Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7M8Y8

Protein Details
Accession W7M8Y8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
265-288GPSANDPNRPKRNVKKRTYGDSSFHydrophilic
309-331GEGEGGQKRRKKNPGSTSPYPSAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
318-319RK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.333, cyto 5.5, cyto_mito 4.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG fvr:FVEG_05174  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSFHPQTPQSPSQFSSGTSEPVLSVTTSMTSTATPTTLPTPAHSVTGSAHHDLAMTDDSPHKRKRSVDDSGDREQKKVHTEESKLGIEDLHLDVGKKYLLCQTPHPESLPRVSEDLYDMFNLSGLAAEVAREKPNGEKNALRSSYTGHMKNLGIAGNWKVRVTDKDSNAEKPDFFDILHMPDEDWDNTIVKGQNIKHGLSQASLSALGRAVTMAKGPIGKKDWDTSRLGLQSPGLDSKQTSSARPTAPNTPLNVPGAVGRLKAQGPSANDPNRPKRNVKKRTYGDSSFEGYGEGYPDDDTAADGGYSTGEGEGGQKRRKKNPGSTSPYPSAMRQQSYGPGMVGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.31
4 0.28
5 0.25
6 0.24
7 0.19
8 0.19
9 0.18
10 0.12
11 0.11
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.12
23 0.14
24 0.17
25 0.17
26 0.18
27 0.23
28 0.23
29 0.25
30 0.23
31 0.21
32 0.19
33 0.25
34 0.26
35 0.22
36 0.21
37 0.19
38 0.19
39 0.18
40 0.19
41 0.15
42 0.12
43 0.12
44 0.18
45 0.23
46 0.29
47 0.36
48 0.37
49 0.4
50 0.46
51 0.53
52 0.55
53 0.59
54 0.63
55 0.66
56 0.68
57 0.71
58 0.74
59 0.66
60 0.59
61 0.52
62 0.46
63 0.43
64 0.39
65 0.38
66 0.36
67 0.39
68 0.43
69 0.46
70 0.44
71 0.38
72 0.35
73 0.28
74 0.21
75 0.2
76 0.15
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.09
84 0.1
85 0.15
86 0.2
87 0.21
88 0.27
89 0.33
90 0.37
91 0.4
92 0.4
93 0.36
94 0.33
95 0.37
96 0.33
97 0.28
98 0.24
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.19
103 0.15
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.06
110 0.05
111 0.04
112 0.04
113 0.03
114 0.04
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.09
119 0.09
120 0.14
121 0.21
122 0.23
123 0.25
124 0.26
125 0.29
126 0.38
127 0.38
128 0.35
129 0.28
130 0.28
131 0.32
132 0.34
133 0.31
134 0.23
135 0.25
136 0.24
137 0.25
138 0.23
139 0.17
140 0.12
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.15
145 0.14
146 0.13
147 0.14
148 0.16
149 0.23
150 0.26
151 0.26
152 0.33
153 0.35
154 0.37
155 0.38
156 0.37
157 0.29
158 0.24
159 0.23
160 0.16
161 0.14
162 0.13
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.11
170 0.1
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.11
176 0.11
177 0.1
178 0.15
179 0.15
180 0.2
181 0.22
182 0.23
183 0.21
184 0.23
185 0.22
186 0.18
187 0.18
188 0.12
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.06
202 0.09
203 0.1
204 0.14
205 0.17
206 0.18
207 0.2
208 0.26
209 0.28
210 0.29
211 0.32
212 0.29
213 0.31
214 0.31
215 0.3
216 0.25
217 0.22
218 0.19
219 0.18
220 0.19
221 0.14
222 0.13
223 0.12
224 0.14
225 0.21
226 0.21
227 0.2
228 0.22
229 0.27
230 0.3
231 0.34
232 0.35
233 0.34
234 0.38
235 0.4
236 0.39
237 0.37
238 0.36
239 0.34
240 0.31
241 0.24
242 0.19
243 0.19
244 0.17
245 0.14
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.15
250 0.16
251 0.18
252 0.21
253 0.27
254 0.35
255 0.37
256 0.43
257 0.5
258 0.58
259 0.63
260 0.64
261 0.67
262 0.69
263 0.75
264 0.8
265 0.8
266 0.81
267 0.8
268 0.84
269 0.83
270 0.77
271 0.71
272 0.64
273 0.59
274 0.49
275 0.41
276 0.32
277 0.24
278 0.2
279 0.16
280 0.12
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.05
298 0.09
299 0.16
300 0.24
301 0.31
302 0.37
303 0.45
304 0.55
305 0.65
306 0.7
307 0.74
308 0.77
309 0.81
310 0.84
311 0.85
312 0.83
313 0.78
314 0.74
315 0.66
316 0.57
317 0.56
318 0.54
319 0.49
320 0.42
321 0.41
322 0.42
323 0.43
324 0.41