FuNGI

E3RCQ3

Protein Details

Accession

E3RCQ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
126-148	PTGTKKPPAFHKKTEQKYRPDDT	Hydrophilic
465-491	EASGNESSRKKHKKKHSEKFADGTRKS	Basic
505-530	SEMTDAGKKRKKDKKEKNRIMIGNTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
114-115	RK
128-137	GTKKPPAFHK
453-462	KSKKRPGSPN
467-483	SGNESSRKKHKKKHSEK
511-523	GKKRKKDKKEKNR

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	pte:PTT_00786 -

Amino Acid Sequences

MNEAKKTVPTAENGARSKEELKQEFINQGAHVFPLIVSRKDLKELRHHVMRLQSKSHIDIQDEKQFAPPIKLHRRDPRAPPSGVGSHYEEEDTKEDMEEIKERERIELQKEERRKVREENQAKIAPTGTKKPPAFHKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDYENKQTWVGTYESEMSETHVMLSTTNPGDIHTAIQLAPMERWYRFNVKNKVKSGSEDMEKLVTKLESGGPRFFAELERRQAQRVKAEDEAKLWGGVRTRVGGGADDEGRIKRERNDDDMGFIKREADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEEQDVKEAAEKLKRDQLQAALWDRPDEQLLARKEEEERRLAELTKASEKSTRKQLAKREKQYDYLDSDPENPYITESESDTDSETERQQAKEEAEKKAAEQNGKAVEGGNLPSGTSTKANTPSGNHKTSDGKSKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKKHSEKFADGTRKSTLGSFKAAGSGSDSEMTDAGKKRKKDKKEKNRIMIGNTPSATPGASRAGSPAAGNGSRAGSPTATGAAAPARPPLPSAKEIYDSLPPQGMNIQNLIVKFKGRVDKTNTQMFIKLVKAVSSFDKAKSWLTPLATMPSDEHISAFMNGGSAAKTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.44
3	0.43
4	0.44
5	0.42
6	0.45
7	0.4
8	0.43
9	0.44
10	0.46
11	0.47
12	0.46
13	0.42
14	0.32
15	0.3
16	0.25
17	0.2
18	0.17
19	0.13
20	0.11
21	0.16
22	0.2
23	0.2
24	0.23
25	0.28
26	0.3
27	0.37
28	0.41
29	0.39
30	0.46
31	0.53
32	0.57
33	0.6
34	0.59
35	0.56
36	0.62
37	0.64
38	0.59
39	0.55
40	0.53
41	0.49
42	0.52
43	0.55
44	0.48
45	0.44
46	0.46
47	0.48
48	0.5
49	0.48
50	0.45
51	0.42
52	0.42
53	0.4
54	0.37
55	0.35
56	0.37
57	0.46
58	0.53
59	0.58
60	0.64
61	0.71
62	0.74
63	0.8
64	0.8
65	0.77
66	0.71
67	0.64
68	0.59
69	0.55
70	0.49
71	0.43
72	0.37
73	0.3
74	0.3
75	0.29
76	0.24
77	0.22
78	0.23
79	0.2
80	0.16
81	0.15
82	0.15
83	0.15
84	0.17
85	0.19
86	0.2
87	0.23
88	0.26
89	0.26
90	0.28
91	0.32
92	0.34
93	0.36
94	0.42
95	0.44
96	0.5
97	0.57
98	0.62
99	0.64
100	0.64
101	0.63
102	0.63
103	0.66
104	0.68
105	0.67
106	0.65
107	0.67
108	0.66
109	0.61
110	0.54
111	0.46
112	0.41
113	0.38
114	0.39
115	0.36
116	0.41
117	0.42
118	0.45
119	0.54
120	0.6
121	0.63
122	0.63
123	0.69
124	0.7
125	0.79
126	0.85
127	0.82
128	0.81
129	0.82
130	0.8
131	0.75
132	0.71
133	0.68
134	0.63
135	0.67
136	0.66
137	0.65
138	0.62
139	0.61
140	0.61
141	0.63
142	0.64
143	0.59
144	0.56
145	0.55
146	0.58
147	0.55
148	0.52
149	0.46
150	0.38
151	0.33
152	0.29
153	0.22
154	0.19
155	0.2
156	0.24
157	0.3
158	0.3
159	0.29
160	0.28
161	0.28
162	0.27
163	0.26
164	0.19
165	0.1
166	0.11
167	0.14
168	0.14
169	0.15
170	0.14
171	0.14
172	0.14
173	0.13
174	0.12
175	0.11
176	0.1
177	0.09
178	0.1
179	0.12
180	0.11
181	0.12
182	0.11
183	0.11
184	0.12
185	0.12
186	0.13
187	0.09
188	0.1
189	0.09
190	0.1
191	0.1
192	0.09
193	0.09
194	0.11
195	0.13
196	0.12
197	0.15
198	0.18
199	0.25
200	0.31
201	0.41
202	0.49
203	0.56
204	0.64
205	0.65
206	0.66
207	0.6
208	0.56
209	0.52
210	0.47
211	0.4
212	0.33
213	0.3
214	0.28
215	0.27
216	0.24
217	0.19
218	0.14
219	0.11
220	0.11
221	0.15
222	0.16
223	0.19
224	0.2
225	0.2
226	0.2
227	0.2
228	0.19
229	0.19
230	0.2
231	0.23
232	0.27
233	0.31
234	0.32
235	0.34
236	0.38
237	0.38
238	0.38
239	0.36
240	0.34
241	0.35
242	0.37
243	0.35
244	0.31
245	0.3
246	0.24
247	0.21
248	0.18
249	0.14
250	0.13
251	0.13
252	0.12
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.11
