0.19
204 0.15
205 0.12
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.08
215 0.09
216 0.12
217 0.14
218 0.15
219 0.17
220 0.19
221 0.21
222 0.24
223 0.25
224 0.26
225 0.31
226 0.32
227 0.3
228 0.3
229 0.28
230 0.23
231 0.21
232 0.17
233 0.09
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.03
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.06
242 0.13
243 0.14
244 0.14
245 0.19
246 0.25
247 0.34
248 0.35
249 0.35
250 0.29
251 0.3
252 0.33
253 0.29
254 0.22
255 0.13
256 0.12
257 0.1
258 0.09
259 0.07
260 0.03
261 0.03
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.16
272 0.19
273 0.23
274 0.33
275 0.42
276 0.49
277 0.6
278 0.69
279 0.73
280 0.8
281 0.88
282 0.89
283 0.91
284 0.92
285 0.93
286 0.94
287 0.93
288 0.89
289 0.83
290 0.78
291 0.71
292 0.68
293 0.58
294 0.49
295 0.41
296 0.36
297 0.31
298 0.24
299 0.19
300 0.11
301 0.09
302 0.09
303 0.07
304 0.05
305 0.06
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.1
315 0.12
316 0.18
317 0.26
318 0.32
319 0.38
320 0.45
321 0.5
322 0.57
323 0.61
324 0.61
325 0.56
326 0.54
327 0.5
328 0.43
329 0.39
330 0.29
331 0.23
332 0.16
333 0.12
334 0.07
335 0.05
336 0.04
337 0.07
338 0.12
339 0.13
340 0.12
341 0.16
342 0.22
343 0.31
344 0.39
345 0.47
346 0.52
347 0.61
348 0.72
349 0.79
350 0.84
351 0.84
352 0.87
353 0.87
354 0.87
355 0.86
356 0.83
357 0.81
358 0.72
359 0.65
360 0.56
361 0.47
362 0.39
363 0.32
364 0.26
365 0.2
366 0.2
367 0.18
368 0.18
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.12
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.06
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.06
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.11
394 0.18
395 0.19
396 0.27
397 0.37
398 0.46
399 0.54
400 0.64
401 0.67
402 0.72
403 0.77
404 0.8
405 0.79
406 0.8
407 0.79
408 0.79
409 0.81
410 0.74
411 0.74
412 0.7
413 0.64
414 0.6
415 0.54
416 0.45
417 0.38
418 0.35
419 0.26
420 0.19
421 0.16
422 0.09
423 0.09
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.12
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.12
432 0.13
433 0.16
434 0.14
435 0.15
436 0.15
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.12
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.03
454 0.03
455 0.03
456 0.03
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.04
462 0.04
463 0.06
464 0.09
465 0.11
466 0.13
467 0.16
468 0.18
469 0.19
470 0.2
471 0.19
472 0.16
473 0.17
474 0.18
475 0.19
476 0.23
477 0.24
478 0.24
479 0.25
480 0.27
481 0.31
482 0.35
483 0.39
484 0.41
485 0.48
486 0.48
487 0.51
488 0.51
489 0.5
490 0.44
491 0.4
492 0.37
493 0.33
494 0.39
495 0.36
496 0.34
497 0.3
498 0.33
499 0.35
500 0.31
501 0.28
502 0.3
503 0.37
504 0.43
505 0.5
506 0.52
507 0.5
508 0.58
509 0.64
510 0.62
511 0.62
512 0.59
513 0.54
514 0.51
515 0.5
516 0.42