Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RIU2

Protein Details
Accession E3RIU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
423-444DEFLRPRKLEWKGNPNPTKPKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
467-492NAQKKAAKMAEVERKKKEKEAAAAAK
Subcellular Location(s) cyto 12.5cyto_nucl 12.5, nucl 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001412  aa-tRNA-synth_I_CS  
IPR002305  aa-tRNA-synth_Ic  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR002306  Trp-tRNA-ligase  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0004830  F:tryptophan-tRNA ligase activity  
GO:0006436  P:tryptophanyl-tRNA aminoacylation  
KEGG pte:PTT_07987  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00579  tRNA-synt_1b  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00178  AA_TRNA_LIGASE_I  
Amino Acid Sequences MTEPEPPAVAALSLADTAAQPISKATEQEINPWDVQAAVDEDGNVKEFDYVKISEQWATKLIDQPLLDRFERVTGHKPHRWLRRGLFFSHRDLELILDVYERGDDFLLYTGRGPSSDAMHIGHTIPFEFTKWLQDVFDVPLVIMLTDDEKFLFKEKLKQEEVYEFSRQNAKDIISIGFDVKKTFMYIDSEFFTSGYNRHFSLNTTEFEKLITNNQVRGAFGFHGSTNIGSNAFAAKQCVAAFASSYPFIWGEDYKTYRRSKKLADIPCLIPCAIDQDPYFRLVRENCNRMDLPSPKPALIHSKFLTALQGSGGKMSASNANSAIFMSDTPKQIKNKINTKAFSGGQETLELHREKGGNPDIDVPYQYIAYFEDDDEKLKKLAEDYRKGELLTGEMKRECVDTMTAYTKRFQDARASVTDEILDEFLRPRKLEWKGNPNPTKPKLEQPKEETEGGPMLDADGKPMTKNAQKKAAKMAEVERKKKEKEAAAAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.08
5 0.09
6 0.09
7 0.07
8 0.09
9 0.14
10 0.15
11 0.16
12 0.18
13 0.24
14 0.25
15 0.33
16 0.36
17 0.35
18 0.34
19 0.33
20 0.3
21 0.22
22 0.22
23 0.16
24 0.14
25 0.1
26 0.1
27 0.1
28 0.12
29 0.12
30 0.14
31 0.12
32 0.1
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.17
37 0.18
38 0.19
39 0.24
40 0.25
41 0.27
42 0.27
43 0.28
44 0.28
45 0.29
46 0.29
47 0.31
48 0.32
49 0.32
50 0.3
51 0.31
52 0.32
53 0.34
54 0.32
55 0.26
56 0.25
57 0.24
58 0.26
59 0.28
60 0.31
61 0.36
62 0.45
63 0.48
64 0.55
65 0.6
66 0.68
67 0.7
68 0.7
69 0.68
70 0.7
71 0.69
72 0.66
73 0.67
74 0.6
75 0.59
76 0.55
77 0.47
78 0.37
79 0.33
80 0.29
81 0.21
82 0.19
83 0.13
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.11
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.11
115 0.12
116 0.12
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.13
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.11
130 0.09
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.1
139 0.14
140 0.14
141 0.23
142 0.28
143 0.36
144 0.38
145 0.4
146 0.4
147 0.42
148 0.44
149 0.39
150 0.37
151 0.3
152 0.29
153 0.33
154 0.3
155 0.26
156 0.25
157 0.22
158 0.2
159 0.21
160 0.2
161 0.14
162 0.15
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.11
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.13
173 0.14
174 0.15
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.15
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.21
189 0.22
190 0.21
191 0.22
192 0.22
193 0.21
194 0.21
195 0.2
196 0.14
197 0.14
198 0.2
199 0.18
200 0.19
201 0.22
202 0.22
203 0.21
204 0.21
205 0.19
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.12
240 0.15
241 0.17
242 0.23
243 0.29
244 0.33
245 0.37
246 0.39
247 0.39
248 0.45
249 0.52
250 0.53
251 0.53
252 0.52
253 0.49
254 0.47
255 0.44
256 0.34
257 0.25
258 0.18
259 0.17
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.14
264 0.15
265 0.17
266 0.17
267 0.13
268 0.16
269 0.17
270 0.26
271 0.3
272 0.34
273 0.33
274 0.37
275 0.37
276 0.35
277 0.39
278 0.34
279 0.31
280 0.33
281 0.34
282 0.3
283 0.3
284 0.3
285 0.33
286 0.31
287 0.32
288 0.26
289 0.27
290 0.27
291 0.27
292 0.27
293 0.18
294 0.16
295 0.11
296 0.13
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.12
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.07
312 0.07
313 0.09
314 0.11
315 0.14
316 0.18
317 0.23
318 0.25
319 0.32
320 0.4
321 0.45
322 0.51
323 0.57
324 0.61
325 0.57
326 0.59
327 0.56
328 0.5
329 0.44
330 0.39
331 0.32
332 0.24
333 0.25
334 0.22
335 0.18
336 0.23
337 0.21
338 0.17
339 0.19
340 0.19
341 0.18
342 0.25
343 0.29
344 0.25
345 0.25
346 0.31
347 0.29
348 0.29
349 0.29
350 0.23
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.1
355 0.09
356 0.11
357 0.11
358 0.1
359 0.14
360 0.14
361 0.17
362 0.18
363 0.19
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.25
369 0.32
370 0.39
371 0.41
372 0.46
373 0.46
374 0.46
375 0.43
376 0.35
377 0.29
378 0.27
379 0.25
380 0.24
381 0.23
382 0.24
383 0.23
384 0.24
385 0.21
386 0.16
387 0.15
388 0.13
389 0.17
390 0.23
391 0.25
392 0.26
393 0.29
394 0.29
395 0.32
396 0.32
397 0.3
398 0.32
399 0.33
400 0.36
401 0.37
402 0.39
403 0.35
404 0.34
405 0.32
406 0.23
407 0.2
408 0.17
409 0.13
410 0.09
411 0.12
412 0.17
413 0.2
414 0.2
415 0.21
416 0.29
417 0.37
418 0.46
419 0.52
420 0.58
421 0.64
422 0.74
423 0.81
424 0.8
425 0.83
426 0.79
427 0.79
428 0.71
429 0.72
430 0.72
431 0.73
432 0.74
433 0.71
434 0.75
435 0.7
436 0.7
437 0.59
438 0.51
439 0.45
440 0.35
441 0.28
442 0.18
443 0.15
444 0.17
445 0.16
446 0.15
447 0.16
448 0.17
449 0.17
450 0.19
451 0.25
452 0.28
453 0.37
454 0.41
455 0.49
456 0.53
457 0.56
458 0.65
459 0.65
460 0.61
461 0.58
462 0.6
463 0.6
464 0.66
465 0.69
466 0.68
467 0.69
468 0.7
469 0.73
470 0.72
471 0.69
472 0.68