Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

W7M228

Protein Details
Accession W7M228    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-97EKTEKEEKKDDKPEKPKRKSKDTTSTEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-41KGGRGAKRRK
75-91KEEKKDDKPEKPKRKSK
269-278AKAKAKKRKA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0001671  F:ATPase activator activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0034462  P:small-subunit processome assembly  
KEGG fvr:FVEG_06351  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MAPETKNDFLDTADSDEEDDVGYNSEDDDMRKGGRGAKRRKLDSDDEDNLGSDIERDASDDEDEPTEKDAEKTEKEEKKDDKPEKPKRKSKDTTSTELPDVTRTLTKKNLVASEAAVKKSGVVYLSRIPPFMKPAKLRSLLEPYGTINRIFLTPEDPASHARRVRAGGNKKKSYTEGWVEFTKKKDAKAVCDLLNARTIGGKKGSYYHDDLWNLLYLKGFKWHNLTEQIAAENAERASRMRAEISKSTKENKEFVRNVEKAKMLDGMEAKAKAKKRKADGEGEGEGAGEDSVRQVKRSFKQVPLAKKKTEVEDQPAEVTRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.16
4 0.15
5 0.13
6 0.11
7 0.08
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.08
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.14
16 0.14
17 0.15
18 0.17
19 0.18
20 0.24
21 0.31
22 0.4
23 0.47
24 0.55
25 0.63
26 0.67
27 0.72
28 0.72
29 0.73
30 0.71
31 0.7
32 0.64
33 0.57
34 0.51
35 0.45
36 0.38
37 0.29
38 0.21
39 0.12
40 0.09
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.14
51 0.14
52 0.15
53 0.15
54 0.14
55 0.14
56 0.17
57 0.2
58 0.22
59 0.27
60 0.35
61 0.39
62 0.43
63 0.5
64 0.51
65 0.56
66 0.64
67 0.67
68 0.67
69 0.73
70 0.8
71 0.83
72 0.88
73 0.87
74 0.85
75 0.88
76 0.86
77 0.85
78 0.85
79 0.8
80 0.76
81 0.73
82 0.68
83 0.58
84 0.52
85 0.42
86 0.32
87 0.27
88 0.22
89 0.2
90 0.17
91 0.2
92 0.23
93 0.25
94 0.26
95 0.29
96 0.29
97 0.26
98 0.25
99 0.23
100 0.26
101 0.27
102 0.25
103 0.22
104 0.19
105 0.19
106 0.18
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.11
111 0.15
112 0.21
113 0.21
114 0.21
115 0.21
116 0.21
117 0.26
118 0.27
119 0.29
120 0.27
121 0.31
122 0.38
123 0.41
124 0.41
125 0.4
126 0.42
127 0.37
128 0.34
129 0.3
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.2
134 0.13
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.14
145 0.17
146 0.21
147 0.2
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.26
152 0.32
153 0.38
154 0.43
155 0.51
156 0.55
157 0.54
158 0.54
159 0.52
160 0.46
161 0.41
162 0.38
163 0.31
164 0.3
165 0.32
166 0.34
167 0.34
168 0.33
169 0.36
170 0.31
171 0.29
172 0.33
173 0.32
174 0.34
175 0.39
176 0.41
177 0.33
178 0.36
179 0.36
180 0.3
181 0.31
182 0.26
183 0.18
184 0.17
185 0.17
186 0.14
187 0.16
188 0.15
189 0.12
190 0.17
191 0.19
192 0.21
193 0.25
194 0.26
195 0.29
196 0.3
197 0.29
198 0.26
199 0.26
200 0.23
201 0.19
202 0.17
203 0.12
204 0.12
205 0.18
206 0.17
207 0.16
208 0.21
209 0.22
210 0.25
211 0.29
212 0.3
213 0.26
214 0.27
215 0.25
216 0.2
217 0.2
218 0.15
219 0.13
220 0.11
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.11
225 0.12
226 0.13
227 0.15
228 0.18
229 0.23
230 0.3
231 0.36
232 0.4
233 0.42
234 0.48
235 0.5
236 0.51
237 0.52
238 0.51
239 0.55
240 0.51
241 0.54
242 0.57
243 0.53
244 0.53
245 0.53
246 0.49
247 0.39
248 0.38
249 0.36
250 0.26
251 0.27
252 0.25
253 0.22
254 0.23
255 0.24
256 0.24
257 0.26
258 0.32
259 0.37
260 0.44
261 0.5
262 0.55
263 0.63
264 0.68
265 0.72
266 0.71
267 0.69
268 0.62
269 0.55
270 0.47
271 0.36
272 0.3
273 0.21
274 0.14
275 0.07
276 0.05
277 0.06
278 0.13
279 0.13
280 0.15
281 0.18
282 0.28
283 0.33
284 0.44
285 0.48
286 0.48
287 0.58
288 0.64
289 0.72
290 0.74
291 0.76
292 0.69
293 0.7
294 0.68
295 0.65
296 0.66
297 0.62
298 0.59
299 0.58
300 0.56
301 0.53
302 0.51
303 0.45
304 0.37
305 0.32
306 0.26