Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2XW34

Protein Details
Accession A0A0D2XW34    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-255DRDERRSQSRGRSRSRSRSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-152RKLRRRG
246-252GRSRSRS
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 1, plas 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG fox:FOXG_08198  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSRNKDTVHADARRFLDERGSNVSVAPNGLNPATIMEKAVKDRIVDSYFYKEQCFALNEADIVDRVVEHVNFIGGTYGVTQKPSPFLCLAFKLLELSPSDAVLMEYLKYGGEAFKYLRALACFYFRLTRQAKDVYEMLEPFLEDRRKLRRRGRAGVVLTFMDEFVDELLTKERVCGTSLWKMPKREVLEDLEILEPRVSPLGDLEDLLEEEDEAEKENGTREESGEISDRDDMEVDRDERRSQSRGRSRSRSRSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.39
3 0.39
4 0.35
5 0.36
6 0.37
7 0.36
8 0.32
9 0.31
10 0.33
11 0.24
12 0.23
13 0.2
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.1
19 0.12
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.19
26 0.23
27 0.22
28 0.2
29 0.22
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.25
34 0.29
35 0.31
36 0.31
37 0.31
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.2
43 0.18
44 0.18
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.12
49 0.1
50 0.08
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.07
59 0.08
60 0.07
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.09
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.16
70 0.16
71 0.18
72 0.16
73 0.17
74 0.18
75 0.2
76 0.21
77 0.17
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.15
82 0.13
83 0.13
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.07
90 0.07
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.11
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.14
112 0.13
113 0.21
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.25
118 0.25
119 0.25
120 0.25
121 0.19
122 0.19
123 0.18
124 0.15
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.16
132 0.26
133 0.32
134 0.4
135 0.48
136 0.53
137 0.6
138 0.67
139 0.69
140 0.67
141 0.64
142 0.57
143 0.51
144 0.41
145 0.33
146 0.25
147 0.19
148 0.1
149 0.08
150 0.06
151 0.04
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.1
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.15
164 0.22
165 0.28
166 0.36
167 0.4
168 0.41
169 0.43
170 0.49
171 0.48
172 0.44
173 0.42
174 0.39
175 0.36
176 0.35
177 0.34
178 0.28
179 0.24
180 0.21
181 0.18
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.07
187 0.08
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.11
194 0.11
195 0.1
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.12
205 0.13
206 0.15
207 0.16
208 0.14
209 0.17
210 0.17
211 0.19
212 0.2
213 0.19
214 0.19
215 0.2
216 0.2
217 0.18
218 0.18
219 0.16
220 0.15
221 0.2
222 0.2
223 0.21
224 0.24
225 0.26
226 0.3
227 0.34
228 0.37
229 0.38
230 0.47
231 0.54
232 0.61
233 0.68
234 0.74
235 0.8