Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0D2XVD6

Protein Details
Accession A0A0D2XVD6    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-308ESETEKSGNKRKRGRAIKMKNKKPRHEEKEKLMLTNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-156KMAPKIRHREQARERKA
280-301GNKRKRGRAIKMKNKKPRHEEK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR006958  Mak16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG fox:FOXG_07948  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04874  Mak16  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MSSDEIVWQIIGQQFCAFKIKTNKAQTFCRNEYNVTGLCNRQSCPLANSRYATVREDAGKLFLLVKTPERSHLPSKLWQRYKLPNNYSKALSTIDEKLIYWPNFLIHKCKQRLTRLTQVQTRMRRIAAEEERLGEKLVPKMAPKIRHREQARERKAEAAAKLERTIERELVERLRQGAYGDQPLNVSESIWKKVLNAMERDGEGQRDKDMDKGLDENGEEADWSEEEDDNLENQVEYVSDIEESDEELGDLEDWLDSENEDDDEDEDDDDSEESETEKSGNKRKRGRAIKMKNKKPRHEEKEKLMLTNDLTW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.25
4 0.22
5 0.25
6 0.35
7 0.43
8 0.5
9 0.59
10 0.66
11 0.65
12 0.75
13 0.76
14 0.76
15 0.72
16 0.71
17 0.63
18 0.57
19 0.55
20 0.51
21 0.43
22 0.36
23 0.34
24 0.29
25 0.31
26 0.32
27 0.3
28 0.29
29 0.3
30 0.29
31 0.31
32 0.36
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.4
38 0.4
39 0.38
40 0.31
41 0.29
42 0.27
43 0.27
44 0.25
45 0.21
46 0.19
47 0.17
48 0.17
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.19
53 0.22
54 0.23
55 0.26
56 0.3
57 0.34
58 0.37
59 0.42
60 0.41
61 0.44
62 0.53
63 0.59
64 0.6
65 0.61
66 0.62
67 0.65
68 0.71
69 0.73
70 0.71
71 0.69
72 0.68
73 0.66
74 0.61
75 0.51
76 0.44
77 0.35
78 0.28
79 0.24
80 0.21
81 0.2
82 0.18
83 0.18
84 0.19
85 0.25
86 0.24
87 0.22
88 0.19
89 0.19
90 0.23
91 0.24
92 0.28
93 0.27
94 0.36
95 0.39
96 0.45
97 0.49
98 0.54
99 0.61
100 0.61
101 0.65
102 0.64
103 0.66
104 0.65
105 0.65
106 0.64
107 0.62
108 0.59
109 0.52
110 0.44
111 0.38
112 0.35
113 0.37
114 0.33
115 0.31
116 0.27
117 0.26
118 0.27
119 0.26
120 0.25
121 0.17
122 0.15
123 0.12
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.2
128 0.24
129 0.32
130 0.35
131 0.42
132 0.45
133 0.52
134 0.54
135 0.57
136 0.63
137 0.66
138 0.69
139 0.64
140 0.6
141 0.54
142 0.54
143 0.47
144 0.38
145 0.33
146 0.27
147 0.23
148 0.23
149 0.22
150 0.2
151 0.2
152 0.2
153 0.16
154 0.14
155 0.15
156 0.16
157 0.17
158 0.18
159 0.15
160 0.15
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.13
166 0.17
167 0.17
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.13
173 0.11
174 0.11
175 0.13
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.15
180 0.18
181 0.23
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.23
186 0.23
187 0.25
188 0.22
189 0.2
190 0.18
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.15
195 0.16
196 0.18
197 0.16
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.16
202 0.15
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.08
207 0.07
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.14
265 0.2
266 0.3
267 0.38
268 0.47
269 0.56
270 0.66
271 0.75
272 0.8
273 0.84
274 0.86
275 0.89
276 0.91
277 0.92
278 0.94
279 0.93
280 0.93
281 0.93
282 0.92
283 0.92
284 0.91
285 0.91
286 0.89
287 0.88
288 0.88
289 0.81
290 0.73
291 0.64
292 0.57