Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PSS1

Protein Details
Accession A0A1D8PSS1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
493-513PLKSVLKRDRHKPQENTRKLIHydrophilic
743-762SSTQQQQQPQQQQQQSKKESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
156-184KELREAKDREVKISKEKELKQLKELEKKT
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR006594  LisH  
IPR007582  TFIID_NTD2  
IPR037264  TFIID_NTD2_sf  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0031326  P:regulation of cellular biosynthetic process  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG cal:CAALFM_CR04450CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08513  LisH  
PF04494  TFIID_NTD2  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50896  LISH  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd08044  TAF5_NTD2  
cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MVDESKQLQGNKDGDKHQTQESTNTSGNSQPSAPTPAQVPSVQQQQQQKSSTQNQQSTTGSARSSQGRSNQPQYSQADLNRIVLEYLNKKGYHRTEAQLRLESSNIPTPAVPLATPATTELASVNEIGDNKDLKEKLTKAEQELKELRDKQSKIEKELREAKDREVKISKEKELKQLKELEKKTKRESDPEIYFTAYSMLRRWVGSSLDLYKPELSRVLYPLYIHCFLELISKGFSSEAKLFFDKFRSDHLVLHGIEVEKFAGLSLPEHLEENDLAVAYRKYKYRILVSKTSLNLLIYFLHENEAVGGGILIRIINQYLDPVISTNRPDKIDQEGEANPEEGISEYVTDTNEVKKFNEQNVKLGKLPIDPDVAKEVEAELKIKDEKIEPVNNKTLTKEFQDMTKPDQDSPVRESLPLPLKDANDIKKMIIQVEDSRSKIKLGAIQASLPSVCMYTFHNTNNNMTCIEFNDDSTLVAAGFQDSYIKLWSLDGKPLKSVLKRDRHKPQENTRKLIGHSGPVYGVSFSPDNKYLLSCSEDKTVRLWSLDTYTALVSYKGHTQPVWDVKFSPLGHYFVTASHDQTARLWATDHIYPLRIFAGHINDVDCVEFHPNSNYVFTGSSDKTCRMWDVHTGNCVRVFLGHTNSVNCLAVSPDGRWLASGGEDGIICVWDIGSGRRLKSMRGHARASLYSLAFSRDGTVLVSGCADNSVRVWDVKKNTNDAGPEPEAFNNNVNGNETNSDGASSTQQQQQPQQQQQQSKKESIATSDHMNAFFTKKTPVYKVHFTRRNLCLAAGAFQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.54
3 0.53
4 0.52
5 0.53
6 0.47
7 0.49
8 0.49
9 0.47
10 0.44
11 0.42
12 0.37
13 0.35
14 0.35
15 0.3
16 0.27
17 0.23
18 0.23
19 0.29
20 0.27
21 0.24
22 0.24
23 0.25
24 0.27
25 0.26
26 0.27
27 0.27
28 0.36
29 0.39
30 0.42
31 0.48
32 0.52
33 0.59
34 0.58
35 0.56
36 0.55
37 0.6
38 0.64
39 0.64
40 0.63
41 0.58
42 0.6
43 0.58
44 0.53
45 0.48
46 0.41
47 0.33
48 0.29
49 0.3
50 0.31
51 0.33
52 0.34
53 0.39
54 0.45
55 0.52
56 0.58
57 0.59
58 0.56
59 0.6
60 0.59
61 0.56
62 0.52
63 0.47
64 0.46
65 0.42
66 0.42
67 0.35
68 0.31
69 0.25
70 0.22
71 0.26
72 0.22
73 0.26
74 0.29
75 0.29
76 0.3
77 0.38
78 0.42
79 0.43
80 0.45
81 0.47
82 0.51
83 0.58
84 0.62
85 0.6
86 0.57
87 0.51
88 0.47
89 0.41
90 0.36
91 0.34
92 0.29
93 0.24
94 0.21
95 0.21
96 0.22
97 0.21
98 0.16
99 0.12
100 0.14
101 0.13
102 0.14
103 0.13
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.1
109 0.11
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.21
119 0.21
120 0.21
121 0.28
122 0.29
123 0.31
124 0.39
125 0.42
126 0.42
127 0.51
128 0.5
129 0.51
130 0.54
131 0.52
132 0.52
133 0.52
134 0.52