257	0.1
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.12
265	0.12
266	0.13
267	0.16
268	0.23
269	0.25
270	0.3
271	0.34
272	0.32
273	0.33
274	0.36
275	0.32
276	0.25
277	0.22
278	0.17
279	0.13
280	0.13
281	0.11
282	0.09
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.05
291	0.05
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.04
299	0.04
300	0.04
301	0.04
302	0.03
303	0.03
304	0.02
305	0.02
306	0.02
307	0.03
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.05
312	0.06
313	0.06
314	0.07
315	0.07
316	0.09
317	0.12
318	0.13
319	0.15
320	0.21
321	0.23
322	0.23
323	0.23
324	0.24
325	0.22
326	0.26
327	0.26
328	0.21
329	0.2
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.15
334	0.11
335	0.09
336	0.15
337	0.16
338	0.19
339	0.18
340	0.19
341	0.22
342	0.27
343	0.29
344	0.24
345	0.24
346	0.24
347	0.25
348	0.25
349	0.23
350	0.2
351	0.2
352	0.23
353	0.22
354	0.2
355	0.25
356	0.27
357	0.3
358	0.37
359	0.42
360	0.43
361	0.47
362	0.56
363	0.61
364	0.7
365	0.74
366	0.72
367	0.67
368	0.68
369	0.66
370	0.6
371	0.54
372	0.45
373	0.38
374	0.3
375	0.31
376	0.26
377	0.23
378	0.19
379	0.14
380	0.13
381	0.12
382	0.12
383	0.1
384	0.09
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.1
389	0.1
390	0.1
391	0.11
392	0.11
393	0.16
394	0.18
395	0.18
396	0.19
397	0.21
398	0.22
399	0.29
400	0.33
401	0.31
402	0.32
403	0.31
404	0.31
405	0.34
406	0.35
407	0.29
408	0.25
409	0.26
410	0.24
411	0.25
412	0.24
413	0.18
414	0.16
415	0.15
416	0.15
417	0.12
418	0.1
419	0.09
420	0.09
421	0.09
422	0.1
423	0.1
424	0.1
425	0.13
426	0.18
427	0.2
428	0.21
429	0.24
430	0.33
431	0.39
432	0.4
433	0.37
434	0.35
435	0.39
436	0.4
437	0.48
438	0.46
439	0.48
440	0.54
441	0.64
442	0.68
443	0.71
444	0.77
445	0.73
446	0.76
447	0.72
448	0.7
449	0.62
450	0.56
451	0.47
452	0.39
453	0.38
454	0.3
455	0.25
456	0.23
457	0.24
458	0.27
459	0.37
460	0.47
461	0.49
462	0.56
463	0.67
464	0.74
465	0.82
466	0.9
467	0.91
468	0.9
469	0.88
470	0.85
471	0.84
472	0.82
473	0.72
474	0.64
475	0.55
476	0.45
477	0.4
478	0.36
479	0.31
480	0.24
481	0.27
482	0.24
483	0.22
484	0.25
485	0.24
486	0.2
487	0.19
488	0.18
489	0.15
490	0.16
491	0.15
492	0.13
493	0.13
494	0.14
495	0.15
496	0.2
497	0.27
498	0.32
499	0.37
500	0.47
501	0.55
502	0.66
503	0.72
504	0.78
505	0.81
506	0.87
507	0.93
508	0.92
509	0.93
510	0.86
511	0.81
512	0.77
513	0.7
514	0.65
515	0.55
516	0.45
517	0.36
518	0.31
519	0.25
520	0.17
521	0.16
522	0.13
523	0.13
524	0.13
525	0.14
526	0.15
527	0.16
528	0.16
529	0.15
530	0.15
531	0.15
532	0.16
533	0.16
534	0.16
535	0.15
536	0.17
537	0.16
538	0.12
539	0.12
540	0.12
541	0.12
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.11
546	0.12
547	0.12
548	0.15
549	0.14
550	0.14
551	0.16
552	0.21
553	0.24
554	0.26
555	0.3
556	0.3
557	0.33
558	0.34
559	0.35
560	0.37
561	0.32
562	0.31
563	0.3
564	0.26
565	0.23
566	0.28
567	0.28
568	0.23
569	0.23
570	0.23
571	0.22
572	0.23
573	0.25
574	0.2
575	0.19
576	0.19
577	0.24
578	0.31
579	0.33
580	0.4
581	0.46
582	0.55
583	0.59
584	0.66
585	0.63
586	0.56
587	0.55
588	0.48
589	0.44
590	0.36
591	0.35
592	0.26
593	0.26
594	0.25
595	0.24
596	0.27
597	0.29
598	0.31
599	0.28
600	0.31
601	0.31
602	0.33
603	0.33
604	0.33
605	0.32
606	0.32
607	0.33
608	0.32
609	0.36
610	0.34
611	0.32
612	0.29
613	0.28
614	0.28
615	0.24
616	0.22
617	0.17
618	0.18
619	0.18
620	0.17
621	0.13
622	0.11
623	0.11
624	0.11

E3RCQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer