Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3S321

Protein Details
Accession E3S321    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
181-206RAPVKSEPLKTKRRKLPWPSEQKTQPHydrophilic
375-397EDLVKKIRRNQKAKQRWMRTKVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-194KRR
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR010285  DNA_helicase_pif1-like  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0140445  C:chromosome, telomeric repeat region  
GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0033553  C:rDNA heterochromatin  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0043139  F:5'-3' DNA helicase activity  
GO:0033678  F:5'-3' DNA/RNA helicase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0061995  F:ATP-dependent protein-DNA complex displacement activity  
GO:1990814  F:DNA/DNA annealing activity  
GO:0070336  F:flap-structured DNA binding  
GO:0051880  F:G-quadruplex DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0017116  F:single-stranded DNA helicase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:1902983  P:DNA strand elongation involved in mitotic DNA replication  
GO:0044806  P:G-quadruplex DNA unwinding  
GO:0043504  P:mitochondrial DNA repair  
GO:1990426  P:mitotic recombination-dependent replication fork processing  
GO:1903469  P:removal of RNA primer involved in mitotic DNA replication  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG pte:PTT_16808  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05970  PIF1  
CDD cd18037  DEXSc_Pif1_like  
cd18809  SF1_C_RecD  
Amino Acid Sequences MSMFKQAVQNYDSVASTSPPNNAFKQSSIGNAFKARPLGNGMKQSDAGPQRSLGAGTQGIKRTSNGSAKLLGSEKDVFDYPTLNIAGMEKENELPAAFHANNASSLASALFDEDDFDSDVDLDVEDPATKGTVTYPTLPSASSVGSRDSGYNSRTQTADIKPETKSSQPVPWSSSPPEHFRAPVKSEPLKTKRRKLPWPSEQKTQPIQEEDEAEVERQAARPSKRPSTEADKVVSTPKPKSEYLWNTTASAIKQQQKNLRETKAQAKINQGTQDDVKEATMKKKMNTVHKIFLSEEQQNVLNLVTEYKKSVFFTGSAGTGKSVLLREIIAALRRKYVREPDRVAVTASTGLAACNIGGVTLHSFSGIGLGKEPAEDLVKKIRRNQKAKQRWMRTKVLIMDEVSMVDGDLFDKLEQIARTIRNNGRPFGGIQLVITGDFFQLPPVPDHGRQAKFAFDAGTWTTSIEHTIGLHHVFRQKDPVFAGMLNEMREGRLTPESIARFRKLERPLPTTDESVEATELFPTRQEVDRANSTRMLQLHGSTFTFEARDGGTIQNKEMRDKLLQSCMVPELIHLKKGAQVMLVKNMDDTLVNGSLGKVTGFMTEQMFSIYKEDEEGFLETGPSEAALKTEMAKTSLGVTNNQVYPVVRFAIADGTTRDLLCKREDWKIELPNGEVQASRSQIPLILAWALSIHKAQGQTLERVRVDLGRVFEKGQAYVALSRATSMAGLQILRFDPRKVLAHEKVRLFYSSLSTAEQIEGKAKSKTILGKMQAVKVKSGSDR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.16
3 0.18
4 0.2
5 0.23
6 0.25
7 0.3
8 0.32
9 0.37
10 0.38
11 0.35
12 0.38
13 0.34
14 0.37
15 0.39
16 0.38
17 0.35
18 0.37
19 0.37
20 0.36
21 0.4
22 0.33
23 0.29
24 0.34
25 0.38
26 0.4
27 0.47
28 0.46
29 0.44
30 0.44
31 0.43
32 0.44
33 0.43
34 0.39
35 0.32
36 0.31
37 0.29
38 0.29
39 0.29
40 0.21
41 0.18
42 0.19
43 0.21
44 0.26
45 0.29
46 0.3
47 0.31
48 0.31
49 0.31
50 0.34
51 0.38
52 0.36
53 0.34
54 0.37
55 0.36
56 0.39
57 0.38
58 0.31
59 0.29
60 0.28
61 0.25
62 0.24
63 0.24
64 0.21
65 0.19
66 0.2
67 0.16
68 0.18
69 0.18
70 0.15
71 0.14
72 0.14
73 0.16
74 0.15
75 0.16
