Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RNB8

Protein Details
Accession E3RNB8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
404-431DGTVLRERDKPRNPKKKMWEEDVESKKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
414-419PRNPKK
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 5, plas 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005606  Sec20  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005484  F:SNAP receptor activity  
GO:0006890  P:retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum  
KEGG pte:PTT_10058  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03908  Sec20  
Amino Acid Sequences MVPIPSTTQALTTRLNTLSESNKAIGQLIQRLAKLDFQPGSQPLDATDEGDVRLELSAEIHESLKGLEEELEFLRQEVEDVTLQGTLSGRRRNSTKDNERSRLAVLLARLTEDLRLSRSQYRKAQLTAKHNADRAKLKERELLFSNLQSGSSTPSSTYRQRKQQQGISEGEIVAQASSDVTTALRRTHQLMQEELSRSRFAQETLEQSSAALEDLGEKYSDLNTLLANSRSLVTTLVKSTKTDTWYLETTFYILITTVIWLIFRRWLYGPLTWFLIWPVKLVFRVLFAVLPFGAASSATTSSVAVSSSSRTLIVQPSAAGGIPRRQPNAEPHYIPAGRGGGARIHEHDPSPPNSYSQKVGKMAEQNQQQQQQQQQQQAEEVPDHPQFRKQNKQEEDEGPVTLGDGTVLRERDKPRNPKKKMWEEDVESKKFEEAQKEKQEAGGEEMKRDEL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.27
4 0.28
5 0.3
6 0.3
7 0.31
8 0.28
9 0.28
10 0.27
11 0.27
12 0.25
13 0.24
14 0.27
15 0.29
16 0.31
17 0.3
18 0.31
19 0.31
20 0.34
21 0.32
22 0.32
23 0.28
24 0.26
25 0.31
26 0.31
27 0.35
28 0.3
29 0.28
30 0.22
31 0.26
32 0.25
33 0.21
34 0.2
35 0.16
36 0.16
37 0.16
38 0.15
39 0.1
40 0.1
41 0.09
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.08
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.14
58 0.16
59 0.13
60 0.13
61 0.13
62 0.11
63 0.11
64 0.09
65 0.11
66 0.09
67 0.1
68 0.11
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.19
75 0.24
76 0.25
77 0.29
78 0.33
79 0.39
80 0.47
81 0.54
82 0.59
83 0.63
84 0.71
85 0.72
86 0.71
87 0.66
88 0.58
89 0.49
90 0.39
91 0.31
92 0.22
93 0.2
94 0.18
95 0.17
96 0.16
97 0.14
98 0.14
99 0.13
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.17
104 0.25
105 0.3
106 0.37
107 0.43
108 0.48
109 0.49
110 0.52
111 0.56
112 0.55
113 0.58
114 0.59
115 0.59
116 0.58
117 0.56
118 0.55
119 0.53
120 0.53
121 0.5
122 0.51
123 0.47
124 0.45
125 0.49
126 0.47
127 0.46
128 0.42
129 0.42
130 0.33
131 0.3
132 0.3
133 0.24
134 0.22
135 0.18
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.15
142 0.19
143 0.27
144 0.36
145 0.39
146 0.49
147 0.56
148 0.64
149 0.68
150 0.69
151 0.67
152 0.63
153 0.59
154 0.51
155 0.45
156 0.35
157 0.28
158 0.23
159 0.16
160 0.11
161 0.08
162 0.04
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.08
171 0.09
172 0.11
173 0.15
174 0.2
175 0.24
176 0.25
177 0.25
178 0.26
179 0.3
180 0.31
181 0.29
182 0.25
183 0.21
184 0.19
185 0.19
186 0.18
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.17
191 0.2
192 0.2
193 0.19
194 0.18
195 0.17
196 0.14
197 0.11
198 0.07
199 0.04
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.1
223 0.13
224 0.13
225 0.14
226 0.16
227 0.18
228 0.2
229 0.21
230 0.2
231 0.2
232 0.22
233 0.22
234 0.21
235 0.17
236 0.16
237 0.13
238 0.12
239 0.08
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.12
253 0.15
254 0.17
255 0.19
256 0.2
257 0.18
258 0.2
259 0.17
260 0.17
261 0.15
262 0.17
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.12
267 0.12
268 0.14
269 0.12
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.1
274 0.09
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.07
279 0.06
280 0.05
281 0.04
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.11
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.12
306 0.11
307 0.09
308 0.14
309 0.19
310 0.23
311 0.25
312 0.26
313 0.29
314 0.37
315 0.43
316 0.44
317 0.4
318 0.38
319 0.44
320 0.43
321 0.4
322 0.33
323 0.26
324 0.21
325 0.2
326 0.19
327 0.14
328 0.15
329 0.17
330 0.18
331 0.19
332 0.2
333 0.2
334 0.25
335 0.27
336 0.28
337 0.32
338 0.29
339 0.3
340 0.32
341 0.33
342 0.34
343 0.34
344 0.37
345 0.36
346 0.36
347 0.38
348 0.43
349 0.47
350 0.49
351 0.51
352 0.52
353 0.54
354 0.59
355 0.56
356 0.54
357 0.56
358 0.58
359 0.57
360 0.57
361 0.54
362 0.49
363 0.49
364 0.45
365 0.39
366 0.32
367 0.26
368 0.24
369 0.25
370 0.28
371 0.27
372 0.32
373 0.39
374 0.46
375 0.56
376 0.58
377 0.65
378 0.68
379 0.73
380 0.72
381 0.67
382 0.66
383 0.56
384 0.49
385 0.39
386 0.32
387 0.26
388 0.19
389 0.15
390 0.08
391 0.07
392 0.09
393 0.13
394 0.15
395 0.16
396 0.23
397 0.29
398 0.39
399 0.48
400 0.57
401 0.64
402 0.74
403 0.79
404 0.83
405 0.88
406 0.89
407 0.88
408 0.85
409 0.83
410 0.8
411 0.82
412 0.82
413 0.74
414 0.64
415 0.57
416 0.49
417 0.45
418 0.42
419 0.42
420 0.4
421 0.47
422 0.55
423 0.58
424 0.57
425 0.55
426 0.55
427 0.46
428 0.46
429 0.43
430 0.35
431 0.34