FuNGI

W7MR92

Protein Details

Accession

W7MR92

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
172-191	FSIYKKVPSNKKRTDARQGT	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
241-296	EKKASKAKESSSSKNSKHGQDSRSTKGKNSSKDEDSGKKKGKESKAEKGEKAPKET
418-450	QQANRRTRGGKNAEKSNQKEKGKENSKEKEKVK
627-644	EKGSGRGRRGRGGGNKAK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
KEGG	fvr:FVEG_09542 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSAQTPQVLSRRANGGPQTSSNQTSEPTKGKGPQENSSHGKARGRGSNARSTEAHKHANEDETPKPTKTKAHNEGEKLVIRRLPPGMTETEFVSILGSEWELGKGKVDWFSFVEGKISTDPSKPSRPGRAHVHVMKKDDILPLSNAVRTAVWEDAKASFNSPSLIGPPSVEFSIYKKVPSNKKRTDARQGTIDQDPEFMAFLEELANPAPPKETVEGEEGDDLGKAEAKVTTTPLIEYLKEKKASKAKESSSSKNSKHGQDSRSTKGKNSSKDEDSGKKKGKESKAEKGEKAPKETVKILTKKATSEPNAEASKTNAKSQSHDSSAQETAPKSRRAGILAAARILQRDLGLSPGSAHRKARQDAAKADADAKTPEKENTSAAETKASASESPSTPAKSADAEAPEPKGRGAANANKQQQANRRTRGGKNAEKSNQKEKGKENSKEKEKVKESTSSQPAPNPPIMLLKKKATDAESNPPGKPANAATQAPASQGGRSKAENAVGGSKGGPNKGSNAQKKAPTVSPDATRGFVKHANPSQGVTEALLKQTLSTFGTITFVEIDKRKGFAYVDFAEHEGLVKAVTASPITVAQGTVQVLERKDKKPANTNANAATTAPAPAPVAGSAAPEKGSGRGRRGRGGGNKAKDSGPNNQGTAPHSPAPANAGG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.42
3	0.41
4	0.43
5	0.44
6	0.43
7	0.45
8	0.4
9	0.36
10	0.33
11	0.33
12	0.36
13	0.35
14	0.34
15	0.36
16	0.42
17	0.48
18	0.54
19	0.55
20	0.57
21	0.59
22	0.64
23	0.64
24	0.63
25	0.62
26	0.57
27	0.58
28	0.55
29	0.55
30	0.54
31	0.56
32	0.58
33	0.58
34	0.62
35	0.59
36	0.58
37	0.53
38	0.51
39	0.53
40	0.52
41	0.54
42	0.45
43	0.47
44	0.46
45	0.49
46	0.48
47	0.44
48	0.42
49	0.4
50	0.44
51	0.41
52	0.41
53	0.39
54	0.43
55	0.48
56	0.54
57	0.57
58	0.64
59	0.7
60	0.71
61	0.72
62	0.7
63	0.66
64	0.58
65	0.52
66	0.45
67	0.38
68	0.37
69	0.35
70	0.3
71	0.25
72	0.26
73	0.27
74	0.26
75	0.26
76	0.23
77	0.22
78	0.21
79	0.19
80	0.16
81	0.12
82	0.1
83	0.09
84	0.08
85	0.06
86	0.07
87	0.09
88	0.1
89	0.1
90	0.11
91	0.12
92	0.14
93	0.19
94	0.19
95	0.2
96	0.2
97	0.25
98	0.25
99	0.23
100	0.24
101	0.19
102	0.2
103	0.2
104	0.22
105	0.19
106	0.21
107	0.26
108	0.29
109	0.37
110	0.4
111	0.45
112	0.52
113	0.54
114	0.58
115	0.62
116	0.64
117	0.65
118	0.67
119	0.7
120	0.65
121	0.65
122	0.6
123	0.52
124	0.48
125	0.42
126	0.36
127	0.28
128	0.24
129	0.24
130	0.23
131	0.22
132	0.2
133	0.17
134	0.15
135	0.14
136	0.15
137	0.15
138	0.14
139	0.13
140	0.15
141	0.17
142	0.19
143	0.19
144	0.18
145	0.15
146	0.15
147	0.16
148	0.15
149	0.13
150	0.13
151	0.14
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.13
156	0.13
157	0.13
158	0.11
159	0.13
160	0.21
161	0.21
162	0.22
163	0.26
164	0.34
165	0.44
166	0.53
167	0.61
168	0.61
169	0.69
170	0.76
171	0.78
172	0.81
173	0.78
174	0.72
175	0.69
176	0.62
177	0.57
178	0.52
179	0.46
180	0.35
181	0.28
182	0.24
183	0.17
184	0.15
185	0.11
186	0.08
187	0.06
188	0.06
189	0.07
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.08
194	0.07
195	0.08
196	0.09
197	0.08
198	0.1
199	0.12
200	0.13
201	0.14
202	0.17
203	0.17
204	0.17
205	0.17
206	0.14
207	0.13
208	0.11
209	0.09
210	0.06
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.07
215	0.08
216	0.09
217	0.1
218	0.12
219	0.11
220	0.11
221	0.13
222	0.14
223	0.13
224	0.16
225	0.21
226	0.25
227	0.29
228	0.3
229	0.34
230	0.41
231	0.44
232	0.48
233	0.5
234	0.48
235	0.53
236	0.58
237	0.58
238	0.59
239	0.63
240	0.57
241	0.58
242	0.59
243	0.54
244	0.57
245	0.57
246	0.52
247	0.52
248	0.56
249	0.55
250	0.58
251	0.54
252	0.48
253	0.5
254	0.53
255	0.52
256	0.53
257	0.53
258	0.47
259	0.51
260	0.53
261	0.52
262	0.52
263	0.53