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.14
80 0.13
81 0.11
82 0.11
83 0.17
84 0.15
85 0.15
86 0.17
87 0.17
88 0.18
89 0.18
90 0.17
91 0.1
92 0.1
93 0.09
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.06
99 0.08
100 0.08
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.08
119 0.12
120 0.14
121 0.19
122 0.2
123 0.22
124 0.23
125 0.22
126 0.22
127 0.18
128 0.17
129 0.15
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.19
136 0.22
137 0.21
138 0.26
139 0.26
140 0.27
141 0.27
142 0.28
143 0.3
144 0.29
145 0.36
146 0.34
147 0.35
148 0.34
149 0.38
150 0.39
151 0.36
152 0.37
153 0.32
154 0.35
155 0.36
156 0.38
157 0.4
158 0.41
159 0.43
160 0.42
161 0.45
162 0.43
163 0.44
164 0.45
165 0.4
166 0.4
167 0.4
168 0.42
169 0.4
170 0.42
171 0.43
172 0.45
173 0.49
174 0.56
175 0.6
176 0.64
177 0.67
178 0.73
179 0.75
180 0.78
181 0.83
182 0.84
183 0.86
184 0.86
185 0.88
186 0.83
187 0.82
188 0.78
189 0.75
190 0.7
191 0.64
192 0.57
193 0.49
194 0.46
195 0.39
196 0.36
197 0.3
198 0.26
199 0.22
200 0.18
201 0.15
202 0.13
203 0.12
204 0.11
205 0.13
206 0.18
207 0.2
208 0.29
209 0.35
210 0.43
211 0.45
212 0.46
213 0.49
214 0.51
215 0.55
216 0.51
217 0.47
218 0.39
219 0.37
220 0.4
221 0.38
222 0.33
223 0.29
224 0.3
225 0.32
226 0.31
227 0.33
228 0.38
229 0.42
230 0.44
231 0.45
232 0.41
233 0.38
234 0.38
235 0.38
236 0.28
237 0.26
238 0.28
239 0.3
240 0.33
241 0.38
242 0.44
243 0.47
244 0.55
245 0.55
246 0.53
247 0.51
248 0.51
249 0.54
250 0.56
251 0.54
252 0.5
253 0.52
254 0.51
255 0.5
256 0.51
257 0.42
258 0.35
259 0.32
260 0.3
261 0.23
262 0.19
263 0.16
264 0.15
265 0.16
266 0.19
267 0.24
268 0.25
269 0.25
270 0.3
271 0.36
272 0.42
273 0.5
274 0.5
275 0.5
276 0.49
277 0.5
278 0.46
279 0.44
280 0.38
281 0.31
282 0.26
283 0.21
284 0.2
285 0.18
286 0.17
287 0.13
288 0.1
289 0.07
290 0.09
291 0.09
292 0.08
293 0.1
294 0.11
295 0.13
296 0.13
297 0.14
298 0.13
299 0.12
300 0.14
301 0.13
302 0.14
303 0.13
304 0.12
305 0.11
306 0.1
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.09
316 0.12
317 0.15
318 0.15
319 0.2
320 0.21
321 0.22
322 0.24
323 0.33
324 0.36
325 0.4
326 0.44
327 0.42
328 0.45
329 0.44
330 0.41
331 0.31
332 0.24
333 0.17
334 0.13
335 0.1
336 0.06
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.03
345 0.03
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.08
353 0.08
354 0.07
355 0.07
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.06
361 0.07
362 0.07
363 0.08
364 0.17
365 0.21
366 0.23
367 0.31
368 0.39
369 0.47
370 0.54
371 0.61
372 0.63
373 0.69
374 0.78
375 0.8
376 0.82
377 0.82
378 0.81
379 0.79
380 0.7
381 0.64
382 0.57
383 0.49
384 0.4
385 0.31
386 0.25
387 0.19
388 0.17
389 0.12
390 0.09
391 0.06
392 0.04
393 0.04
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.04
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.11
404 0.13
405 0.15
406 0.22
407 0.25
408 0.32
409 0.34
410 0.33
411 0.31
412 0.3
413 0.29
414 0.25
415 0.22
416 0.13
417 0.11
418 0.11
419 0.09
420 0.08
421 0.08
422 0.06
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.11
