Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S8W6

Protein Details
Accession E3S8W6    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-285SSKTSAKRQTKPPSPRKPSDHydrophilic
433-452QTTMTPKKARKPFRIGGKGKHydrophilic
499-530PEEKAERKRAELKRKNEEATKKLARAKKKKRFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
439-451KKARKPFRIGGKG
502-530KAERKRAELKRKNEEATKKLARAKKKKRF
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG pte:PTT_19451  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSCWRVLKLSEEPGDKQVPQLLIKPAFQSDSYILHLTDLSNIWSEESDLDSIVNRASQEQSPIEVSNQDTAQLAILLDNVKKSLVNGHDAVCRMTRNDDDGIILHTSICLPEPLDRLTWKFYLKKRTATILKNELILPLLVSSHIQHERINGLITTIDSKDKAITRLADHFDSNNMDFAAAFPSIGGTKSGRRMVKREQAAKHIPALKSFREDAWRQETGQLRNSDLTTLGLFQEALAHSTPDVPIQLKSEDHEQDWWTALSTHLSSKTSAKRQTKPPSPRKPSDVVAGSSDEETEDEFENHEHFNTHTIASKPANIPVQTPSLPPNEAQSITEDSTEDEDDLDVPSKDDSQSQRRAPHTSSSRNPSLKHSPPHKATDPPAAKTKVNTFRIGGKSKVSIESPPSSAIVTGTDADLDDLLPTKEFIPPCSPPTQTTMTPKKARKPFRIGGKGKATDIEASQSAFRVRQTQSPTVDPPSSPPLREAVREPTPIKEVIEETPEEKAERKRAELKRKNEEATKKLARAKKKKRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.44
3 0.4
4 0.37
5 0.34
6 0.32
7 0.34
8 0.37
9 0.36
10 0.38
11 0.38
12 0.35
13 0.34
14 0.32
15 0.3
16 0.25
17 0.24
18 0.26
19 0.26
20 0.23
21 0.22
22 0.22
23 0.18
24 0.18
25 0.16
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.12
33 0.13
34 0.12
35 0.11
36 0.11
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.1
42 0.11
43 0.15
44 0.16
45 0.2
46 0.2
47 0.22
48 0.23
49 0.24
50 0.23
51 0.22
52 0.22
53 0.22
54 0.2
55 0.19
56 0.16
57 0.15
58 0.14
59 0.12
60 0.11
61 0.07
62 0.08
63 0.1
64 0.1
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.11
70 0.17
71 0.17
72 0.22
73 0.23
74 0.25
75 0.29
76 0.3
77 0.31
78 0.26
79 0.24
80 0.21
81 0.23
82 0.22
83 0.22
84 0.22
85 0.21
86 0.2
87 0.19
88 0.2
89 0.17
90 0.15
91 0.11
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.07
97 0.07
98 0.11
99 0.14
100 0.15
101 0.18
102 0.19
103 0.21
104 0.25
105 0.27
106 0.28
107 0.33
108 0.38
109 0.46
110 0.49
111 0.54
112 0.53
113 0.59
114 0.62
115 0.61
116 0.63
117 0.61
118 0.57
119 0.52
120 0.48
121 0.4
122 0.32
123 0.26
124 0.17
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.07
129 0.07
130 0.12
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.12
145 0.11
146 0.11
147 0.14
148 0.16
149 0.17
150 0.18
151 0.19
152 0.2
153 0.26
154 0.29
155 0.27
156 0.26
157 0.24
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.17
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.11
176 0.16
177 0.22
178 0.26
179 0.28
180 0.33
181 0.41
182 0.48
183 0.53
184 0.56
185 0.53
186 0.57
187 0.6
188 0.56
189 0.53
190 0.51
191 0.43
192 0.4
193 0.41
194 0.34
195 0.32
196 0.31
197 0.27
198 0.27
199 0.28
200 0.28
201 0.3
202 0.3
203 0.27
204 0.32
205 0.35
206 0.33
207 0.38
208 0.34
209 0.29
210 0.29
211 0.29
212 0.24
213 0.18
214 0.16
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.07
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.17
241 0.16
242 0.16
243 0.17
244 0.16
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.16
255 0.22
256 0.27
257 0.35
258 0.41
259 0.46
260 0.55
261 0.64
262 0.68
263 0.73
264 0.77
265 0.8
266 0.81
267 0.79
268 0.74
269 0.69
270 0.61
271 0.56
272 0.48
273 0.38
274 0.31
275 0.28
276 0.23
277 0.19
278 0.17
279 0.11
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.07
291 0.07
292 0.1
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.14
297 0.17
298 0.17
299 0.21
300 0.19
301 0.21
302 0.24
303 0.21
304 0.21
305 0.2
306 0.24
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.19
311 0.19
312 0.18
313 0.19
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.16
318 0.17
319 0.17
320 0.17
321 0.15
322 0.13
323 0.14
324 0.14
325 0.11
326 0.08
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.13
337 0.18
338 0.25
339 0.32
340 0.37
341 0.43
342 0.46
343 0.49
344 0.47
345 0.51
346 0.51
347 0.52
348 0.54
349 0.54
350 0.59
351 0.59
352 0.58
353 0.56
354 0.57
355 0.55
356 0.57
357 0.57
358 0.58
359 0.6
360 0.65
361 0.62
362 0.58
363 0.54
364 0.56
365 0.53
366 0.47
367 0.5
368 0.46
369 0.44
370 0.41
371 0.47
372 0.46
373 0.46
374 0.45
375 0.39
376 0.43
377 0.5
378 0.51
379 0.43
380 0.36
381 0.36
382 0.36
383 0.37
384 0.3
385 0.26
386 0.28
387 0.29
388 0.27
389 0.25
390 0.24
391 0.21
392 0.2
393 0.17
394 0.13
395 0.11
396 0.1
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.12
410 0.13
411 0.16
412 0.21
413 0.24
414 0.28
415 0.32
416 0.33
417 0.31
418 0.35
419 0.37
420 0.36
421 0.42
422 0.48
423 0.52
424 0.59
425 0.64
426 0.68
427 0.73
428 0.78
429 0.78
430 0.78
431 0.77
432 0.79
433 0.84
434 0.78
435 0.78
436 0.77
437 0.7
438 0.62
439 0.56
440 0.46
441 0.37
442 0.34
443 0.29
444 0.2
445 0.18
446 0.18
447 0.18
448 0.18
449 0.17
450 0.17
451 0.21
452 0.22
453 0.28
454 0.35
455 0.4
456 0.43
457 0.47
458 0.5
459 0.49
460 0.49
461 0.42
462 0.39
463 0.41
464 0.4
465 0.36
466 0.33
467 0.33
468 0.33
469 0.36
470 0.36
471 0.35
472 0.38
473 0.44
474 0.44
475 0.42
476 0.43
477 0.41
478 0.38
479 0.33
480 0.29
481 0.25
482 0.28
483 0.25
484 0.23
485 0.25
486 0.26
487 0.24
488 0.27
489 0.31
490 0.36
491 0.39
492 0.44
493 0.51
494 0.6
495 0.7
496 0.75
497 0.77
498 0.79
499 0.83
500 0.83
501 0.82
502 0.81
503 0.75
504 0.76
505 0.74
506 0.7
507 0.71
508 0.71
509 0.73
510 0.75