Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S7T8

Protein Details
Accession E3S7T8    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22ATDKKVSKKAAGNKKQAKASAHydrophilic
95-120ESEAETKPKKTKKASPKKAPVKEDSSHydrophilic
147-169ETAPAKAKKGTKKPKKANSASSSHydrophilic
355-374ADAPKSKRSHVENRFQRIKPHydrophilic
402-424VTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
101-114KPKKTKKASPKKAP
151-163AKAKKGTKKPKKA
222-231KKVKKTKGKK
271-277KAKKGGK
406-418KGFTKEKNKGKRG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG pte:PTT_18923  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MATDKKVSKKAAGNKKQAKASAVANVQVPLELVKTFLEEKGEKGAAGKLQEFTQWESAKNTPDAPEPMDVDEESASSSDSSSDSSSDSSSDSSSESEAETKPKKTKKASPKKAPVKEDSSSSSSSSDSSSDSSSDSDSSSDSDSDEETAPAKAKKGTKKPKKANSASSSSSSESSDSDSSSDDSSDEEPANIPLPDSDSSDASSDSDSDSSSDSSSESEAEKKVKKTKGKKTASVASSSASSSSDSSDSSDSSDDSDSDSESDAALAKATKAKKGGKKEATSSSESTSSDSSSDSSSDSSSDSDSDSDSDSDSGKATKSTALESKTSASDSSMTLPAASPQPSDNKRKFSGSPSADAPKSKRSHVENRFQRIKPDVQVDPKLASNAYVSYDYADRAHAKLIVTKGKGFTKEKNKGKRGSYRGGMIDTSGGKGIKFED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.83
3 0.82
4 0.76
5 0.69
6 0.62
7 0.55
8 0.53
9 0.46
10 0.41
11 0.35
12 0.32
13 0.29
14 0.25
15 0.21
16 0.14
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.08
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.19
25 0.18
26 0.2
27 0.26
28 0.26
29 0.23
30 0.23
31 0.26
32 0.23
33 0.26
34 0.26
35 0.21
36 0.21
37 0.24
38 0.25
39 0.25
40 0.3
41 0.28
42 0.28
43 0.31
44 0.33
45 0.35
46 0.34
47 0.32
48 0.27
49 0.3
50 0.31
51 0.29
52 0.29
53 0.26
54 0.26
55 0.25
56 0.23
57 0.19
58 0.17
59 0.14
60 0.11
61 0.1
62 0.09
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.07
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.12
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.11
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.13
84 0.13
85 0.2
86 0.24
87 0.29
88 0.36
89 0.42
90 0.5
91 0.55
92 0.64
93 0.68
94 0.75
95 0.81
96 0.83
97 0.88
98 0.9
99 0.91
100 0.87
101 0.83
102 0.78
103 0.69
104 0.61
105 0.55
106 0.48
107 0.41
108 0.36
109 0.3
110 0.23
111 0.22
112 0.19
113 0.15
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.16
140 0.23
141 0.31
142 0.41
143 0.52
144 0.6
145 0.71
146 0.79
147 0.84
148 0.88
149 0.86
150 0.85
151 0.8
152 0.75
153 0.67
154 0.6
155 0.53
156 0.44
157 0.38
158 0.28
159 0.23
160 0.17
161 0.17
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.08
180 0.06
181 0.09
182 0.09
183 0.11
184 0.11
185 0.1
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.09
190 0.09
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.06
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.1
206 0.11
207 0.15
208 0.19
209 0.22
210 0.29
211 0.35
212 0.43
213 0.51
214 0.6
215 0.66
216 0.69
217 0.71
218 0.7
219 0.71
220 0.64
221 0.57
222 0.47
223 0.37
224 0.31
225 0.25
226 0.19
227 0.12
228 0.11
229 0.08
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.1
240 0.1
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.08
246 0.09
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.11
256 0.12
257 0.14
258 0.2
259 0.27
260 0.34
261 0.43
262 0.52
263 0.56
264 0.59
265 0.61
266 0.64
267 0.61
268 0.58
269 0.51
270 0.43
271 0.37
272 0.33
273 0.3
274 0.22
275 0.18
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.12
305 0.12
306 0.16
307 0.2
308 0.21
309 0.22
310 0.23
311 0.25
312 0.23
313 0.23
314 0.19
315 0.16
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.15
320 0.14
321 0.13
322 0.13
323 0.14
324 0.16
325 0.16
326 0.14
327 0.14
328 0.24
329 0.3
330 0.4
331 0.43
332 0.47
333 0.49
334 0.53
335 0.54
336 0.51
337 0.55
338 0.49
339 0.47
340 0.46
341 0.49
342 0.46
343 0.48
344 0.45
345 0.44
346 0.43
347 0.43
348 0.45
349 0.47
350 0.55
351 0.6
352 0.67
353 0.68
354 0.75
355 0.8
356 0.74
357 0.72
358 0.67
359 0.63
360 0.58
361 0.55
362 0.52
363 0.5
364 0.54
365 0.51
366 0.47
367 0.43
368 0.38
369 0.32
370 0.26
371 0.2
372 0.16
373 0.17
374 0.16
375 0.14
376 0.15
377 0.16
378 0.16
379 0.16
380 0.18
381 0.17
382 0.17
383 0.19
384 0.19
385 0.2
386 0.24
387 0.29
388 0.34
389 0.34
390 0.37
391 0.4
392 0.43
393 0.5
394 0.49
395 0.53
396 0.56
397 0.64
398 0.7
399 0.76
400 0.79
401 0.79
402 0.84
403 0.85
404 0.82
405 0.81
406 0.77
407 0.73
408 0.68
409 0.63
410 0.54
411 0.44
412 0.4
413 0.31
414 0.27
415 0.23
416 0.2
417 0.16