Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A6Q4

Protein Details
Accession Q5A6Q4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-172KTIFSQQKYLKRKQQKFLRRFTVDHydrophilic
289-315DEEVKKIKNKSQYKKRRDRALQINEVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
302-304KKR
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14.833, mito_nucl 9.665, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016429  F:tRNA (adenine-N1-)-methyltransferase activity  
KEGG cal:CAALFM_CR04160CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSDFKKSETTIQSGQHVLIRLPSEGLKIVHLQDTGIIGLGKFGSFEVSNILGYPLGTSFEIIEDHKVKPIKSISTLDLTDSDETVQRQELTKMFSDSAENNQNIINIGSKIQKLSKDDIDELKKSGASSNVGQMIIEKMIAGHEGFDKKTIFSQQKYLKRKQQKFLRRFTVDYLGGSELLQYYIEKDLNRVLDLSVETLGLMLTYSNVRPGGKYLIIDETGGVLTYAMMERMNCEGTIVSIHENEHANLIALRYSDYGNELETKTVKSVNWLQFIDPQSERIDWTDLPDEEVKKIKNKSQYKKRRDRALQINEVIQLVEEGNFDAFISVSTLNMSEVLEYVLPKIGGSRPIVVYNQFKESLLEVQQALSGDKRVLAPSIYETRVRPYQTIPGRMHPVMTNRGGGGYILWGTRVIPHDAITAVGKGFAKRKRVETPSKTDTGTVEVQNDQENSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.37
3 0.33
4 0.27
5 0.26
6 0.24
7 0.2
8 0.21
9 0.2
10 0.19
11 0.21
12 0.21
13 0.19
14 0.2
15 0.22
16 0.23
17 0.22
18 0.2
19 0.18
20 0.19
21 0.16
22 0.14
23 0.12
24 0.08
25 0.1
26 0.1
27 0.08
28 0.07
29 0.07
30 0.09
31 0.09
32 0.1
33 0.12
34 0.12
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.11
39 0.1
40 0.11
41 0.08
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.08
46 0.09
47 0.11
48 0.11
49 0.17
50 0.18
51 0.18
52 0.24
53 0.27
54 0.26
55 0.31
56 0.35
57 0.33
58 0.36
59 0.39
60 0.37
61 0.39
62 0.39
63 0.34
64 0.3
65 0.28
66 0.24
67 0.2
68 0.18
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.15
74 0.15
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.23
79 0.24
80 0.23
81 0.22
82 0.24
83 0.22
84 0.26
85 0.3
86 0.28
87 0.26
88 0.26
89 0.25
90 0.23
91 0.22
92 0.17
93 0.1
94 0.12
95 0.15
96 0.16
97 0.18
98 0.2
99 0.24
100 0.26
101 0.31
102 0.33
103 0.33
104 0.36
105 0.41
106 0.43
107 0.41
108 0.38
109 0.34
110 0.3
111 0.26
112 0.25
113 0.2
114 0.18
115 0.18
116 0.2
117 0.22
118 0.21
119 0.2
120 0.19
121 0.17
122 0.14
123 0.13
124 0.08
125 0.05
126 0.06
127 0.07
128 0.06
129 0.06
130 0.09
131 0.11
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.14
136 0.17
137 0.24
138 0.25
139 0.25
140 0.34
141 0.4
142 0.49
143 0.57
144 0.63
145 0.65
146 0.71
147 0.78
148 0.78
149 0.8
150 0.81
151 0.82
152 0.83
153 0.83
154 0.76
155 0.69
156 0.63
157 0.59
158 0.49
159 0.41
160 0.33
161 0.24
162 0.2
163 0.18
164 0.15
165 0.08
166 0.08
167 0.07
168 0.05
169 0.06
170 0.08
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.08
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.04
188 0.04
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.09
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.11
206 0.09
207 0.08
208 0.07
209 0.06
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.07
228 0.07
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.11
252 0.13
253 0.12
254 0.14
255 0.22
256 0.26
257 0.3
258 0.3
259 0.3
260 0.34
261 0.35
262 0.35
263 0.27
264 0.24
265 0.21
266 0.21
267 0.2
268 0.16
269 0.17
270 0.13
271 0.16
272 0.18
273 0.16
274 0.18
275 0.21
276 0.2
277 0.2
278 0.24
279 0.23
280 0.25
281 0.29
282 0.31
283 0.38
284 0.47
285 0.56
286 0.63
287 0.73
288 0.77
289 0.85
290 0.89
291 0.89
292 0.87
293 0.86
294 0.86
295 0.84
296 0.81
297 0.72
298 0.65
299 0.55
300 0.47
301 0.37
302 0.26
303 0.17
304 0.09
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.1
332 0.12
333 0.15
334 0.17
335 0.2
336 0.2
337 0.23
338 0.24
339 0.27
340 0.3
341 0.29
342 0.31
343 0.28
344 0.27
345 0.25
346 0.26
347 0.25
348 0.21
349 0.21
350 0.17
351 0.17
352 0.18
353 0.17
354 0.17
355 0.13
356 0.13
357 0.11
358 0.12
359 0.13
360 0.12
361 0.13
362 0.13
363 0.13
364 0.17
365 0.23
366 0.24
367 0.26
368 0.26
369 0.31
370 0.36
371 0.37
372 0.33
373 0.3
374 0.37
375 0.42
376 0.5
377 0.47
378 0.48
379 0.53
380 0.51
381 0.5
382 0.45
383 0.43
384 0.41
385 0.4
386 0.35
387 0.28
388 0.28
389 0.26
390 0.22
391 0.17
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.1
398 0.14
399 0.17
400 0.18
401 0.17
402 0.18
403 0.2
404 0.2
405 0.21
406 0.18
407 0.16
408 0.13
409 0.15
410 0.16
411 0.18
412 0.25
413 0.3
414 0.37
415 0.41
416 0.48
417 0.55
418 0.63
419 0.71
420 0.72
421 0.76
422 0.75
423 0.73
424 0.67
425 0.59
426 0.51
427 0.46
428 0.42
429 0.35
430 0.31
431 0.28
432 0.28
433 0.31