135 0.51
136 0.51
137 0.5
138 0.55
139 0.57
140 0.56
141 0.61
142 0.57
143 0.57
144 0.67
145 0.64
146 0.63
147 0.6
148 0.58
149 0.58
150 0.56
151 0.55
152 0.51
153 0.5
154 0.5
155 0.55
156 0.56
157 0.55
158 0.59
159 0.61
160 0.64
161 0.64
162 0.6
163 0.64
164 0.64
165 0.65
166 0.67
167 0.68
168 0.68
169 0.72
170 0.74
171 0.74
172 0.69
173 0.67
174 0.69
175 0.67
176 0.64
177 0.6
178 0.53
179 0.45
180 0.41
181 0.34
182 0.28
183 0.2
184 0.15
185 0.14
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.17
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.23
197 0.24
198 0.24
199 0.23
200 0.23
201 0.22
202 0.19
203 0.18
204 0.19
205 0.2
206 0.18
207 0.18
208 0.2
209 0.23
210 0.23
211 0.2
212 0.18
213 0.16
214 0.15
215 0.2
216 0.18
217 0.14
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.15
225 0.16
226 0.18
227 0.2
228 0.21
229 0.22
230 0.26
231 0.24
232 0.21
233 0.24
234 0.28
235 0.28
236 0.29
237 0.3
238 0.33
239 0.3
240 0.3
241 0.27
242 0.2
243 0.19
244 0.17
245 0.14
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.1
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.12
267 0.14
268 0.17
269 0.21
270 0.25
271 0.32
272 0.39
273 0.43
274 0.48
275 0.49
276 0.52
277 0.49
278 0.46
279 0.38
280 0.31
281 0.25
282 0.18
283 0.15
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.08
292 0.06
293 0.05
294 0.05
295 0.03
296 0.04
297 0.04
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.07
310 0.08
311 0.1
312 0.13
313 0.17
314 0.19
315 0.19
316 0.2
317 0.25
318 0.26
319 0.24
320 0.25
321 0.22
322 0.23
323 0.22
324 0.21
325 0.14
326 0.12
327 0.11
328 0.08
329 0.07
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.11
338 0.13
339 0.13
340 0.14
341 0.19
342 0.22
343 0.28
344 0.36
345 0.33
346 0.37
347 0.41
348 0.42
349 0.37
350 0.35
351 0.3
352 0.23
353 0.23
354 0.18
355 0.17
356 0.15
357 0.15
358 0.17
359 0.16
360 0.14
361 0.13
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.07
367 0.09
368 0.09
369 0.1
370 0.1
371 0.09
372 0.13
373 0.16
374 0.23
375 0.23
376 0.27
377 0.33
378 0.33
379 0.33
380 0.31
381 0.28
382 0.24
383 0.24
384 0.23
385 0.18
386 0.19
387 0.23
388 0.23
389 0.25
390 0.28
391 0.27
392 0.24
393 0.29
394 0.27
395 0.25
396 0.28
397 0.28
398 0.22
399 0.22
400 0.22
401 0.22
402 0.28
403 0.26
404 0.24
405 0.23
406 0.23
407 0.26
408 0.3
409 0.27
410 0.23
411 0.23
412 0.21
413 0.21
414 0.21
415 0.19
416 0.16
417 0.14
418 0.14
419 0.19
420 0.21
421 0.2
422 0.21
423 0.2
424 0.2
425 0.19
426 0.18
427 0.16
428 0.16
429 0.19
430 0.18
431 0.19
432 0.18
433 0.18
434 0.16
435 0.12
436 0.1
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.07
441 0.1
442 0.13
443 0.14
444 0.19
445 0.2
446 0.24
447 0.25
448 0.24
449 0.21
450 0.19
451 0.18
452 0.14
453 0.17
454 0.14
455 0.12
456 0.13
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.1
