Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2YCX9

Protein Details
Accession A0A0D2YCX9    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-47DFAFVRKSKRIKTDKTDEPKPEHydrophilic
55-74EPVKKSAKGRPAAKHRAAKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-37KRIK
45-73KPEAVLEPKAEPVKKSAKGRPAAKHRAAK
99-107TRKSSRRKA
117-121KVPKR
173-181KKRGSGAKP
219-233MRKKGGNSNRRSSLG
235-235R
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013218  Dsn1/Mis13  
Gene Ontology GO:0000444  C:MIS12/MIND type complex  
GO:0051301  P:cell division  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08202  MIS13  
Amino Acid Sequences MSNEHGRRLSKRLAAAAATDYEHDDDFAFVRKSKRIKTDKTDEPKPEAVLEPKAEPVKKSAKGRPAAKHRAAKAPTTNGTIVEEEAPGKGTSATIRPATRKSSRRKAIDASDEREIKVPKRPSTSRSTRRSGEAQEKEASQPAPSSIPEPEPEPQPETVPEAAPASRVNGASKKRGSGAKPTRPPPDWDKSPQREPPVQSATITLPMSDTPIINRNKEMRKKGGNSNRRSSLGNRGRRASSLIESGQTAIPHREVNPADFYKHIAAEGLTEPRRMKQLLTWCGERALVGKPPQGTPNSNAILGARAIQDRLLKDFAAGSEFSDWFSREDDAQEVPLVLRPNPRNIELDEKLAQLEINIKRLQDEKKAWQAIRKPPPEQPPLFSEGETGPIVLPGFDLLDPYEGKIRGFLADETASFDAVRSRTESRLRTIQSSLEFQVDQLADNVHKLEQRVLLAGKEADKVLSISALRLRQREEREKASAGTRDMPAIEVLRSLGNILPKGGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.42
3 0.38
4 0.32
5 0.27
6 0.23
7 0.2
8 0.18
9 0.17
10 0.15
11 0.13
12 0.12
13 0.12
14 0.17
15 0.17
16 0.2
17 0.24
18 0.31
19 0.38
20 0.45
21 0.54
22 0.59
23 0.66
24 0.73
25 0.78
26 0.82
27 0.83
28 0.85
29 0.8
30 0.77
31 0.71
32 0.62
33 0.56
34 0.5
35 0.45
36 0.41
37 0.38
38 0.32
39 0.34
40 0.39
41 0.37
42 0.34
43 0.36
44 0.4
45 0.45
46 0.52
47 0.54
48 0.57
49 0.64
50 0.72
51 0.74
52 0.76
53 0.79
54 0.8
55 0.8
56 0.75
57 0.76
58 0.71
59 0.68
60 0.65
61 0.62
62 0.56
63 0.53
64 0.49
65 0.4
66 0.4
67 0.34
68 0.27
69 0.21
70 0.18
71 0.13
72 0.13
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.11
79 0.13
80 0.17
81 0.2
82 0.24
83 0.28
84 0.32
85 0.39
86 0.46
87 0.52
88 0.58
89 0.64
90 0.7
91 0.72
92 0.73
93 0.72
94 0.71
95 0.73
96 0.7
97 0.63
98 0.61
99 0.56
100 0.51
101 0.49
102 0.44
103 0.35
104 0.38
105 0.41
106 0.39
107 0.47
108 0.5
109 0.5
110 0.58
111 0.67
112 0.68
113 0.68
114 0.69
115 0.63
116 0.64
117 0.64
118 0.61
119 0.61
120 0.56
121 0.52
122 0.48
123 0.46
124 0.42
125 0.4
126 0.33
127 0.23
128 0.19
129 0.16
130 0.15
131 0.14
132 0.15
133 0.14
134 0.15
135 0.15
136 0.17
137 0.18
138 0.2
139 0.23
140 0.23
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.23
145 0.22
146 0.18
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.14
151 0.13
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.19
157 0.23
158 0.29
159 0.3
160 0.3
161 0.32
162 0.36
163 0.36
164 0.41
165 0.48
166 0.51
167 0.57
168 0.61
169 0.64
170 0.61
171 0.63
172 0.6
173 0.58
174 0.54
175 0.55
176 0.59
177 0.59
178 0.64
179 0.64
180 0.63
181 0.6
182 0.57
183 0.56
184 0.5
185 0.45
186 0.38
187 0.34
188 0.29
189 0.28
190 0.25
191 0.17
