Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2YBR6

Protein Details
Accession A0A0D2YBR6    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-31DHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTBasic
47-74PEASSDLKAEKKKKKSKKDKHTEDAVAQHydrophilic
78-104KAPAVEDKSEKKHKKKKHHDAEVAVTEBasic
108-132TPVAADSEKKKKKSKKNHKETEAIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-42AKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTERKHKKSKSVA
52-66DLKAEKKKKKSKKDK
85-95KSEKKHKKKKH
116-142KKKKKSKKNHKETEAIEIAERPKKSKK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 11.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
KEGG fox:FOXG_13744  -  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDHAAAKAEKKAKKEKKRAREEDAAADTERKHKKSKSVAAVEAPEASSDLKAEKKKKKSKKDKHTEDAVAQEETKAPAVEDKSEKKHKKKKHHDAEVAVTEEVDTPVAADSEKKKKKSKKNHKETEAIEIAERPKKSKKDETAAEPEENASPADADAMEIDMPPPAKPSKSNSNIYQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLFPIGWAQPVTNCQQQHLSHLRNKYVPSLRGVLLDYKNVAFGENPGRKGAATDDESPATVMAKGESAVGFGWITADVDLFVPSRGAWMEAVLTCRLRDTLALFALASSTLQLKLVDFLPTGSGFPTNPPRPKALRRPLQSSPPTITAWFVKSTAPVSGPTPRRQSLRARFASGYVTSTSAPVVRPAISAWRAQC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.63
3 0.69
4 0.79
5 0.82
6 0.84
7 0.91
8 0.93
9 0.9
10 0.89
11 0.83
12 0.81
13 0.74
14 0.66
15 0.56
16 0.5
17 0.43
18 0.42
19 0.45
20 0.4
21 0.44
22 0.46
23 0.54
24 0.62
25 0.7
26 0.72
27 0.71
28 0.73
29 0.7
30 0.68
31 0.59
32 0.5
33 0.4
34 0.3
35 0.22
36 0.18
37 0.13
38 0.1
39 0.12
40 0.17
41 0.25
42 0.35
43 0.43
44 0.54
45 0.64
46 0.74
47 0.83
48 0.88
49 0.91
50 0.93
51 0.95
52 0.94
53 0.92
54 0.91
55 0.85
56 0.77
57 0.72
58 0.63
59 0.53
60 0.42
61 0.34
62 0.26
63 0.22
64 0.19
65 0.14
66 0.11
67 0.14
68 0.16
69 0.2
70 0.25
71 0.31
72 0.38
73 0.49
74 0.58
75 0.64
76 0.72
77 0.76
78 0.81
79 0.86
80 0.89
81 0.9
82 0.92
83 0.89
84 0.86
85 0.83
86 0.76
87 0.67
88 0.55
89 0.44
90 0.33
91 0.25
92 0.2
93 0.12
94 0.07
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.08
100 0.14
101 0.25
102 0.32
103 0.38
104 0.47
105 0.57
106 0.68
107 0.76
108 0.82
109 0.82
110 0.87
111 0.91
112 0.89
113 0.87
114 0.78
115 0.75
116 0.67
117 0.56
118 0.45
119 0.36
120 0.33
121 0.3
122 0.29
123 0.24
124 0.28
125 0.33
126 0.4
127 0.47
128 0.51
129 0.54
130 0.59
131 0.63
132 0.65
133 0.62
134 0.56
135 0.46
136 0.4
137 0.31
138 0.27
139 0.19
140 0.1
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.05
152 0.06
153 0.05
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.12
158 0.17
159 0.27
160 0.33
161 0.38
162 0.39
163 0.46
164 0.51
165 0.51
166 0.5
167 0.4
168 0.35
169 0.32
170 0.29
171 0.23
172 0.22
173 0.23
174 0.2
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.21
179 0.18
180 0.16
181 0.12
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.11
187 0.11
188 0.1
189 0.1
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.1
199 0.14
200 0.17
201 0.17
202 0.16
203 0.21
204 0.21
205 0.28
206 0.33
207 0.34
208 0.35
209 0.39
210 0.4
211 0.38
212 0.39
213 0.39
214 0.37
215 0.34
216 0.32
217 0.32
218 0.29
219 0.28
220 0.28
221 0.26
222 0.21
223 0.2
224 0.18
225 0.15
226 0.15
227 0.14
228 0.13
229 0.08
230 0.1
231 0.18
232 0.21
233 0.22
234 0.22
235 0.22
236 0.22
237 0.22
238 0.21
239 0.17
240 0.17
241 0.19
242 0.2
243 0.2
244 0.21
245 0.2
246 0.18
247 0.13
248 0.1
249 0.08
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.08
278 0.09
279 0.12
280 0.13
281 0.13
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.11
286 0.12
287 0.11
288 0.14
289 0.14
290 0.15
291 0.14
292 0.13
293 0.13
294 0.12
295 0.1
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.11
311 0.12
312 0.1
313 0.15
314 0.25
315 0.32
316 0.37
317 0.4
318 0.46
319 0.52
320 0.62
321 0.67
322 0.68
323 0.7
324 0.7
325 0.75
326 0.75
327 0.77
328 0.73
329 0.67
330 0.61
331 0.55
332 0.5
333 0.43
334 0.39
335 0.33
336 0.3
337 0.27
338 0.23
339 0.2
340 0.21
341 0.21
342 0.21
343 0.19
344 0.18
345 0.2
346 0.28
347 0.34
348 0.39
349 0.45
350 0.47
351 0.5
352 0.54
353 0.61
354 0.63
355 0.67
356 0.65
357 0.63
358 0.6
359 0.57
360 0.57
361 0.47
362 0.39
363 0.3
364 0.26
365 0.21
366 0.2
367 0.2
368 0.17
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.16
373 0.17
374 0.18
375 0.25
376 0.26