431 0.14
432 0.15
433 0.2
434 0.27
435 0.27
436 0.29
437 0.29
438 0.27
439 0.24
440 0.24
441 0.2
442 0.12
443 0.13
444 0.11
445 0.12
446 0.1
447 0.1
448 0.1
449 0.09
450 0.1
451 0.08
452 0.07
453 0.06
454 0.07
455 0.08
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.15
460 0.16
461 0.16
462 0.24
463 0.23
464 0.24
465 0.25
466 0.24
467 0.2
468 0.2
469 0.2
470 0.14
471 0.15
472 0.13
473 0.13
474 0.11
475 0.1
476 0.11
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.16
483 0.19
484 0.23
485 0.26
486 0.25
487 0.26
488 0.27
489 0.34
490 0.35
491 0.4
492 0.41
493 0.43
494 0.44
495 0.48
496 0.48
497 0.42
498 0.37
499 0.31
500 0.26
501 0.21
502 0.18
503 0.13
504 0.11
505 0.1
506 0.1
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.1
511 0.12
512 0.14
513 0.16
514 0.2
515 0.28
516 0.31
517 0.32
518 0.31
519 0.3
520 0.32
521 0.3
522 0.28
523 0.2
524 0.19
525 0.19
526 0.19
527 0.18
528 0.15
529 0.15
530 0.13
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.08
535 0.09
536 0.09
537 0.12
538 0.17
539 0.17
540 0.18
541 0.23
542 0.23
543 0.24
544 0.25
545 0.25
546 0.22
547 0.26
548 0.29
549 0.3
550 0.31
551 0.29
552 0.29
553 0.27
554 0.25
555 0.2
556 0.17
557 0.18
558 0.18
559 0.19
560 0.18
561 0.17
562 0.2
563 0.22
564 0.22
565 0.17
566 0.2
567 0.2
568 0.28
569 0.29
570 0.25
571 0.23
572 0.22
573 0.2
574 0.15
575 0.14
576 0.1
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.1
583 0.09
584 0.06
585 0.06
586 0.07
587 0.08
588 0.09
589 0.1
590 0.1
591 0.11
592 0.12
593 0.12
594 0.12
595 0.13
596 0.12
597 0.11
598 0.12
599 0.12
600 0.11
601 0.12
602 0.14
603 0.12
604 0.11
605 0.12
606 0.1
607 0.09
608 0.08
609 0.07
610 0.06
611 0.05
612 0.06
613 0.07
614 0.07
615 0.09
616 0.12
617 0.13
618 0.13
619 0.14
620 0.14
621 0.17
622 0.2
623 0.2
624 0.19
625 0.21
626 0.25
627 0.25
628 0.26
629 0.22
630 0.19
631 0.19
632 0.2
633 0.18
634 0.13
635 0.12
636 0.12
637 0.16
638 0.16
639 0.16
640 0.15
641 0.17
642 0.18
643 0.18
644 0.2
645 0.18
646 0.19
647 0.21
648 0.24
649 0.25
650 0.32
651 0.35
652 0.39
653 0.45
654 0.49
655 0.51
656 0.48
657 0.47
658 0.43
659 0.42
660 0.36
661 0.29
662 0.25
663 0.24
664 0.24
665 0.23
666 0.19
667 0.17
668 0.18
669 0.19
670 0.17
671 0.14
672 0.12
673 0.11
674 0.11
675 0.12
676 0.1
677 0.1
678 0.1
679 0.09
680 0.11
681 0.12
682 0.13
683 0.2
684 0.23
685 0.29
686 0.33
687 0.4
688 0.37
689 0.37
690 0.38
691 0.32
692 0.32
693 0.28
694 0.27
695 0.24
696 0.25
697 0.25
698 0.28
699 0.27
700 0.25
701 0.22
702 0.2
703 0.19
704 0.2
705 0.2
706 0.18
707 0.16
708 0.16
709 0.15
710 0.14
711 0.11
712 0.09
713 0.09
714 0.1
715 0.11
716 0.1
717 0.13
718 0.14
719 0.19
720 0.21
721 0.2
722 0.22
723 0.27
724 0.32
725 0.35
726 0.43
727 0.47
728 0.55
729 0.61
730 0.62
731 0.6
732 0.57
733 0.53
734 0.45
735 0.38
736 0.34
737 0.3
738 0.27
739 0.25
740 0.24
741 0.23
742 0.23
743 0.23
744 0.19
745 0.21
746 0.22
747 0.23
748 0.24
749 0.24
750 0.24
751 0.28
752 0.34
753 0.36
754 0.42
755 0.43
756 0.5
757 0.54
758 0.59
759 0.6
760 0.54
761 0.5
762 0.43