192 0.12
193 0.11
194 0.13
195 0.11
196 0.1
197 0.08
198 0.16
199 0.18
200 0.19
201 0.21
202 0.27
203 0.35
204 0.42
205 0.46
206 0.46
207 0.51
208 0.55
209 0.62
210 0.65
211 0.66
212 0.66
213 0.67
214 0.64
215 0.58
216 0.55
217 0.48
218 0.49
219 0.49
220 0.5
221 0.46
222 0.45
223 0.44
224 0.42
225 0.43
226 0.34
227 0.26
228 0.21
229 0.19
230 0.16
231 0.16
232 0.16
233 0.15
234 0.13
235 0.11
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.15
241 0.14
242 0.16
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.19
247 0.2
248 0.16
249 0.15
250 0.13
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.1
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.16
260 0.19
261 0.17
262 0.16
263 0.16
264 0.25
265 0.3
266 0.33
267 0.34
268 0.32
269 0.32
270 0.31
271 0.27
272 0.19
273 0.14
274 0.15
275 0.15
276 0.17
277 0.18
278 0.19
279 0.22
280 0.24
281 0.24
282 0.23
283 0.28
284 0.26
285 0.25
286 0.24
287 0.21
288 0.19
289 0.16
290 0.14
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.1
295 0.13
296 0.12
297 0.15
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.14
302 0.12
303 0.12
304 0.11
305 0.09
306 0.1
307 0.1
308 0.11
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.12
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.12
318 0.12
319 0.11
320 0.1
321 0.09
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.19
326 0.2
327 0.27
328 0.29
329 0.31
330 0.31
331 0.32
332 0.39
333 0.32
334 0.35
335 0.3
336 0.27
337 0.25
338 0.23
339 0.2
340 0.12
341 0.19
342 0.16
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.21
347 0.27
348 0.3
349 0.3
350 0.34
351 0.37
352 0.45
353 0.52
354 0.51
355 0.53
356 0.58
357 0.6
358 0.64
359 0.63
360 0.58
361 0.59
362 0.66
363 0.68
364 0.62
365 0.55
366 0.5
367 0.49
368 0.47
369 0.39
370 0.33
371 0.24
372 0.25
373 0.22
374 0.17
375 0.11
376 0.11
377 0.11
378 0.09
379 0.08
380 0.05
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.15
389 0.14
390 0.14
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.16
395 0.15
396 0.14
397 0.15
398 0.15
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.14
403 0.14
404 0.15
405 0.14
406 0.16
407 0.16
408 0.18
409 0.25
410 0.32
411 0.35
412 0.37
413 0.45
414 0.47
415 0.47
416 0.46
417 0.44
418 0.4
419 0.41
420 0.37
421 0.31
422 0.28
423 0.24
424 0.28
425 0.23
426 0.2
427 0.16
428 0.17
429 0.14
430 0.15
431 0.17
432 0.13
433 0.15
434 0.16
435 0.19
436 0.2
437 0.21
438 0.23
439 0.23
440 0.22
441 0.23
442 0.24
443 0.22
444 0.2
445 0.19
446 0.16
447 0.15
448 0.15
449 0.13
450 0.14
451 0.12
452 0.13
453 0.19
454 0.25
455 0.29
456 0.31
457 0.36
458 0.41
459 0.5
460 0.58
461 0.6
462 0.6
463 0.62
464 0.62
465 0.6
466 0.58
467 0.54
468 0.47
469 0.45
470 0.39
471 0.35
472 0.33
473 0.31
474 0.26
475 0.23
476 0.19
477 0.15
478 0.15
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.17
484 0.17