Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

W7MYX4

Protein Details
Accession W7MYX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-347GNYGAKPAVVPRKKKKKRKIVNGGGSREETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
327-337VPRKKKKKRKI
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12, nucl 8.5, mito 2, extr 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004600  TFIIH_Tfb4/GTF2H3  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0005675  C:transcription factor TFIIH holo complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG fvr:FVEG_11534  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03850  Tfb4  
Amino Acid Sequences MDAVDVSEHYEVGTREETPSLLTIVLDTNPRAWASLNNVLPLSRAIANILVFVNAHLAFSNANQVALIAAHVDRAEWLYPTPPTPSRDASGDVAMNDAVAQTQTSANKFPQFAQIEAAVLAAIRKLLDQTKEEDLSATTQISGALTLALCHINKAAQALCAPTANLEDSHKGSSNTAPPTVRGRILVISVSDSEPSQYIPTMNAVFAAGHNQVAIDTLSLTGEPTFLQQACYNTGGTYLAATHPQGLLNYLMFGLIADTEAREALIAPTHDTVDFRAACFCHGRVVDTGFVCSICLSIFCETPENSECFTCGTKLSLGNYGAKPAVVPRKKKKKRKIVNGGGSREETGSATGTPRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.18
4 0.18
5 0.17
6 0.17
7 0.14
8 0.13
9 0.11
10 0.11
11 0.11
12 0.13
13 0.14
14 0.14
15 0.14
16 0.16
17 0.16
18 0.16
19 0.15
20 0.17
21 0.22
22 0.29
23 0.3
24 0.3
25 0.3
26 0.29
27 0.29
28 0.26
29 0.22
30 0.15
31 0.14
32 0.13
33 0.15
34 0.15
35 0.16
36 0.15
37 0.12
38 0.1
39 0.1
40 0.13
41 0.1
42 0.1
43 0.08
44 0.09
45 0.09
46 0.09
47 0.16
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.13
52 0.12
53 0.12
54 0.11
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.11
66 0.12
67 0.14
68 0.18
69 0.21
70 0.23
71 0.27
72 0.29
73 0.29
74 0.3
75 0.32
76 0.29
77 0.27
78 0.25
79 0.21
80 0.18
81 0.16
82 0.13
83 0.1
84 0.08
85 0.05
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.07
90 0.1
91 0.11
92 0.14
93 0.16
94 0.2
95 0.21
96 0.21
97 0.27
98 0.27
99 0.26
100 0.26
101 0.24
102 0.2
103 0.19
104 0.18
105 0.09
106 0.07
107 0.06
108 0.04
109 0.04
110 0.03
111 0.04
112 0.05
113 0.09
114 0.11
115 0.13
116 0.16
117 0.21
118 0.22
119 0.21
120 0.2
121 0.18
122 0.17
123 0.16
124 0.13
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.05
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.13
160 0.15
161 0.19
162 0.19
163 0.2
164 0.18
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.21
169 0.17
170 0.16
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.07
213 0.07
214 0.09
215 0.11
216 0.13
217 0.15
218 0.16
219 0.15
220 0.13
221 0.14
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.1
235 0.08
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.08
253 0.08
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.17
261 0.17
262 0.15
263 0.18
264 0.17
265 0.19
266 0.21
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.22
271 0.21
272 0.23
273 0.25
274 0.23
275 0.23
276 0.18
277 0.18
278 0.15
279 0.13
280 0.11
281 0.06
282 0.07
283 0.08
284 0.1
285 0.11
286 0.12
287 0.16
288 0.16
289 0.21
290 0.23
291 0.24
292 0.23
293 0.23
294 0.22
295 0.21
296 0.22
297 0.18
298 0.16
299 0.15
300 0.17
301 0.2
302 0.22
303 0.25
304 0.26
305 0.31
306 0.31
307 0.32
308 0.29
309 0.26
310 0.24
311 0.25
312 0.34
313 0.35
314 0.45
315 0.53
316 0.64
317 0.75
318 0.86
319 0.9
320 0.9
321 0.93
322 0.95
323 0.95
324 0.95
325 0.95
326 0.94
327 0.89
328 0.82
329 0.73
330 0.63
331 0.52
332 0.42
333 0.32
334 0.24
335 0.19
336 0.15