264	0.53
265	0.51
266	0.53
267	0.57
268	0.59
269	0.61
270	0.62
271	0.64
272	0.67
273	0.69
274	0.65
275	0.65
276	0.67
277	0.6
278	0.58
279	0.53
280	0.44
281	0.42
282	0.43
283	0.4
284	0.4
285	0.4
286	0.38
287	0.38
288	0.37
289	0.35
290	0.36
291	0.37
292	0.31
293	0.32
294	0.3
295	0.31
296	0.31
297	0.3
298	0.27
299	0.23
300	0.28
301	0.25
302	0.26
303	0.25
304	0.25
305	0.27
306	0.32
307	0.34
308	0.3
309	0.31
310	0.29
311	0.28
312	0.28
313	0.26
314	0.23
315	0.18
316	0.21
317	0.23
318	0.24
319	0.21
320	0.24
321	0.24
322	0.24
323	0.24
324	0.23
325	0.23
326	0.21
327	0.21
328	0.19
329	0.18
330	0.16
331	0.15
332	0.11
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.11
341	0.15
342	0.16
343	0.18
344	0.22
345	0.28
346	0.29
347	0.35
348	0.36
349	0.37
350	0.37
351	0.4
352	0.37
353	0.31
354	0.32
355	0.25
356	0.21
357	0.18
358	0.18
359	0.14
360	0.14
361	0.15
362	0.15
363	0.15
364	0.16
365	0.16
366	0.18
367	0.19
368	0.18
369	0.18
370	0.16
371	0.16
372	0.15
373	0.14
374	0.1
375	0.1
376	0.12
377	0.11
378	0.14
379	0.15
380	0.15
381	0.15
382	0.16
383	0.15
384	0.13
385	0.13
386	0.14
387	0.14
388	0.15
389	0.16
390	0.18
391	0.19
392	0.18
393	0.17
394	0.16
395	0.13
396	0.14
397	0.18
398	0.24
399	0.3
400	0.38
401	0.42
402	0.44
403	0.45
404	0.47
405	0.5
406	0.51
407	0.51
408	0.48
409	0.51
410	0.54
411	0.57
412	0.62
413	0.62
414	0.61
415	0.59
416	0.64
417	0.64
418	0.66
419	0.68
420	0.68
421	0.68
422	0.63
423	0.62
424	0.59
425	0.63
426	0.64
427	0.67
428	0.67
429	0.68
430	0.73
431	0.76
432	0.73
433	0.72
434	0.67
435	0.64
436	0.58
437	0.55
438	0.51
439	0.51
440	0.55
441	0.49
442	0.45
443	0.45
444	0.46
445	0.43
446	0.4
447	0.31
448	0.25
449	0.29
450	0.31
451	0.32
452	0.33
453	0.33
454	0.34
455	0.35
456	0.37
457	0.32
458	0.36
459	0.35
460	0.4
461	0.44
462	0.45
463	0.43
464	0.43
465	0.4
466	0.33
467	0.3
468	0.23
469	0.22
470	0.24
471	0.25
472	0.24
473	0.26
474	0.26
475	0.25
476	0.24
477	0.18
478	0.15
479	0.19
480	0.2
481	0.2
482	0.21
483	0.22
484	0.22
485	0.24
486	0.23
487	0.21
488	0.21
489	0.19
490	0.19
491	0.17
492	0.18
493	0.18
494	0.18
495	0.18
496	0.16
497	0.2
498	0.27
499	0.36
500	0.4
501	0.45
502	0.5
503	0.53
504	0.55
505	0.56
506	0.52
507	0.47
508	0.45
509	0.43
510	0.41
511	0.41
512	0.39
513	0.36
514	0.33
515	0.3
516	0.28
517	0.29
518	0.28
519	0.32
520	0.35
521	0.39
522	0.39
523	0.39
524	0.36
525	0.32
526	0.3
527	0.23
528	0.22
529	0.17
530	0.17
531	0.17
532	0.15
533	0.14
534	0.14
535	0.15
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.1
540	0.12
541	0.12
542	0.12
543	0.11
544	0.11
545	0.15
546	0.17
547	0.21
548	0.21
549	0.22
550	0.22
551	0.23
552	0.23
553	0.21
554	0.26
555	0.24
556	0.25
557	0.25
558	0.25
559	0.24
560	0.22
561	0.2
562	0.13
563	0.11
564	0.08
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.09
573	0.1
574	0.1
575	0.09
576	0.09
577	0.11
578	0.12
579	0.12
580	0.15
581	0.17
582	0.19
583	0.28
584	0.34
585	0.34
586	0.43
587	0.47
588	0.51
589	0.57
590	0.65
591	0.67
592	0.66
593	0.69
594	0.64
595	0.61
596	0.55
597	0.45
598	0.37
599	0.27
600	0.22
601	0.17
602	0.13
603	0.11
604	0.11
605	0.12
606	0.1
607	0.11
608	0.1
609	0.13
610	0.13
611	0.14
612	0.14
613	0.14
614	0.15
615	0.19
616	0.27
617	0.3
618	0.37
619	0.45
620	0.48
621	0.55
622	0.58
623	0.62
624	0.63
625	0.68
626	0.69
627	0.69
628	0.69
629	0.64
630	0.63
631	0.6
632	0.55
633	0.54
634	0.52
635	0.49
636	0.46
637	0.46
638	0.46
639	0.43
640	0.45
641	0.41
642	0.36
643	0.33
644	0.32
645	0.3

W7MR92

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer