Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RN18

Protein Details
Accession E3RN18    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
184-213RQHPNYKYSPRKPGQKKKRQSRKTMGAAAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-206SPRKPGQKKKRQSRK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pte:PTT_09966  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MDSLDVPVVAPDSNISEVQATQAASERFDAALAACIEGHDRGDDLVILEDSLPLLFGDLLVEHFQRTVGEAIGTPVDLTVMDGGDKLYTLVTIFKINPSLQTPSPELTTLESHALDAGLRKAPRPMNCWIIFRDAKSKELKEQHPELSVQQISTRCSELWHDLTPEEKKPWKDAAQSAKEEHMRQHPNYKYSPRKPGQKKKRQSRKTMGAAAPTTTTQEAGKLQSASNMTAASTFVGTLALTGEGALDGVGNAPIGNFYDFFASEHALEQASQELVTENFRNSETMRQAQLEQEFGEFNFEELLAMFEEQQGLVFRDGAEDDGTFPTFFDDTY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.13
4 0.13
5 0.15
6 0.16
7 0.13
8 0.12
9 0.17
10 0.17
11 0.17
12 0.18
13 0.18
14 0.15
15 0.15
16 0.14
17 0.09
18 0.14
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.06
40 0.04
41 0.05
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.07
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.11
54 0.1
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.08
62 0.06
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.05
77 0.06
78 0.07
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.15
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.22
87 0.2
88 0.24
89 0.24
90 0.23
91 0.24
92 0.22
93 0.2
94 0.17
95 0.17
96 0.15
97 0.15
98 0.13
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.12
106 0.12
107 0.12
108 0.18
109 0.23
110 0.26
111 0.29
112 0.31
113 0.35
114 0.37
115 0.39
116 0.36
117 0.38
118 0.36
119 0.33
120 0.38
121 0.3
122 0.32
123 0.35
124 0.34
125 0.34
126 0.41
127 0.44
128 0.41
129 0.44
130 0.42
131 0.39
132 0.38
133 0.32
134 0.29
135 0.25
136 0.19
137 0.18
138 0.18
139 0.17
140 0.18
141 0.18
142 0.13
143 0.14
144 0.15
145 0.16
146 0.17
147 0.17
148 0.16
149 0.15
150 0.18
151 0.2
152 0.2
153 0.2
154 0.21
155 0.21
156 0.24
157 0.28
158 0.28
159 0.3
160 0.34
161 0.4
162 0.42
163 0.43
164 0.41
165 0.4
166 0.39
167 0.36
168 0.33
169 0.32
170 0.32
171 0.31
172 0.39
173 0.38
174 0.4
175 0.44
176 0.5
177 0.52
178 0.53
179 0.62
180 0.59
181 0.66
182 0.73
183 0.79
184 0.81
185 0.82
186 0.86
187 0.87
188 0.92
189 0.91
190 0.9
191 0.89
192 0.88
193 0.85
194 0.83
195 0.73
196 0.67
197 0.59
198 0.49
199 0.4
200 0.3
201 0.24
202 0.16
203 0.14
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.12
208 0.14
209 0.13
210 0.13
211 0.16
212 0.18
213 0.17
214 0.16
215 0.14
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.03
232 0.04
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.12
264 0.13
265 0.13
266 0.14
267 0.15
268 0.16
269 0.17
270 0.24
271 0.26
272 0.29
273 0.31
274 0.32
275 0.32
276 0.36
277 0.36
278 0.3
279 0.25
280 0.21
281 0.19
282 0.17
283 0.2
284 0.15
285 0.13
286 0.12
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.11
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.08
297 0.1
298 0.1
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.14
306 0.13
307 0.11
308 0.13
309 0.14
310 0.16
311 0.14
312 0.13
313 0.15