Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RN13

Protein Details
Accession E3RN13    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
41-64SSSAVTNSKRKRDQNDESGNKRLRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 10.333, cyto_mito 7.333, mito 7, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG pte:PTT_09961  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MATSGVNLAVTKDGETYNKLQRPFDYLTSTQSTPPPLAAVSSSAVTNSKRKRDQNDESGNKRLRNDRSVQNHKGRPRASQTYQEHGIQTVLPGLDGEEQLSDESTGEALAYLQSVRSEASTIPTLLVALNKPNEADSDSYDDEHAARRDTADAESVLYSDGAYIAVDSRCDAEIECWDGDPHDLAPQESCHMMLLQRFRAHRNKLAEIQKDIAVPSQATVTGDSRRTQKTSKQEWSDIVERDYPVARNVVQLDDPALYLALQGCALALDRTAIISRQQSCWIWTLLALVGEFGTLDYKRIGKIRDLGLTAGRLATRLRSERLASQCSLKGDTGEQSVPGGIKSSGQEGYCRDKRIMGEATKVFQESASDVEDIGLLNTGTVKAGDAVCNVGSTLEDGDNLDGDANDSDADMIISDEEEEKEEMADGVEDGGLEMARARLLAQLGDRLVHSKMSSSDTQPELTPAQGPKQLSRVEAEIQRQEMRRQESHKEVVPHSLSSTTSPTRASQIGLDAAPLTGGEWNTKVTIDMILTVVAECYGQRDLLRFRDVW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.21
3 0.26
4 0.34
5 0.38
6 0.4
7 0.41
8 0.41
9 0.46
10 0.46
11 0.45
12 0.42
13 0.39
14 0.42
15 0.44
16 0.44
17 0.4
18 0.38
19 0.36
20 0.3
21 0.29
22 0.24
23 0.19
24 0.19
25 0.16
26 0.16
27 0.14
28 0.14
29 0.13
30 0.13
31 0.16
32 0.18
33 0.26
34 0.32
35 0.41
36 0.49
37 0.57
38 0.65
39 0.72
40 0.78
41 0.8
42 0.83
43 0.83
44 0.79
45 0.81
46 0.78
47 0.72
48 0.67
49 0.65
50 0.61
51 0.59
52 0.61
53 0.6
54 0.65
55 0.71
56 0.76
57 0.77
58 0.78
59 0.77
60 0.79
61 0.71
62 0.68
63 0.67
64 0.67
65 0.62
66 0.65
67 0.63
68 0.62
69 0.63
70 0.58
71 0.5
72 0.41
73 0.37
74 0.27
75 0.22
76 0.17
77 0.13
78 0.1
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.08
105 0.08
106 0.11
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.12
113 0.13
114 0.11
115 0.13
116 0.15
117 0.15
118 0.15
119 0.15
120 0.16
121 0.15
122 0.16
123 0.14
124 0.18
125 0.19
126 0.19
127 0.19
128 0.19
129 0.17
130 0.2
131 0.19
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.16
136 0.17
137 0.17
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.1
144 0.09
145 0.08
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.09
158 0.09
159 0.08
160 0.1
161 0.13
162 0.13
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.09
170 0.1
171 0.1
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.08
178 0.08
179 0.09
180 0.12
181 0.16
182 0.19
183 0.23
184 0.24
185 0.3
186 0.38
187 0.41
188 0.44
189 0.46
190 0.46
191 0.5
192 0.56
193 0.54
194 0.48
195 0.45
196 0.4
197 0.35
198 0.31
199 0.24
200 0.16
201 0.13
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.12
209 0.14
210 0.16
211 0.21
212 0.23
213 0.26
214 0.27
215 0.32
216 0.39
217 0.46
218 0.52
219 0.52
220 0.52
221 0.51
222 0.53
223 0.51
224 0.42
225 0.35
226 0.29
227 0.24
228 0.23
229 0.22
230 0.17
231 0.13
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.04
248 0.04
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.03
254 0.03
255 0.03
256 0.03
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.06
261 0.1
262 0.12
263 0.13
264 0.16
265 0.16
266 0.17
267 0.19
268 0.17
269 0.13
270 0.12
271 0.11
272 0.09
273 0.09
274 0.07
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.06
284 0.07
285 0.09
286 0.12
287 0.13
288 0.14
289 0.19
290 0.21
291 0.23
292 0.23
293 0.23
294 0.21
295 0.2
296 0.18
297 0.14
298 0.11
299 0.08
300 0.08
301 0.09
302 0.12
303 0.14
304 0.15
305 0.17
306 0.19
307 0.25
308 0.29
309 0.31
310 0.28
311 0.29
312 0.29
313 0.28
314 0.29
315 0.22
316 0.18
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.14
321 0.12
322 0.1
323 0.11
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.06
328 0.08
329 0.08
330 0.1
331 0.12
332 0.12
333 0.14
334 0.16
335 0.25
336 0.28
337 0.3
338 0.28
339 0.28
340 0.29
341 0.33
342 0.36
343 0.29
344 0.31
345 0.3
346 0.31
347 0.29
348 0.29
349 0.23
350 0.16
351 0.15
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.06
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.06
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.05
403 0.06
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.05
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.05
425 0.07
426 0.08
427 0.09
428 0.1
429 0.13
430 0.13
431 0.14
432 0.14
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.14
437 0.13
438 0.15
439 0.19
440 0.22
441 0.23
442 0.29
443 0.29
444 0.3
445 0.28
446 0.29
447 0.25
448 0.23
449 0.24
450 0.2
451 0.23
452 0.26
453 0.27
454 0.27
455 0.32
456 0.33
457 0.3
458 0.31
459 0.29
460 0.31
461 0.35
462 0.38
463 0.36
464 0.37
465 0.41
466 0.41
467 0.43
468 0.45
469 0.47
470 0.47
471 0.48
472 0.52
473 0.55
474 0.58
475 0.58
476 0.57
477 0.52
478 0.54
479 0.51
480 0.44
481 0.38
482 0.34
483 0.29
484 0.26
485 0.31
486 0.25
487 0.24
488 0.25
489 0.25
490 0.28
491 0.28
492 0.27
493 0.22
494 0.23
495 0.24
496 0.22
497 0.21
498 0.17
499 0.15
500 0.14
501 0.12
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.11
506 0.11
507 0.13
508 0.14
509 0.14
510 0.14
511 0.12
512 0.14
513 0.12
514 0.13
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.08
521 0.07
522 0.06
523 0.08
524 0.09
525 0.11
526 0.12
527 0.17
528 0.23
529 0.28