461 0.06
462 0.06
463 0.06
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.06
473 0.07
474 0.12
475 0.12
476 0.19
477 0.22
478 0.22
479 0.22
480 0.25
481 0.29
482 0.27
483 0.35
484 0.37
485 0.44
486 0.49
487 0.57
488 0.64
489 0.71
490 0.77
491 0.78
492 0.79
493 0.8
494 0.82
495 0.78
496 0.72
497 0.64
498 0.56
499 0.54
500 0.44
501 0.37
502 0.31
503 0.27
504 0.23
505 0.2
506 0.2
507 0.13
508 0.12
509 0.1
510 0.1
511 0.1
512 0.13
513 0.14
514 0.14
515 0.14
516 0.15
517 0.13
518 0.14
519 0.17
520 0.16
521 0.16
522 0.21
523 0.22
524 0.22
525 0.23
526 0.24
527 0.22
528 0.21
529 0.19
530 0.15
531 0.16
532 0.17
533 0.16
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.12
538 0.11
539 0.09
540 0.09
541 0.15
542 0.16
543 0.17
544 0.16
545 0.18
546 0.25
547 0.33
548 0.34
549 0.29
550 0.28
551 0.28
552 0.35
553 0.33
554 0.31
555 0.24
556 0.24
557 0.23
558 0.23
559 0.22
560 0.16
561 0.2
562 0.17
563 0.15
564 0.17
565 0.17
566 0.16
567 0.17
568 0.2
569 0.17
570 0.16
571 0.16
572 0.13
573 0.16
574 0.17
575 0.19
576 0.16
577 0.18
578 0.17
579 0.17
580 0.17
581 0.14
582 0.13
583 0.14
584 0.17
585 0.17
586 0.18
587 0.18
588 0.17
589 0.17
590 0.17
591 0.13
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.11
596 0.14
597 0.15
598 0.16
599 0.17
600 0.16
601 0.14
602 0.14
603 0.15
604 0.18
605 0.18
606 0.21
607 0.23
608 0.24
609 0.24
610 0.25
611 0.26
612 0.22
613 0.23
614 0.28
615 0.31
616 0.32
617 0.37
618 0.37
619 0.37
620 0.36
621 0.33
622 0.24
623 0.21
624 0.21
625 0.18
626 0.21
627 0.24
628 0.24
629 0.25
630 0.27
631 0.27
632 0.24
633 0.19
634 0.15
635 0.12
636 0.13
637 0.14
638 0.13
639 0.16
640 0.16
641 0.16
642 0.16
643 0.16
644 0.14
645 0.13
646 0.13
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.08
659 0.14
660 0.18
661 0.19
662 0.26
663 0.27
664 0.29
665 0.37
666 0.46
667 0.5
668 0.53
669 0.55
670 0.52
671 0.57
672 0.54
673 0.49
674 0.43
675 0.33
676 0.28
677 0.25
678 0.24
679 0.19
680 0.19
681 0.17
682 0.13
683 0.13
684 0.12
685 0.13
686 0.11
687 0.1
688 0.12
689 0.09
690 0.09
691 0.1
692 0.1
693 0.09
694 0.09
695 0.12
696 0.12
697 0.15
698 0.17
699 0.23
700 0.29
701 0.38
702 0.42
703 0.44
704 0.45
705 0.47
706 0.48
707 0.43
708 0.44
709 0.38
710 0.35
711 0.32
712 0.31
713 0.3
714 0.29
715 0.28
716 0.24
717 0.23
718 0.23
719 0.24
720 0.22
721 0.22
722 0.22
723 0.21
724 0.19
725 0.17
726 0.16
727 0.13
728 0.14
729 0.15
730 0.17
731 0.21
732 0.26
733 0.3
734 0.34
735 0.41
736 0.5
737 0.56
738 0.62
739 0.67
740 0.68
741 0.75
742 0.8
743 0.82
744 0.78
745 0.73
746 0.67
747 0.63
748 0.57
749 0.52
750 0.48
751 0.41
752 0.4
753 0.42
754 0.41
755 0.35
756 0.35
757 0.32
758 0.29
759 0.28
760 0.24
761 0.24
762 0.26
763 0.32
764 0.37
765 0.43
766 0.48
767 0.57
768 0.65
769 0.7
770 0.74
771 0.74
772 0.77
773 0.73
774 0.73
775 0.64
776 0.54
777 0.49
778 0.42