Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PHX6

Protein Details
Accession A0A1D8PHX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-259VTKTSKAGTTKGNKRKNKPHKVTKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
240-259KAGTTKGNKRKNKPHKVTKP
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034158  SF3B4_RRM1  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005686  C:U2 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003730  F:mRNA 3'-UTR binding  
GO:0008143  F:poly(A) binding  
GO:0008266  F:poly(U) RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG cal:CAALFM_C207060WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12334  RRM1_SF3B4  
Amino Acid Sequences MSIIFRKRLDSDRNIDASLYFGNIDPQVTELLMYELFIQFGPVKSINMPKDRILKTHQGYGFVEFKNSADAKYTMEILRGIRLYGKALKLKRIDAKSQSSTNNPNNQTIGTFVQSDLINPNYIDVGAKLFINNLNPLVDESFLMDTFSKFGTLIRNPIIRRDSEGHSLGYGFLTYDDFESSDLCIQKMNNTILMNNKIAISYAFKDLSVDGKKSRHGDQVERKLAESAKKNNLLVTKTSKAGTTKGNKRKNKPHKVTKP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.48
3 0.4
4 0.33
5 0.26
6 0.2
7 0.13
8 0.1
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.1
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.1
17 0.08
18 0.09
19 0.08
20 0.08
21 0.09
22 0.08
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.14
29 0.13
30 0.14
31 0.17
32 0.25
33 0.29
34 0.33
35 0.35
36 0.36
37 0.45
38 0.46
39 0.47
40 0.45
41 0.49
42 0.46
43 0.52
44 0.48
45 0.42
46 0.42
47 0.42
48 0.42
49 0.32
50 0.31
51 0.23
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.18
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.18
60 0.2
61 0.15
62 0.16
63 0.17
64 0.14
65 0.16
66 0.15
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.15
71 0.18
72 0.21
73 0.25
74 0.26
75 0.33
76 0.34
77 0.38
78 0.43
79 0.44
80 0.45
81 0.45
82 0.5
83 0.48
84 0.49
85 0.47
86 0.43
87 0.47
88 0.47
89 0.49
90 0.44
91 0.42
92 0.38
93 0.36
94 0.31
95 0.26
96 0.21
97 0.14
98 0.12
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.1
107 0.1
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.07
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.12
139 0.12
140 0.16
141 0.18
142 0.23
143 0.23
144 0.29
145 0.3
146 0.25
147 0.28
148 0.29
149 0.29
150 0.29
151 0.31
152 0.26
153 0.24
154 0.23
155 0.19
156 0.15
157 0.11
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.12
172 0.12
173 0.15
174 0.2
175 0.2
176 0.21
177 0.21
178 0.22
179 0.27
180 0.3
181 0.28
182 0.23
183 0.22
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.17
193 0.17
194 0.23
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.27
199 0.32
200 0.35
201 0.39
202 0.4
203 0.41
204 0.48
205 0.55
206 0.63
207 0.66
208 0.63
209 0.6
210 0.55
211 0.54
212 0.51
213 0.48
214 0.46
215 0.47
216 0.51
217 0.51
218 0.51
219 0.53
220 0.48
221 0.46
222 0.46
223 0.4
224 0.38
225 0.38
226 0.38
227 0.35
228 0.35
229 0.39
230 0.42
231 0.49
232 0.57
233 0.66
234 0.72
235 0.8
236 0.88
237 0.9
238 0.91
239 0.91